Baza danych wartości C DNA roślin
Baza danych wartości C DNA roślin ( https://cvalues.science.kew.org/ ) to kompleksowy katalog danych dotyczących wartości C ( zawartość jądrowego DNA lub w diploidach , wielkość genomu ) dla roślin lądowych i glonów . Baza danych została stworzona przez prof. Michaela D. Bennetta i dr Ilię J. Leitcha z Królewskich Ogrodów Botanicznych w Kew w Wielkiej Brytanii . Baza danych została pierwotnie uruchomiona jako „Baza danych wartości C DNA okrytonasiennych” w kwietniu 1997 r., zasadniczo jako internetowa wersja list zebranych danych, publikowanych przez prof. Bennetta i współpracowników od lat 70. XX wieku. Wersja 1.0 bardziej kompleksowej bazy danych Plant DNA C-values Database została uruchomiona w 2001 r., kolejne wydania 2.0 w styczniu 2003 r. i 3.0 w grudniu 2004 r. Oprócz zbioru danych o okrytozalążkowych udostępnionego w 1997 r. baza danych była kilkakrotnie rozszerzana taksonomicznie i obecnie obejmuje dane dotyczące pteridofitów (od 2000 r.) i nagonasiennych (od 2001 r.), mszaki (od 2001 r.) i glony (od 2004 r.) ( historia aktualizacji patrz (1) ). (Należy pamiętać, że każda z tych baz danych podzbiorów jest cytowana indywidualnie, ponieważ mogą zawierać różne zbiory autorów).
Najnowsza wersja bazy danych (wersja 7.1) została udostępniona w kwietniu 2019 r. Zawiera dane dla 12 273 gatunków roślin, w tym 10 770 okrytozalążkowych, 421 nagonasiennych, 303 paprotników (246 paproci i pokrewnych paproci oraz 57 likofitów), 334 mszaków i 445 glony.
Podobna baza danych o wielkości genomu zwierzęcego została utworzona w 2001 roku przez dr T. Ryana Gregory'ego z Uniwersytetu Guelph w Kanadzie .
- Bennett, MD i JB Smith. 1976. Ilości jądrowego DNA u okrytozalążkowych. Transakcje filozoficzne Towarzystwa Królewskiego w Londynie B 274: 227–274.
- Bennett, MD i JB Smith. 1991. Ilości jądrowego DNA u okrytozalążkowych. Transakcje filozoficzne Royal Society of London B 334: 309–345.
- Bennett, MD i IJ Leitch. 1995. Ilość jądrowego DNA u okrytozalążkowych. Annals of Botaniki 76: 113–176.
- Bennett, MD i IJ Leitch. 1997. Ilość jądrowego DNA u roślin okrytozalążkowych — 583 nowe szacunki. Annals of Botaniki 80: 169–196.
- Bennett, MD, P. Bhandol i IJ Leitch. 2000. Ilości jądrowego DNA u okrytozalążkowych i ich współczesne zastosowania - 807 nowych szacunków. Roczniki botaniki 86: 859–909.
- Bennett, MD i IJ Leitch. 2005. Ilość jądrowego DNA u okrytonasiennych — postęp, problemy i perspektywy. Annals of Botaniki 95: 45–90.
- Bennett, MD i IJ Leitch. 2005. Ewolucja wielkości genomu u roślin. W The Evolution of the Genome , pod redakcją TR Gregory. San Diego: Elsevier. Strony 89–162.
- Gregory, TR 2005. Zagadka wartości C u roślin i zwierząt: przegląd podobieństw i apel o partnerstwo. Annals of Botaniki 95: 133–146.
- Leitch, IJ, DE Soltis, PS Soltis i MD Bennett. 2005. Ewolucja ilości DNA u roślin lądowych (Embryophyta). Annals of Botaniki 95: 207–217.
- Murray, BG 1998. Ilości jądrowego DNA u roślin nagonasiennych. Annals of Botany 82 (dodatek A): 3–15.
- Garcia S, Leitch IJ, Anadon-Rosell A, Canela MÁ, Gálvez F, Garnatje T, Gras A, Hidalgo O, Johnston E, Mas de Xaxars G i in. 2014. Ostatnie aktualizacje i zmiany w bazach danych dotyczących wielkości genomu roślin. Badania nad kwasami nukleinowymi 42(D1): D1159-D1166.
- Leitch IJ, Johnston E, Pellicer J, Hidalgo O, Bennett MD 2019. Baza danych wartości C DNA roślin (wersja 7.1, kwiecień 2019). [1]