baza modów

baza modów
Database.png
Treść
Opis Baza danych porównawczych modeli struktury białek
Kontakt
Centrum Badań Uniwersytet Kalifornijski w San Francisco
Laboratorium Katedra Bioinżynierii i Nauk Terapeutycznych
Autorski Ursula Pieper, Eswar Narayanan, Ben Webb, Andrej Sali
Cytowanie podstawowe Pieper & wsp. (2011)
Data wydania 1998
Dostęp
Strona internetowa http://salilab.org/modbase
Pobierz URL ftp://salilab.org/databases/modbase
Adres URL usługi internetowej http://salilab.org/modweb

ModBase to baza danych porównawczych modeli struktury białek z adnotacjami , zawierająca modele dla ponad 3,8 miliona unikalnych sekwencji białek. Modele są tworzone przez modelowania porównawczego ModPipe, który opiera się na programie MODELLER .

ModBase jest rozwijany w laboratorium Andreja Sali na UCSF . Modele ModBase są również dostępne za pośrednictwem portalu Protein Model Portal.

Zobacz też

  1. ^ a b Pieper, Urszula; Webb Benjamin M; Barkan Dawid T; Schneidman-Duhovny Dina; Schlessinger Avner; Braberga Hannesa; Yang Zheng; Meng Elaine C; Pettersen Eric F; Huang Conrad C; Datta Ruchira S; Sampathkumar Parthasarathy; Madhusudhan Mallur S; Sjölander Kimmen; Ferrin Thomas E.; Burley Stephen K.; Sali Andrej (styczeń 2011). „ModBase, baza danych porównawczych modeli struktury białek z adnotacjami i powiązanych zasobów” . Kwasy nukleinowe Res . Anglia. 39 (Wydanie bazy danych): D465-74. doi : 10.1093/nar/gkq1091 . PKW    3013688 . PMID 21097780 .

Linki zewnętrzne