baza modów
Treść | |
---|---|
Opis | Baza danych porównawczych modeli struktury białek |
Kontakt | |
Centrum Badań | Uniwersytet Kalifornijski w San Francisco |
Laboratorium | Katedra Bioinżynierii i Nauk Terapeutycznych |
Autorski | Ursula Pieper, Eswar Narayanan, Ben Webb, Andrej Sali |
Cytowanie podstawowe | Pieper & wsp. (2011) |
Data wydania | 1998 |
Dostęp | |
Strona internetowa | http://salilab.org/modbase |
Pobierz URL | ftp://salilab.org/databases/modbase |
Adres URL usługi internetowej | http://salilab.org/modweb |
ModBase to baza danych porównawczych modeli struktury białek z adnotacjami , zawierająca modele dla ponad 3,8 miliona unikalnych sekwencji białek. Modele są tworzone przez modelowania porównawczego ModPipe, który opiera się na programie MODELLER .
ModBase jest rozwijany w laboratorium Andreja Sali na UCSF . Modele ModBase są również dostępne za pośrednictwem portalu Protein Model Portal.
Zobacz też
- ^ a b Pieper, Urszula; Webb Benjamin M; Barkan Dawid T; Schneidman-Duhovny Dina; Schlessinger Avner; Braberga Hannesa; Yang Zheng; Meng Elaine C; Pettersen Eric F; Huang Conrad C; Datta Ruchira S; Sampathkumar Parthasarathy; Madhusudhan Mallur S; Sjölander Kimmen; Ferrin Thomas E.; Burley Stephen K.; Sali Andrej (styczeń 2011). „ModBase, baza danych porównawczych modeli struktury białek z adnotacjami i powiązanych zasobów” . Kwasy nukleinowe Res . Anglia. 39 (Wydanie bazy danych): D465-74. doi : 10.1093/nar/gkq1091 . PKW 3013688 . PMID 21097780 .
Linki zewnętrzne