Blast2GO
Typ | Oprogramowanie bioinformatyczne |
---|---|
Początek | 2011 |
Producent | BioBam Bioinformatyka |
Wykonane modele | Demo, Basic, Trial, Pro, Plugin, Commandline |
Strona internetowa | https://www.blast2go.com |
Blast2GO , opublikowane po raz pierwszy w 2005 r., jest bioinformatycznym narzędziem programowym do automatycznego, wysokowydajnego funkcjonalnego opisywania nowych danych sekwencyjnych ( geny , białka ). Wykorzystuje BLAST do identyfikacji podobnych sekwencji, a następnie przenosi istniejące adnotacje funkcjonalne z jeszcze scharakteryzowanych sekwencji do nowej. Informacje funkcjonalne są reprezentowane przez Gene Ontology (GO), kontrolowany słownik atrybutów funkcjonalnych. Gene Ontology , czyli GO , to główna inicjatywa bioinformatyczna mająca na celu ujednolicenie reprezentacji atrybutów genów i produktów genów u wszystkich gatunków .
Zobacz też
Linki zewnętrzne
- Oficjalna strona Blast2GO - Narzędzie do funkcjonalnej adnotacji (nowych) sekwencji i analizy danych adnotacji.
- Firma rozwijająca Blast2GO — BioBam Bioinformatics SL, firma bioinformatyczna zajmująca się tworzeniem przyjaznego dla użytkownika oprogramowania dla społeczności naukowej, rozwija, utrzymuje i dystrybuuje Blast2GO.
- Narzędzia ontologii genów — Zapewnia dostęp do ontologii, narzędzi oprogramowania, list produktów genów z adnotacjami oraz dokumentów referencyjnych opisujących GO i jego zastosowania.
- PlantRegMap — adnotacja Plant GO dla 165 gatunków i analiza wzbogacania GO