Blast2GO

Blast2GO
Typ Oprogramowanie bioinformatyczne
Początek 2011 ( 2011 )
Producent BioBam Bioinformatyka
Wykonane modele Demo, Basic, Trial, Pro, Plugin, Commandline
Strona internetowa https://www.blast2go.com

Blast2GO , opublikowane po raz pierwszy w 2005 r., jest bioinformatycznym narzędziem programowym do automatycznego, wysokowydajnego funkcjonalnego opisywania nowych danych sekwencyjnych ( geny , białka ). Wykorzystuje BLAST do identyfikacji podobnych sekwencji, a następnie przenosi istniejące adnotacje funkcjonalne z jeszcze scharakteryzowanych sekwencji do nowej. Informacje funkcjonalne są reprezentowane przez Gene Ontology (GO), kontrolowany słownik atrybutów funkcjonalnych. Gene Ontology , czyli GO , to główna inicjatywa bioinformatyczna mająca na celu ujednolicenie reprezentacji atrybutów genów i produktów genów u wszystkich gatunków .

Zobacz też

Linki zewnętrzne

  • Oficjalna strona Blast2GO - Narzędzie do funkcjonalnej adnotacji (nowych) sekwencji i analizy danych adnotacji.
  • Firma rozwijająca Blast2GO — BioBam Bioinformatics SL, firma bioinformatyczna zajmująca się tworzeniem przyjaznego dla użytkownika oprogramowania dla społeczności naukowej, rozwija, utrzymuje i dystrybuuje Blast2GO.
  • Narzędzia ontologii genów — Zapewnia dostęp do ontologii, narzędzi oprogramowania, list produktów genów z adnotacjami oraz dokumentów referencyjnych opisujących GO i jego zastosowania.
  • PlantRegMap — adnotacja Plant GO dla 165 gatunków i analiza wzbogacania GO