Lista tematów omicznych w biologii

Zainspirowane terminami genom i genomika , ukuto inne słowa opisujące kompletne -omika zestawy danych biologicznych , głównie zestawy biomolekuł pochodzących z jednego organizmu , z przyrostkiem -ome i . Niektóre z tych terminów są ze sobą powiązane w hierarchiczny . Na przykład genom zawiera ORFeome , z którego powstaje transkryptom , który jest tłumaczony na proteom . Inne terminy nakładają się na siebie i odnoszą się do struktury i/lub funkcji podzbioru białek (np. glikomu , kinomu ).

Omika to naukowiec, który bada omiomikę, katalogując wszystkie poddziedziny „omiki”.

Omics.org to wiki, która gromadzi i alfabetycznie wymienia wszystkie znane „omiki” i „omiki”.

Lista tematów

-ome
Kierunek studiów (-omika) 		Kolekcja Podmiot nadrzędny Notatki
alergenom Alergenomika Proteomika alergenów
Bibliome Bibliomika Naukowe dane bibliograficzne
Trialome Medycyna Dane z badań interwencyjnych na ludziach z rejestrów badań klinicznych rozszerzone o wyniki badań i linki do publikacji
konektom konektomika Strukturalna i funkcjonalna łączność mózgu w różnych skalach czasoprzestrzennych Neuronauka
Cytom Cytomika Układy komórkowe organizmu Cytologia
Edycja miejsca edycji RNA
zarodek embriomika Linie komórkowe komórek embrionalnych, ekspresja genów i antygeny obecne podczas rozwoju Embriologia
Środowisko Środowisko Czynniki środowiskowe związane z genami (środowisko)
Epigenom Epigenomika Modyfikacje epigenetyczne Genetyka molekularna Epigenomika to badanie pełnego zestawu modyfikacji epigenetycznych w materiale genetycznym komórki, zwanych łącznie epigenomem
Exposome (2005) Eksposomika Narażenia środowiskowe danej osoby , w tym w środowisku prenatalnym Genetyka molekularna Proponowany termin i dziedzina badań nad chorobotwórczymi skutkami czynników środowiskowych (komponent „ wychowanie ” w „ natura kontra wychowanie ”).
Exposome (2009) Złożone narażenia zawodowe i problemy zdrowotne w miejscu pracy Bezpieczeństwo i higiena pracy Proponenci tego terminu byli świadomi poprzedniego terminu użytego powyżej, ale zaproponowali zastosowanie tego terminu do nowej dziedziny.
egzom egzomika Egzony w genomie Genetyka molekularna
Foodome Foodomika żywności i żywienia związane z bioaktywnością, jakością, bezpieczeństwem i identyfikowalnością żywności poprzez zastosowanie i integrację zaawansowanych technologii omicznych w celu poprawy samopoczucia, zdrowia i pewności siebie konsumentów. Odżywianie Termin ten został po raz pierwszy zdefiniowany w 2009 roku
Genom
Genomika ( genetyka klasyczna )
Geny ( Sekwencje DNA / Chromosomy ) 		Genetyka „Genom” odnosi się do zestawu wszystkich genów w organizmie. Jednak „genom” został wymyślony dziesiątki lat przed odkryciem, że większość DNA jest „ niekodująca ” i nie jest częścią genu; tak więc „genom” pierwotnie odnosił się do całego zbioru DNA w organizmie. Obecnie używane są obie definicje, w zależności od kontekstu.
Glycome Glikomiki glikany glikobiologia
hologenom Hologenomika Genomy członków społeczności (tj. holobiontów ) Metagenomika
Humeome Humeomika Chemiczne składniki próchnicy glebowej Gleboznawstwo
Interferom Interferomika interferony Immunologia Również baza danych o tej samej nazwie.
Interaktom Interaktomika Wszystkie interakcje Termin „interaktomika” na ogół nie jest używany. Zamiast tego interaktomy są uważane za naukę biologii systemów .
Ionom jonomika Biomolekuły nieorganiczne Biologia molekularna
Kino kinomika kinazy Biologia molekularna Białka, które dodają grupę fosforanową
lipidom Lipidomika lipidy Biochemia
Mechanom Mechanika Układy mechaniczne w organizmie
Metabolom Metabolomika Metabolity Wszystkie produkty reakcji biologicznej (w tym półprodukty)
Metagenom Metagenomika Materiał genetyczny znaleziony w próbce środowiskowej Biologia molekularna Zakłada się, że materiał genetyczny zawiera DNA z wielu organizmów, a zatem z wielu genomów, stąd włączenie przedrostka meta- .
metalom Metalomika Metale i metaloidy
Mikrobiom mikrobiomika Zbiór mikroorganizmów w innym organizmie, takim jak zwierzę Mikrobiologia
Obesidome Obesidomika Białka związane z otyłością Proteomika Ukuty przez Pardo i in., 2012.
ORFeome ORFeomika Otwarte ramki odczytu (ORF) Genetyka molekularna
Organizm Organomika Interakcje narządów Sygnalizacja komórkowa / sygnalizacja komórkowa i inżynieria tkankowa Badanie przesłuchów między narządami przy użyciu fizjologicznie istotnych modeli in vitro
Parwom Parwomika Metabolity wtórne Biochemia Ukuty przez Marka Martina i wprowadzony przez Juliana Daviesa w 2008 r., Odnoszący się do łacińskiego parvus oznaczającego „mały” i opisujący „ogromny mikrobiologiczny świat małych (wydzielanych) cząsteczek o dużej różnorodności strukturalnej”. Zobacz też
Farmakogenetyka Farmakogenetyka SNP i ich wpływ na farmakokinetykę i farmakodynamikę
Farmakogenomika Genomika
Farmakogenom Farmakogenomika Wpływ zmian w genomie na farmakologię
Farmakogenetyka Genomika
fenomen Fenomika Fenotypy Genetyka
Fizjom Fizjomika Fizjologia organizmu
Fitochemom Fitochemia Fitochemikalia Termin ten został ukuty przez del Castillo i in., 2013, Food Research International, [1] . Fitochemika to kompleksowa koncepcja mająca na celu zwiększenie wiedzy na temat bioaktywności fitochemikaliów, które mają coraz większe znaczenie w naukach rolniczych, spożywczych, medycznych i kosmetycznych
Proteom Proteomika Białka Biologia molekularna
Regulom Regulomika Czynniki transkrypcyjne i inne cząsteczki zaangażowane w regulację ekspresji genów Biologia molekularna
naukowy Obszary badawcze objęte indywidualnym badaczem lub instytucją Badania Ukuty przez Ivana Erilla na spotkaniu EBM w 2011 roku
Sekret Sekretomika Wydzielane białka Proteomika Podzbiór proteomu składający się z białek aktywnie eksportowanych z komórek.
Speechhome Speechomika Wpływy na przyswajanie języka Ukuty przez Human Speechome Project
Syntetom Zestaw sztucznych genów w organizmie [ okólnik ]
transkryptomu Transkryptomika Wszystkie cząsteczki RNA, w tym mRNA , rRNA , tRNA i inne ncRNA Biologia molekularna
Toponom toponomika Budowa komórki i tkanki Biologia molekularna
lotny Volatilomika pełny zbiór lotnych metabolitów Biomarkery

Hierarchia tematów

Dla przejrzystości niektóre tematy są wymienione więcej niż jeden raz.

Pobrano z „ https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=List_of_omics_topics_in_biology&oldid=1103033081 ”