C7orf31
| C7orf31 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identyfikatory | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| , chromosom 7 otwarta ramka odczytu 31 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Identyfikatory zewnętrzne | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikidane | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Otwarta ramka odczytu 31 chromosomu 7 ( C7orf31 ) jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen C7orf31 na chromosomie 7 .
Gen/Locus
U ludzi gen C7orf31 znajduje się w locus 7p15.3 i rozciąga się między pozycją 25174316 a 25219817 (rozpiętość 45502 pz). Koduje co najmniej 4 unikalne ludzkie izoformy: izoformę pierwotną (590 aa; oznaczaną również jako X1, X2 i CRA_c), izoformę X4 (346 aa), izoformę CRA_a (580 aa) i izoformę CRA_b (380 aa).
Transkrypcja
U ludzi C7orf31 koduje nić mRNA o długości 3609 par zasad. Ludzki mRNA składa się z nieulegającego translacji regionu 5' , który ma 561 zasad i nieulegającego translacji regionu 3' , który ma długość 1275 zasad.
Białko
Pierwotne białko kodowane przez C7orf31 u ludzi ma długość 590 aminokwasów i masę cząsteczkową 38334 Da. Białko jest częścią funkcjonalnie niescharakteryzowanej rodziny białek (pfam15093) z domeną o nieznanej funkcji (DUF4555).
Ortologia białek
Białko C7orf31 jest dobrze konserwowane u ssaków i ptaków , ale jest mniej konserwowane w bardziej odległych organizmach.
C7orf31 nie ma żadnych paralogów u ludzi.
Wyrażenie
Przewiduje się, że u ludzi C7orf31 będzie zlokalizowany w cytozolu , jądrze , mitochondrium i peroksysomie i ulega ekspresji w prawie wszystkich tkankach. Jest silnie wyrażany zwłaszcza w jądrach.
Interakcja
Badania dwóch hybryd wykazały interakcje między białkami kodowanymi przez A8K5H9 i C7orf31,
a inne badanie wykazało, że białko wchodzi w interakcję z KBTBD5.
Badanie przeprowadzone w 2014 roku wykazało, że C7orf31 jest kandydatem na białko związane z centrosomem , przy użyciu spektrometrii mas na centriolach plemników ssaków. Białko pojawia się w badaniu wraz z siedmioma innymi kandydatami na białka związane z centrosomem. Wraz z 2241 innymi białkami C7orf31 wykazywał również znaczące wiązanie w eksperymencie mikromacierzy z β-amyloidami, grupą białek związanych z chorobą Alzheimera . Wreszcie, w badaniu sieci interakcji białko-białko, stwierdzono, że C7orf31 wiąże się z KLHL40, którego dokładna funkcja również nie jest znana.
Linki zewnętrzne
- Lokalizacja ludzkiego genomu C7orf31 i strona szczegółów genu C7orf31 w przeglądarce genomu UCSC .