COPE (gen)

RADZIĆ SOBIE
Dostępne konstrukcje
WPB	Wyszukiwanie ortologów:
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, epsilon-COP, podjednostka kompleksu białkowego płaszcza epsilon, podjednostka kompleksu płaszcza COPI epsilon
Identyfikatory zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek )
Chr.
Koniec
Lokalizacja genu ( mysz )
Chr.
Koniec
Wzór ekspresji RNA
Ontologia genów
Funkcja molekularna
Komponent komórkowy
Proces biologiczny
	Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi
	Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka	Wyświetl/edytuj mysz

Coatomer podjednostka epsilon jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen COPE .

Funkcjonować

Produktem tego genu jest podjednostka epsilon kompleksu białek powłokowych. Coamer jest cytozolowym kompleksem białkowym, który wiąże się z motywami dilizyny i odwracalnie łączy się z pęcherzykami Golgiego niepokrytymi klatryną. Jest wymagany do pączkowania z błon Golgiego i jest niezbędny do wstecznego transportu Golgiego do ER białek znakowanych dilizyną. Kompleks powłokowy składa się przynajmniej z podjednostek alfa, beta, beta', gamma, delta, epsilon i zeta. Zidentyfikowano alternatywne warianty transkryptu kodujące różne izoformy.

Interakcje

Wykazano, że COPE (gen) oddziałuje z COPA .

Linki zewnętrzne

Lokalizacja ludzkiego genomu COPE i strona szczegółów genu COPE w przeglądarce genomu UCSC .

Dalsza lektura

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: prosta metoda zastąpienia struktury czapeczki eukariotycznych mRNA oligorybonukleotydami”. gen . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
Orcl L, Palmer DJ, Amherdt M, Rothman JE (1993). „Zespół powlekanych pęcherzyków w aparacie Golgiego wymaga jedynie białek płaszcza i ARF z cytosolu”. Natura . 364 (6439): 732–4. Bibcode : 1993Natur.364..732O . doi : 10.1038/364732a0 . PMID 8355790 . S2CID 4348442 .
Faulstich D, Auerbach S, Orci L, Ravazzola M, Wegchingel S, Lottspeich F, Stenbeck G, Harter C, Wieland FT, Tschochner H (1996). „Architektura płaszcza: charakterystyka molekularna interakcji delta-COP i białek w obrębie kompleksu” . J. Cell Biol . 135 (1): 53–61. doi : 10.1083/jcb.135.1.53 . PMC 2121028 . PMID 8858162 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). „Konstrukcja i charakterystyka biblioteki cDNA wzbogaconej o pełnej długości i wzbogaconej o koniec 5'”. gen . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
Pavel J, Harter C, Wieland FT (1998). „Odwracalna dysocjacja powłokomeru: funkcjonalna charakterystyka podkompleksu białek płaszcza beta / delta” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 95 (5): 2140-5. Bibcode : 1998PNAS...95.2140P . doi : 10.1073/pnas.95.5.2140 . PMC 19276 . PMID 9482852 .
de La Vega LA, Stockert RJ (1999). „Koatomer cytoplazmatyczny białko COPI. Potencjalny regulator translacji” . J. Biol. chemia . 274 (44): 31135–8. doi : 10.1074/jbc.274.44.31135 . PMID 10531302 .
Eugster A, Frigerio G, Dale M, Duden R (2000). „Domeny COP I wymagane do integralności płaszcza i nowe interakcje z ARF i ARF-GAP” . EMBO J. 19 (15): 3905–17. doi : 10.1093/emboj/19.15.3905 . PMC 306616 . PMID 10921873 .
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2000). „Klonowanie DNA przy użyciu rekombinacji specyficznej dla miejsca in vitro” . Genom Res . 10 (11): 1788–95. doi : 10.1101/gr.143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 .
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (2001). „W kierunku katalogu ludzkich genów i białek: sekwencjonowanie i analiza 500 nowych kompletnych białek kodujących ludzkie cDNA” . Genom Res . 11 (3): 422–35. doi : 10.1101/gr.GR1547R . PMC 311072 . PMID 11230166 .
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (2000). „Systematyczna lokalizacja subkomórkowa nowych białek zidentyfikowanych przez sekwencjonowanie cDNA na dużą skalę” . Przedstawiciel EMBO 1 (3): 287–92. doi : 10.1093/embo-reports/kvd058 . PMC 1083732 . PMID 11256614 .
Zhang T, Hong W (2001). „Ykt6 tworzy kompleks SNARE z syntaksyną 5, GS28 i Bet1 i uczestniczy w późnym etapie transportu retikulum endoplazmatycznego aparatu Golgiego” . J. Biol. chemia . 276 (29): 27480-7. doi : 10.1074/jbc.M102786200 . PMID 11323436 .
Xu Y, Martin S, James DE, Hong W (2002). „GS15 tworzy kompleks SNARE z syntaksyną 5, GS28 i Ykt6 i bierze udział w ruchu we wczesnych cysternach aparatu Golgiego” . Mol. Biol. komórka . 13 (10): 3493–507. doi : 10.1091/mbc.E02-01-0004 . PMC 129961 . PMID 12388752 .
Gevaert K, Goethals M, Martens L, Van Damme J, Staes A, Thomas GR, Vandekerckhove J (2003). „Eksploracja proteomów i analiza przetwarzania białek za pomocą identyfikacji spektrometrii mas posortowanych peptydów N-końcowych”. Nat. Biotechnologia . 21 (5): 566-9. doi : 10.1038/nbt810 . PMID 12665801 . S2CID 23783563 .
Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (2004). „Od ORFeome do biologii: funkcjonalny rurociąg genomiki” . Genom Res . 14 (10B): 2136–44. doi : 10.1101/gr.2576704 . PMC 528930 . PMID 15489336 .
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). „W kierunku mapy w skali proteomu sieci interakcji białko-białko człowieka”. Natura . 437 (7062): 1173-8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/natura04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .