CTDP1
Dostępne konstrukcje
WPB Wyszukiwanie ortologów:
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
, CCFDN, FCP1, CTD podjednostka fosfatazy 1
Identyfikatory zewnętrzne
Wikidane
Podjednostka polimerazy RNA II Fosfataza domeny C-końcowej jest enzymem kodowanym u ludzi przez gen CTDP1 .
Gen ten koduje białko, które oddziałuje z końcem karboksylowym czynnika inicjacji transkrypcji TFIIF, czynnika transkrypcyjnego, który reguluje wydłużanie, jak również inicjację przez polimerazę RNA II. Białko może również stanowić składnik kompleksu holoenzymu polimerazy RNA II. Alternatywny splicing tego genu skutkuje dwoma wariantami transkryptu kodującymi 2 różne izoformy.
Interakcje
Wykazano, że CTDP1 oddziałuje z białkiem 77 zawierającym powtórzenia WD , GTF2F1 i POLR2A .
Linki zewnętrzne
Dalsza lektura
Scully R, Anderson SF, Chao DM i in. (1997). „BRCA1 jest składnikiem holoenzymu polimerazy RNA II” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 94 (11): 5605–10. Bibcode : 1997PNAS...94.5605S . doi : 10.1073/pnas.94.11.5605 PMC20825 . _ PMID 9159119 .
Marshall NF, Dahmus GK, Dahmus ME (1998). „Regulacja fosfatazy domeny końca karboksylowego przez białko tat HIV-1” . J. Biol. chemia . 273 (48): 31726–30. doi : 10.1074/jbc.273.48.31726 PMID 9822634 .
Cho H, Kim TK, Mancebo H i in. (1999). „Funkcja fosfatazy białkowej polegająca na recyklingu polimerazy RNA II” . Geny Dev . 13 (12): 1540–52. doi : 10.1101/gad.13.12.1540 . PMC 316795 PMID 10385623 .
Angelicheva D, Turnev I, Dye D i in. (1999). „Zespół wrodzonej zaćmy, dysmorfii twarzy, neuropatii (CCFDN): nowe zaburzenie rozwojowe map Cyganów do 18qter” . Eur. J. Hum. Genet . 7 (5): 560–6. doi : 10.1038/sj.ejhg.5200319 PMID 10439962 .
Marshall NF, Dahmus ME (2000). „Wrażliwość fosfatazy domeny C-końcowej polimerazy RNA II we wczesnych kompleksach elongacyjnych na głównych późnych matrycach HIV-1 i adenowirusa 2” . J. Biol. chemia . 275 (42): 32430–7. doi : 10.1074/jbc.M005898200 PMID 10938286 .
Licciardo P, Napolitano G, Majello B, Lania L (2001). „Hamowanie transaktywacji Tat przez polimerazę RNA II CTD-fosfatazy FCP1”. AIDS . 15 (3): 301–7. doi : 10.1097/00002030-200102160-00002 . PMID 11273209 . S2CID 33054695 .
Bharucha DC, Zhou M, Nekhai S i in. (2002). „Fosfataza białkowa z ludzkich limfocytów T zwiększa transaktywację długiego końcowego powtórzenia ludzkiego wirusa niedoboru odporności typu 1” . Wirusologia . 296 (1): 6–16. doi : 10.1006/viro.2002.1438 PMID 12036313 .
Washington K, Ammosova T, Beullens M i in. (2002). „Fosfataza białkowa-1 defosforyluje domenę C-końcową polimerazy RNA-II” . J. Biol. chemia . 277 (43): 40442–8. doi : 10.1074/jbc.M205687200 PMID 12185079 .
Mandal SS, Cho H, Kim S i in. (2002). „FCP1, fosfataza specyficzna dla powtórzenia heptapeptydowego największej podjednostki polimerazy RNA II, stymuluje wydłużanie transkrypcji” . Mol. Komórka. Biol . 22 (21): 7543–52. doi : 10.1128/MCB.22.21.7543-7552.2002 . PMC 135672 PMID 12370301 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH i in. (2003). „Generowanie i wstępna analiza ponad 15 000 pełnej długości sekwencji cDNA człowieka i myszy” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 PMC 139241 PMID 12477932 .
Licciardo P, Amente S, Ruggiero L i in. (2003). „Fosfataza FCP1 oddziałuje z polimerazą RNA II i MEP50, składnikiem kompleksu metylosomu zaangażowanego w składanie snRNP” . Kwasy nukleinowe Res . 31 (3): 999–1005. doi : 10.1093/nar/gkg197 . PMC 149217 PMID 12560496 .
Nguyen BD, Chen HT, Kobor MS i in. (2003). „Struktura rozwiązania domeny końca karboksylowego RAP74 i charakterystyka NMR miejsc wiążących FCP1 RAP74 i ludzkiego TFIIB”. Biochemia . 42 (6): 1460–9. doi : 10.1021/bi0265473 . PMID 12578358 .
Friedl EM, Lane WS, Erdjument-Bromage H, et al. (2003). „Aktywności fosfatazy domeny C-końcowej i wydłużania transkrypcji FCP1 są regulowane przez fosforylację” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 100 (5): 2328–33. Bibcode : 2003PNAS..100.2328F . doi : 10.1073/pnas.2628049100 PMC 151340 PMID 12591939 .
Kamada K, Roeder RG, Burley SK (2003). „Mechanizm molekularny rekrutacji fosfatazy C-końcowej domeny polimerazy RNA (FCP1) związanej z TFIIF przez czynnik transkrypcyjny IIF” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 100 (5): 2296–9. Bibcode : 2003PNAS..100.2296K . doi : 10.1073/pnas.262798199 PMC 151334 PMID 12591941 .
Nguyen BD, Abbott KL, Potempa K i in. (2003). „Struktura NMR kompleksu zawierającego podjednostkę TFIIF RAP74 i polimerazę RNA II domeny końca karboksylowego fosfatazy FCP1” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 100 (10): 5688–93. Bibcode : 2003PNAS..100.5688N . doi : 10.1073/pnas.1031524100 PMC 156262 PMID 12732728 .
Varon R, Gooding R, Steglich C i in. (2003). „Częściowy niedobór fosfatazy domeny C-końcowej polimerazy RNA II jest związany z wrodzoną zaćmą, dysmorfią twarzy, zespołem neuropatii”. Nat. Genet . 35 (2): 185–9. doi : 10.1038/ng1243 . PMID 14517542 . S2CID 22461437 .
Yu X, Chini CC, He M i in. (2003). „Domena BRCT jest domeną wiążącą fosfo-białko”. nauka . 302 (5645): 639–42. Bibcode : 2003Sci...302..639Y . doi : 10.1126/science.1088753 . PMID 14576433 . S2CID 29407635 .
Beausoleil SA, Jędrychowski M, Schwartz D, et al. (2004). „Charakterystyka na dużą skalę fosfoprotein jądrowych komórek HeLa” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 101 (33): 12130-5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 PMC 514446 PMID 15302935 .
Galeria PDB
1onv : NMR Struktura kompleksu zawierającego podjednostkę TFIIF RAP74 i RNAP II CTD Fosfataza FCP1
