Caenorhabditis sinica
|
|
| Caenorhabditis sinica | |
|---|---|
| Klasyfikacja naukowa | |
| Królestwo: | Animalia |
| Gromada: | nicienie |
| Klasa: | Chromadorea |
| Zamówienie: | Rhabditida |
| Rodzina: | Rhabditidae |
| Rodzaj: | Caenorhabditis |
| Gatunek: |
C. sinika
|
| Nazwa dwumianowa | |
|
Caenorhabditis sinica Huang i in. , 2014
|
|
| Synonimy | |
|
Caenorhabditis sp. 5 |
|
Caenorhabditis sinica to gatunek nicieni Caenorhabditis , należący do supergrupy Elegans i grupy Elegans w obrębie rodzaju. Jest blisko spokrewniony z kilkoma gatunkami izolowanymi z terenów przylegających do Oceanu Indyjskiego i Pacyfiku, a także z C. briggsae i C. nigoni. Gatunek był znany jako „ C. sp. 5 ” przed 2014 r. C. sinica znana jest z bardzo dużej różnorodności genetycznej w swoim genomie. Podobnie jak inne gatunki Caenorhabditis , C. sinica to ok. 1 mm glista z przezroczystą skórką , która zjada bakterie. Dzikie szczepy izolatów C. sinica zostały zebrane z różnych gnijących substratów tkanek roślinnych w regionach umiarkowanych i tropikalnych w całych Chinach od czasu ich początkowej izolacji w 2005 roku.
Anatomia
Pomiary dorosłego C. sinica dały średnią długość ciała 1531,9 μm dla samic i 959,81 μm dla samców. Średnia wielkość samców C. sinica jest stosunkowo większa niż samców z systemu modelowego C. elegans (824,74 μm). C. sinica różni się morfologicznie od wszystkich innych gatunków Caenorhabditis z grupy Elegans ze względu na obecność wyraźnego trójramiennego haczyka na wardze przedkloakalnej samca, będącej częścią męskiej struktury rozrodczej.
Spikulowy kształt
Spikule samców C. sinica mają długą, smukłą, spiczastą i prostą morfologię, co jest wspólną cechą gatunków Caenorhabditis spoza supergrupy Elegans (z wyjątkiem C. japonica i C. afra ).
Reprodukcja
Podobnie jak większość gatunków Caenorhabditis , C. sinica wykazuje gonochorystyczny sposób rozmnażania, z populacjami obejmującymi zarówno płeć żeńską, jak i męską. Ten tryb reprodukcji kontrastuje z C. elegans i C. briggsae , które wykazują androdiogeniczny sposób rozmnażania, tak że populacje obejmują głównie samozapłodnione hermafrodyty z rzadszymi samcami.
Hybrydyzacja
W laboratorium C. sinica może hybrydyzować z C. nigoni, tworząc młode larwy, i może hybrydyzować z C. briggsae , tworząc młode, zdeformowane samice larw. Te hybrydy nie dają płodnych dorosłych osobników. Podjęto próbę hybrydyzacji C. sinica z 9 innymi gatunkami Caenorhabditis , ale zakończyła się ona niepowodzeniem ( C. elegans, C. remanei , C. japonica , C. doertyi, C. afra, C. wallacei, C. brenneri, C. nouraguensis, C. makrosperma ).
Ekologia
C. sinica została początkowo wyizolowana w 2005 roku z Guangxi w Chinach. Od tego czasu C. sinica była izolowana z gnijących owoców, gnijących liści, równonogów i podłoża glebowego w umiarkowanych i tropikalnych regionach Chin. Próbki zostały pobrane z chińskich prowincji Guangdong, Hubei, Guangxi, Jiangsu i Zhejiang, a także z Bac Kan w Wietnamie. C. sinica nie została wyizolowana z regionów poza Azją Wschodnią.
Genetyka
Wielkość genomu i geny kodujące białka
Genom C. sinica (szczep JU800) składa się z około 130,76 miliona par zasad i 34 696 genów kodujących białka. Te cechy genomu sprawiają, że jest on większy niż C. elegans , który składa się z około 100,29 miliona par zasad i 20 326 genów kodujących białka. Podobnie jak wszystkie znane Caenorhabditis , jego genom jest podzielony na sześć chromosomów (pięć autosomów i jeden chromosom płciowy „X”).
Linki zewnętrzne
- Caenorhabditis sp. 5 na nematodes.org