Christosa Ouzounisa

Christosa Ouzounisa
Urodzić się	Christos A. Ouzounis 1965 (wiek 57–58) Grecja
Alma Mater	Uniwersytet Arystotelesa w Salonikach (licencjat) Uniwersytet w Yorku (mgr, doktor)
Kariera naukowa
Pola	Biologia obliczeniowa Systemy Biomedycyna Bioinformatyka Ewolucja
Instytucje	Europejskie Laboratorium Biologii Molekularnej SRI International Europejski Instytut Bioinformatyki King's College London Centre for Research & Technology Hellas
Praca dyplomowa	Rola zachowania sekwencji w przewidywaniu struktury białek. (1993)
Doradca doktorski	Chrisa Sandera
Strona internetowa	bcplab .wordpress .com /who /dyrektor

Christos A. Ouzounis jest biologiem obliczeniowym , dyrektorem ds. badań w CERTH i profesorem bioinformatyki na Uniwersytecie Arystotelesa w Salonikach .

Edukacja

Ouzounis uzyskał tytuł licencjata (licencjat) nauk biologicznych na Uniwersytecie Arystotelesa w Salonikach (AUTH) w 1987 r. Następnie uzyskał tytuł magistra. Doktoryzował się z obliczeń biologicznych na Uniwersytecie w Yorku w 1988 roku, a następnie kontynuował pracę doktorską pod kierunkiem Chrisa Sandera w Europejskim Laboratorium Biologii Molekularnej w Heidelbergu w Niemczech , uzyskując stopień doktora na Uniwersytecie w Yorku w 1993 roku.

Kariera i badania

Po uzyskaniu doktoratu Ouzounis był stypendystą programu Human Frontiers Science Program (HFSP) w SRI International , Menlo Park, Kalifornia . Ouzounis założył własne laboratorium, badające genomikę obliczeniową, w Europejskim Laboratorium Biologii Molekularnej Europejskiego Instytutu Bioinformatyki ( EMBL-EBI) w 1996 roku.

Następnie przeniósł swoje laboratorium do King's College London (KCL), jako profesor, przewodniczący i dyrektor Centrum Bioinformatyki KCL w 2007 roku. Po restrukturyzacji w King's w latach 2009/2010 wrócił do Grecji , dołączając do CPERI w CERTH w Salonikach . W 2020 roku został mianowany profesorem bioinformatyki na AUTH . Jego zainteresowania badawcze obejmują strukturę, funkcję i ewolucję genomu, ewolucję funkcji białek, ewolucję systemów przetwarzania informacji genetycznej, teorię i zastosowania porównywania sekwencji biologicznych, reprezentację danych i wiedzy dla genomiki, nienadzorowane uczenie maszynowe w bardzo dużych zbiorach danych, inspirowane biologią inżynieria sprzętu i oprogramowania (prace niepublikowane), biologia syntetyczna, egzobiologia i komunikacja naukowa.

Niektóre z jego najbardziej znanych wkładów w dziedzinie genomiki obliczeniowej obejmują zautomatyzowaną adnotację sekwencji, odkrycie metod kontekstu genomowego, wnioskowanie o szlakach metabolicznych z sekwencji genomu, rozwój metod grupowania podobieństw sekwencji na dużą skalę, definicję Ostatni uniwersalny wspólny przodek ( LUCA ) wspólnie z Nikosem Kyrpidesem oraz ilościowe określenie wzorców poziomego transferu genów w „sieci życia”. Utrzymuje również duże zainteresowanie rozwojem biologii obliczeniowej jako wzorcowego paradygmatu w historii współczesnej nauki, co wywodzi się z jego osobistych doświadczeń związanych z rozwojem bioinformatyki w latach 90. Jako mentorów wymienia swojego zmarłego ojca Andreasa Ouzounisa†, Kostasa Kastritsisa†, Chrisa Sandera , Antoine Danchina i Carla Woese †.

Do jego byłych doktorantów należą David Kreil (2001), Anton Enright (2002) JM Peregrin-Alvarez (2003), Victor Kunin (2004) Nikos Darzentas (2005) i Ignat Drozdow (2010).

Nagrody i wyróżnienia

Ouzounis jest współredaktorem czasopisma PLOS Computational Biology (od 2007). Jest także zastępcą redaktora czasopisma BioSystems oraz redaktorem honorowym czasopisma Bioinformatics . Jest założycielem Międzynarodowego Towarzystwa Biologii Obliczeniowej (ISCB), inicjatywy Mikrobiokosmos (Grecja), Hellenic Society for Computational Biology & Bioinformatics oraz Hellenic Bioinformatics . Jest aktywnym członkiem MetaSUB oraz członkiem zarządu Elixir-Europe . Był profesorem wizytującym na Uniwersytecie w Toronto (2011-2014).

Jest także zapalonym poszukiwaczem przygód/fotografem i wyszkolonym instruktorem windsurfingu RYA/amatorskim trenerem windsurfingu.