Cyjanobakteryjny termometr RNA

Termometr Avashort 5' UTR
Przewidywana struktura drugorzędowa i konserwacja sekwencji małego RNA PinT
identyfikatorów
Rfam	RF02699
Inne dane
Domeny	Bakteria
IŚĆ	GO:0009266 , GO:0045974
WIĘC	SO:0005836 , SO:0000204
Struktury PDB	PDBe

Termometr Avalong 5' UTR
Przewidywana struktura drugorzędowa i konserwacja sekwencji małego RNA PinT
identyfikatorów
Rfam	RF02698
Inne dane
Domeny	Bakteria
IŚĆ	GO:0009266 , GO:0045974
WIĘC	SO:0005836 , SO:0000204
Struktury PDB	PDBe

Pierwszy cyjanobakteryjny termometr RNA ( RNAT ) Hsp17 został znaleziony w 5'UTR mRNA hsp17 Synechocystis szoku cieplnego . Dalsze badania wykazały, że cyjanobakterie często wykorzystują RNAT do kontrolowania translacji swoich genów szoku cieplnego . HspA jest homologiem Hsp17 w termofilnym Thermosynechococcus elongatus . Dwa kolejne termometry znaleziono w 5'UTR mezofilnych sinic A. variabilis i Nostoc sp . Wykazano , że pierwszy RNAT o nazwie avashort reguluje translację poprzez maskowanie miejsca rozpoczęcia translacji AUG. Drugi RNAT zwany avalong , ponieważ ma rozszerzoną początkową szpilkę do włosów, może obejmować trzeciorzędowe interakcje i ma podobieństwa do elementu ROSE .