Cystrom

Mówiąc prościej, cistrom odnosi się do zbioru elementów regulatorowych zestawu genów, w tym miejsc wiązania czynników transkrypcyjnych i modyfikacji histonów. Dokładniej, „zestaw celów działających w układzie cis czynnika działającego w układzie trans w skali całego genomu, znany również jako lokalizacja miejsc wiązania czynników transkrypcyjnych lub modyfikacji histonów w całym genomie in vivo ”. Termin cistrom to kontaminacja cistr (od cistron ) + ome ( od genomu ) . Termin cistrom został wymyślony przez badaczy z Dana-Farber Cancer Institute i Harvard Medical School .

Technologie takie jak immunoprecypitacja chromatyny w połączeniu z analizą mikromacierzy „ ChIP-on-chip ” lub z masowo równoległym sekwencjonowaniem DNA „ ChIP-Seq ” znacznie ułatwiły zdefiniowanie cistromu czynników transkrypcyjnych i innych białek związanych z chromatyną .

Dalsza lektura

•    Lupien M, Eeckhoute J, Meyer CA, Wang Q, Zhang Y, Li W, Carroll JS, Liu XS, Brown M (marzec 2008). „FoxA1 tłumaczy sygnatury epigenetyczne na transkrypcję specyficzną dla linii zależnej od wzmacniaczy” . komórka . 132 (6): 958–70. doi : 10.1016/j.cell.2008.01.018 . PMC 2323438 . PMID 18358809 .
•   Lupien M, Brown M (czerwiec 2009). „Cistromics raka zależnego od hormonów” . endokr. Relat. Rak . 16 (2): 381–9. doi : 10.1677/ERC-09-0038 . PMID 19369485 .