DEPTOR

Identyfikatory
DEPTOR
	, DEP.6, DEPDC6, domena DEP zawierająca białko oddziałujące z MTOR, domena DEP zawierająca białko oddziałujące z MTOR
Identyfikatory zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek )
Chr.
Koniec
Lokalizacja genu ( mysz )
Chr.
Koniec
Wzór ekspresji RNA
	; ;
Ontologia genów
Funkcja molekularna
Komponent komórkowy
Proces biologiczny
	Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi
	Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka	Wyświetl/edytuj mysz

Białko oddziałujące z mTOR zawierające domenę DEP ( DEPTOR ) znane również jako białko 6 zawierające domenę DEP ( DEPDC6 ) jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen DEPTOR .

Struktura

Gen DEPTOR można znaleźć tylko u kręgowców. U człowieka DEPTOR znajduje się na chromosomie 8, 8q24.12 z białkiem o wielkości 409 aa. Ludzki DEPTOR zawiera dwie N-końcowe domeny DEP i C-końcową domenę PDZ .

Funkcjonować

DEPTOR bierze udział w szlaku sygnałowym mTOR jako endogenny regulator. Wykazano bezpośrednią interakcję między DEPTOR i mTOR. Nadekspresja DEPTOR obniża aktywność mTORC1 i mTORC2 in vitro . mTORC1 i mTORC2 mogą zarówno hamować DEPTOR poprzez fosforylację .

Metabolizm

Komórka DEPTOR autonomicznie reguluje adipogenezę . W mięśniach Baf60c promuje przejście z oksydacyjnego na glikolityczny typ włókien mięśniowych poprzez Akt / PKB za pośrednictwem DEPTOR . W mózgu DEPTOR ulega silnej ekspresji w hipokampie , podwzgórzu przyśrodkowo-podstawnym i narządach okołokomorowych . Nadekspresja DEPTOR w podwzgórzu środkowo-podstawnym chroni myszy przed otyłością wywołaną dietą wysokotłuszczową poprzez modulowanie sygnalizacji Akt / PKB .

Rak kliniczny

Chociaż w większości nowotworów szlak mTOR jest konstytutywnie aktywowany, a ekspresja DEPTOR jest niska, jedno badanie wykazało, że DEPTOR ulega nadekspresji w komórkach szpiczaka mnogiego i jest niezbędny do ich przeżycia.

Dalsza lektura

Maruyama K, Sugano S (styczeń 1994). „Oligo-capping: prosta metoda zastąpienia struktury czapeczki eukariotycznych mRNA oligorybonukleotydami”. gen . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (październik 1997). „Konstrukcja i charakterystyka biblioteki cDNA wzbogaconej o pełnej długości i wzbogaconej o koniec 5'”. gen . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (listopad 2000). „Klonowanie DNA przy użyciu rekombinacji specyficznej dla miejsca in vitro” . Badania genomu . 10 (11): 1788–95. doi : 10.1101/gr.143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 .
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (marzec 2001). „W kierunku katalogu ludzkich genów i białek: sekwencjonowanie i analiza 500 nowych kompletnych białek kodujących ludzkie cDNA” . Badania genomu . 11 (3): 422–35. doi : 10.1101/gr.GR1547R . PMC 311072 . PMID 11230166 .
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (wrzesień 2000). „Systematyczna lokalizacja subkomórkowa nowych białek zidentyfikowanych przez sekwencjonowanie cDNA na dużą skalę” . Raporty EMBO . 1 (3): 287–92. doi : 10.1093/embo-reports/kvd058 . PMC 1083732 . PMID 11256614 .
Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (październik 2004). „Od ORFeome do biologii: funkcjonalny rurociąg genomiki” . Badania genomu . 14 (10B): 2136–44. doi : 10.1101/gr.2576704 . PMC 528930 . PMID 15489336 .
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F, Bechtel S, Simpson J, Hofmann O, Hide W, Glatting KH, Huber W, Pepperkok R, Poustka A, Wiemann S (styczeń 2006). „Baza danych LIFEdb w 2006 roku” . Badania kwasów nukleinowych . 34 (problem z bazą danych): D415–8. doi : 10.1093/nar/gkj139 . PMC 1347501 . PMID 16381901 .