Domena wykrywająca sterole
Domena wykrywająca sterol ( SSD ) to domena białkowa , która składa się ze 180 aminokwasów tworzących pięć transbłonowych segmentów zdolnych do wiązania grup sterolowych . Ten typ domeny jest obecny w białkach zaangażowanych w metabolizm cholesterolu i sygnalizację.
Funkcjonować
Domeny wykrywające sterole są obecne w różnych białkach zaangażowanych w kluczowe aspekty homeostazy i sygnalizacji cholesterolu. Wiele dopasowań sekwencji przy użyciu Clustal W wykazało, że białka te można pogrupować w siedem różnych rodzin zgodnie z ich dyskami SSD. Następujące białka zawierające SSD reprezentują każdą rodzinę:
- Reduktaza HMG-CoA (HMGCR), biorąca udział w biosyntezie cholesterolu. Było to pierwsze odkryte białko z dyskiem SSD. Po związaniu z cholesterolem białko to ulega degradacji związanej z retikulum endoplazmatycznym . Dysk SSD nie jest wymagany do aktywności katalitycznej HMGCR.
- Białko aktywujące cięcie SREBP (SCAP), które reguluje transkrypcję genów z elementami odpowiedzi na sterole poprzez proteolityczną aktywację białek wiążących elementy regulatorowe sterolu (SREBP). Było to drugie odkryte białko zawierające SSD.
- Reduktaza 7-dehydrocholesterolu (7DHCR), biorąca udział w ostatnim etapie biosyntezy cholesterolu.
-
Niemanna-Picka typu C1 (NPC1), biorącego udział w wewnątrzkomórkowym transporcie cholesterolu.
- Niemanna-Picka typu C1-like 1 (NPC1L1), regulator wchłaniania cholesterolu w enterocytach .
- Patched ( PTCH1 , PTCH2 ), zaangażowany w szlak sygnałowy hedgehog , a także w cytokinezę. Jego dysk SSD wiąże ugrupowanie cholesterolowe hedgehog i jest niezbędny do jego działania.
- Wysłane (DISP1, DISP2, DISP3), również zaangażowane w sygnalizację jeża. DISP jest wymagany do wydzielania jeża.
- Białko związane z łatkami (PTR), strukturalnie podobne do łatanych. Jego funkcje nie są w pełni poznane.
Choroba
Mutacje w 7DHCR są powiązane z zespołem Smitha-Lemli-Opitza (SLOS). Wykazano, że mutacje w NPC1 powodują chorobę Niemanna-Picka typu C. Mutacje w patched są związane z różnymi nowotworami ( rak podstawnokomórkowy , rdzeniak zarodkowy , mięśniakomięsak prążkowanokomórkowy ).