Drabina DNA
Drabina DNA to cecha, którą można zaobserwować, gdy fragmenty DNA powstałe w wyniku fragmentacji DNA apoptozy są wizualizowane po rozdzieleniu za pomocą elektroforezy żelowej, po raz pierwszy opisanej w 1980 roku przez Andrew Wyllie ze szkoły medycznej Uniwersytetu w Edynburgu. Fragmenty DNA można również usunąć z komórek, które przeszły martwicę , gdy te fragmenty DNA po rozdzieleniu poddaje się elektroforezie żelowej, w wyniku czego powstaje charakterystyczny układ drabinkowy,
Degradacja DNA
Drabina DNA jest charakterystyczną cechą DNA degradowanego przez DNazę aktywowaną kaspazą (CAD), która jest kluczowym zdarzeniem podczas apoptozy . CAD rozszczepia genomowy DNA w łącznika międzynukleosomalnego , w wyniku czego powstają fragmenty DNA o długości wielokrotności 180–185 par zasad . Rozdzielenie fragmentów za pomocą elektroforezy w żelu agarozowym i późniejsza wizualizacja, na przykład przez barwienie bromkiem etydyny , daje charakterystyczny wzór „drabinkowy”. Prosta metoda selektywnej ekstrakcji pofragmentowanego DNA z komórek apoptotycznych bez obecności skrawków DNA o dużej masie cząsteczkowej, generująca wzór drabinkowy, wykorzystuje wstępne traktowanie komórek etanolem .
Apoptoza i martwica
Podczas gdy większość cech morfologicznych komórek apoptotycznych jest krótkotrwała, drabinkowanie DNA może być stosowane jako metoda odczytu stanu końcowego i dlatego stało się niezawodną metodą odróżniania apoptozy od martwicy . Drabinkę DNA można również wykorzystać do sprawdzenia, czy komórki przeszły apoptozę w obecności wirusa. Jest to przydatne, ponieważ może pomóc określić wpływ wirusa na komórkę.
Drabinkę DNA można wykorzystać tylko do wykrywania apoptozy podczas późniejszych etapów apoptozy. Wynika to z fragmentacji DNA zachodzącej w późniejszym etapie procesu apoptozy. Drabina DNA służy do testowania apoptozy wielu komórek i nie jest dokładna przy testowaniu tylko kilku komórek, które popełniły apoptozę. Aby zwiększyć dokładność testów apoptozy, stosuje się inne testy wraz z drabinką DNA, takie jak TEM i TUNEL. Dzięki niedawnym ulepszeniom drabinkowania DNA, drabinkowanie DNA stało się bardziej niezawodną i rozsądną techniką stosowaną podczas wykrywania apoptozy. Należy również zauważyć, że drabinkowanie DNA przebiega różnie w zależności od typu komórki, więc mogą wystąpić niewielkie zmiany w procesie drabinkowania DNA w zależności od badanej komórki.