EIF2C1

AGO1
Dostępne konstrukcje WPB Wyszukiwanie ortologów: Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, EIF2C, EIF2C1, GERP95, Q99, hAgo1, argonaute 1, składnik katalityczny RISC, składnik katalityczny argonaute RISC 1, składnik argonaut RISC 1
Identyfikatory zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Błagam Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS
Ontologia genów Funkcja molekularna Komponent komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Białko argonaute-1 jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen EIF2C1 .

Funkcjonować

Gen ten koduje członka rodziny białek Argonaute, które odgrywają rolę w interferencji RNA. Kodowane białko jest wysoce zasadowe i zawiera domenę PAZ i domenę PIWI. Może wchodzić w interakcje z dicer1 i odgrywać rolę w wyciszaniu genów za pośrednictwem krótkiego interferującego RNA. Ten gen znajduje się na chromosomie 1 w grupie blisko spokrewnionych członków rodziny, w tym argonauta 3 i argonauta 4.

Organizmy modelowe

Fenotyp myszy z nokautem Eif2c1

Charakterystyka	Fenotyp
Żywotność homozygoty	Nieprawidłowy
Płodność	Normalna
Masy ciała	Normalna
Lęk	Normalna
Ocena neurologiczna	Normalna
Siła uścisku	Normalna
Gorący talerz	Normalna
Dysmorfologia	Normalna
Kalorymetria pośrednia	Normalna
Test tolerancji glukozy	Normalna
Słuchowa reakcja pnia mózgu	Normalna
DEXA	Normalna
Radiografia	Normalna
Temperatura ciała	Normalna
Morfologia oka	Normalna
Chemia kliniczna	Nieprawidłowy
Hematologia	Normalna
Test mikrojądrowy	Normalna
Waga serca	Normalna
Histopatologia oka	Normalna
Zakażenie Salmonellą	Normalna
Infekcja citrobakterii	Normalna
Wszystkie testy i analizy z

W badaniu funkcji EIF2C1 wykorzystano organizmy modelowe . Linia myszy z warunkowym nokautem , zwana Eif2c1 ^{tm1a(KOMP)Wtsi,} została wygenerowana w ramach programu International Knockout Mouse Consortium — wysokoprzepustowego projektu mutagenezy mającego na celu generowanie i dystrybucję zwierzęcych modeli chorób do zainteresowanych naukowców.

Samce i samice zwierząt poddano standaryzowanemu badaniu fenotypowemu w celu określenia skutków delecji. Dwadzieścia dwa testy przeprowadzono na zmutowanych myszach i zaobserwowano dwie znaczące nieprawidłowości: mutanty homozygotyczne były zdolne do przeżycia , a samice miały również obniżony poziom krążącej transaminazy asparaginianowej .

Dalsza lektura

•   Carmell MA, Xuan Z, Zhang MQ, Hannon GJ (listopad 2002). „Rodzina Argonautów: macki sięgające do RNAi, kontrola rozwoju, utrzymanie komórek macierzystych i powstawanie nowotworów” . Geny i rozwój . 16 (21): 2733–42. doi : 10.1101/gad.1026102 . PMID 12414724 .
•   Reddy PH, Stockburger E, Gillevet P, Tagle DA (grudzień 1997). „Mapowanie i charakterystyka nowych cDNA powtórzeń (CAG) n z mózgu dorosłego człowieka uzyskanych metodą wychwytywania oligo” . Genomika . 46 (2): 174–82. doi : 10.1006/geno.1997.5044 . PMID 9417904 .
•    Cikaluk DE, Tahbaz N, Hendricks LC, DiMattia GE, Hansen D, Pilgrim D, Hobman TC (październik 1999). „GERp95, białko związane z błoną, które należy do rodziny białek zaangażowanych w różnicowanie komórek macierzystych” . Biologia molekularna komórki . 10 (10): 3357–72. doi : 10.1091/mbc.10.10.3357 . PMC25603 . _ PMID 10512872 .
•    Martinez J, Patkaniowska A, Urlaub H, Lührmann R, Tuschl T (wrzesień 2002). „Jednoniciowe antysensowne siRNA kierują cięciem docelowego RNA w RNAi”. komórka . 110 (5): 563–74. doi : 10.1016/S0092-8674(02)00908-X . hdl : 11858/00-001M-0000-0012-F2FD-2 . PMID 12230974 . S2CID 10616773 .
•    Doi N, Zenno S, Ueda R, Ohki-Hamazaki H, Ui-Tei K, Saigo K (styczeń 2003). „Wyciszanie genów za pośrednictwem krótkiego interferującego RNA w komórkach ssaków wymaga czynników inicjacji translacji Dicer i eIF2C” . Bieżąca biologia . 13 (1): 41–6. doi : 10.1016/S0960-9822(02)01394-5 . PMID 12526743 . S2CID 14650075 .
•    Ma JB, Ye K, Patel DJ (maj 2004). „Strukturalne podstawy rozpoznawania małych interferujących RNA specyficznych dla wystających fragmentów przez domenę PAZ” . Natura . 429 (6989): 318–22. Bibcode : 2004Natur.429..318M . doi : 10.1038/natura02519 . PMC 4700412 . PMID 15152257 .
•    Sen GL, Blau HM (czerwiec 2005). „Argonaute 2 / RISC znajduje się w miejscach rozpadu mRNA ssaków, znanych jako ciała cytoplazmatyczne”. Biologia komórki przyrody . 7 (6): 633–6. doi : 10.1038/ncb1265 . PMID 15908945 . S2CID 6085169 .
•    Liu J, Valencia-Sanchez MA, Hannon GJ, Parker R (lipiec 2005). „Zależna od mikroRNA lokalizacja docelowych mRNA w ciałach P ssaków” . Biologia komórki przyrody . 7 (7): 719–23. doi : 10.1038/ncb1274 . PMC 1855297 . PMID 15937477 .
•    Chu CY, Rana TM (lipiec 2006). „Represja translacji w komórkach ludzkich przez wyciszanie genów indukowane mikroRNA wymaga RCK / p54” . PLOS Biologia . 4 (7): e210. doi : 10.1371/journal.pbio.0040210 . PMC 1475773 . PMID 16756390 .
•    Kim DH, Villeneuve LM, Morris KV, Rossi JJ (wrzesień 2006). „Argonaute-1 kieruje wyciszeniem genów transkrypcyjnych za pośrednictwem siRNA w komórkach ludzkich” . Przyroda Biologia strukturalna i molekularna . 13 (9): 793–7. doi : 10.1038/nsmb1142 . PMID 16936726 . S2CID 26923711 .
•    Janowski BA, Huffman KE, Schwartz JC, Ram R, Nordsell R, Shames DS, Minna JD, Corey DR (wrzesień 2006). „Zaangażowanie AGO1 i AGO2 w wyciszanie transkrypcji ssaków”. Przyroda Biologia strukturalna i molekularna . 13 (9): 787–92. doi : 10.1038/nsmb1140 . PMID 16936728 . S2CID 2230812 .
•   Sasaki T, Shimizu N (lipiec 2007). „Ewolucyjna konserwacja unikalnej sekwencji aminokwasów w ludzkim białku DICER, niezbędna do wiązania się z białkami z rodziny Argonautów”. gen . 396 (2): 312–20. doi : 10.1016/j.gene.2007.04.001 . PMID 17482383 .