Cronobacter sakazakii
|
|
| Cronobacter sakazakii | |
|---|---|
| Cronobacter sakazakii | |
| Klasyfikacja naukowa | |
| Domena: | Bakteria |
| Gromada: | pseudomonadota |
| Klasa: | Gammaproteobakterie |
| Zamówienie: | Enterobacterale |
| Rodzina: | Enterobacteriaceae |
| Rodzaj: | Cronobacter |
| Gatunek: |
C. sakazakii
|
| Nazwa dwumianowa | |
|
Cronobacter sakazakii (Farmer i wsp. 1980)
|
|
Cronobacter sakazakii , który przed 2007 r. nosił nazwę Enterobacter sakazakii , jest oportunistyczną, Gram-ujemną , pałeczkowatą , chorobotwórczą bakterią , która może żyć w bardzo suchych miejscach, zwanych inaczej kserotolerancją. C. sakazakii wykorzystuje szereg genów do przeżycia wysychania i ta kserotolerancja może być specyficzna dla szczepu. Większość C. sakazakii to osoby dorosłe, ale największe ryzyko stanowią wcześniaki i starsze niemowlęta z niską masą urodzeniową . Patogen jest rzadką przyczyną inwazyjnych infekcji u niemowląt, z historycznie wysokimi wskaźnikami śmiertelności (40–80%).
U niemowląt może powodować bakteriemię , zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych i martwicze zapalenie jelit . Większość C. sakazakii u noworodków była związana ze stosowaniem sproszkowanej mieszanki dla niemowląt , przy czym niektóre szczepy były w stanie przetrwać w stanie wysuszonym przez ponad dwa lata. Jednak nie wszystkie przypadki zostały powiązane z zanieczyszczoną mieszanką dla niemowląt. wycofano kilka dostaw tamponów Kotex z powodu zanieczyszczenia Cronobacter ( E. sakazakii ). W jednym badaniu patogen wykryto w 12% warzyw polowych i 13% warzyw hydroponicznych.
Wszystkie gatunki Cronobacter , z wyjątkiem C. condimenti , powiązano retrospektywnie z klinicznymi przypadkami infekcji u dorosłych lub niemowląt. Jednak typowanie sekwencji multilocus wykazało, że większość przypadków noworodkowego zapalenia opon mózgowo -rdzeniowych w ciągu ostatnich 30 lat w 6 krajach była związana tylko z jedną linią genetyczną gatunku Cronobacter sakazakii, zwaną „sekwencją typu 4” lub „ST4”, a zatem klon wydaje się być największym problemem w przypadku infekcji niemowląt.
Bakteria jest wszechobecna, izolowana z różnych środowisk i żywności; większość Cronobacter występuje w populacji dorosłych. Jednak to skojarzenie z wewnętrznie lub zewnętrznie zanieczyszczonym sproszkowanym preparatem przyciągnęło główną uwagę. Według analizy sekwencji multilocus (MLSA) rodzaj pochodzi z ~40 MYA , a najbardziej klinicznie znaczący gatunek, C. sakazakii , był rozróżnialny ~15-23 MYA.
Taksonomia
E. sakazakii została zdefiniowana jako gatunek w 1980 roku przez JJ Farmera III i in . Hybrydyzacja DNA-DNA wykazała, że E. sakazakii była w 53–54% spokrewniona z gatunkami z dwóch różnych rodzajów, Enterobacter i Citrobacter . Jednak opisano różne biogrupy w E. sakazakii , a Farmer i wsp . zasugerowali, że mogą one reprezentować różne gatunki i wymagały dalszych badań w celu wyjaśnienia.
Zależność taksonomiczna między szczepami E. sakazakii została zbadana przy użyciu sekwencjonowania genu 16S rRNA pełnej długości, hybrydyzacji DNA-DNA, wielomiejscowego typowania sekwencji (MLST), f- AFLP , automatycznego rybotypowania . Doprowadziło to do klasyfikacji E. sakazakii jako nowego rodzaju, Cronobacter w obrębie Enterobacteriaceae , początkowo obejmującego cztery nazwane gatunki w 2007 r. Taksonomia została rozszerzona do pięciu nazwanych gatunków w 2008 r., A ostatnio (2011) do siedmiu nazwanych gatunków.
Początkowe cztery gatunki nazwane w 2007 r. to Cronobacter sakazakii (składający się z dwóch podgatunków), C. turicensis , C. muytjensii i C. dublinensis (składający się z trzech podgatunków) oraz nienazwany gatunek określany jako genomogatunek Cronobacter I. Taksonomia została zmieniona w 2008 r. na obejmuje piąty nazwany gatunek C. malonaticus , który w 2007 roku został uznany za podgatunek C. sakazakii . W 2012 roku Cronobacter genomospecies I został formalnie przemianowany na Cronobacter universalis , a siódmy gatunek został opisany jako Cronobacter condimenti .
Etymologia
Pierwsza udokumentowana izolacja tego, co stało się znane jako Cronobacter sakazakii, pochodziła z puszki mleka w proszku w 1950 r., chociaż organizmy te prawdopodobnie istnieją od milionów lat. W 1980 roku John J. Farmer III zaproponował nazwę Enterobacter sakazakii dla tego, co było znane jako „żółtopigmentowane E. cloacae”, na cześć japońskiego bakteriologa Riichi Sakazakiego. W ciągu następnych dziesięcioleci E. sakazakii była powiązana z wieloma przypadkami zapalenia opon mózgowych i posocznicy wśród niemowląt, często w związku ze sproszkowanym preparatem dla niemowląt. W 2007 r. utworzono rodzaj Cronobacter , aby pomieścić biogrupy E. sakazakii , z C. sakazakii jako gatunkiem typowym. Rodzaj został nazwany na cześć Kronosa , tytana z greckiego mitu, który pożerał swoje dzieci, gdy się rodziły.
Linki zewnętrzne
- Międzynarodowe spotkanie na temat Cronobacter
- Rodzaj szczepu Cronobacter sakazakii w Bac Dive — metabazie różnorodności bakteryjnej