Genom@dom
Genome@home był projektem komputerowym realizowanym przez wolontariuszy , prowadzonym przez Stefana Larsona z Uniwersytetu Stanforda i siostrzanym projektem Folding@home . Jego celem było projektowanie białek i ich zastosowania, co miało wpływ na wiele dziedzin, w tym medycynę . Genome@home był prowadzony przez Pande Lab.
Funkcjonować
W następstwie projektu Human Genome Project naukowcy musieli poznać biologiczne i medyczne implikacje wynikającego z tego bogactwa informacji genetycznych. Genome@home wykorzystał wolną moc obliczeniową komputerów osobistych do wirtualnego projektowania genów pasujących do istniejących białek , chociaż może również projektować nowe białka, których nie znaleziono w naturze. Ten proces jest wymagający obliczeniowo, więc przetwarzanie rozproszone jest realną opcją. Naukowcy mogą wykorzystać wyniki projektu, aby lepiej zrozumieć ewolucję naturalnych genomów i białek oraz ich funkcjonalność. Projekt ten znalazł zastosowanie w terapii medycznej , nowych farmaceutykach i przypisywaniu funkcji nowo zsekwencjonowanym genom.
W ramach projektu Genome@home bezpośrednio badano genomy i białka, wirtualnie projektując nowe sekwencje istniejących trójwymiarowych struktur białkowych, które inni naukowcy uzyskali za pomocą krystalografii rentgenowskiej lub technik NMR . Rozumiejąc związek między sekwencjami a określonymi strukturami białek, laboratorium Pande zajęło się współczesnymi problemami biologii strukturalnej , genetyki i medycyny .
W szczególności projekt Genome@home pomógł zrozumieć, dlaczego tysiące różnych sekwencji aminokwasowych tworzą te same struktury, a także wspomógł dziedziny proteomiki i genomiki strukturalnej , przewidując funkcje nowo odkrytych genów i białek. Miało to również wpływ na terapię medyczną poprzez projektowanie i wirtualne tworzenie nowych wersji istniejących białek. Oprogramowanie Genome@home zostało zaprojektowane dla jednoprocesorowych . Zaczyna się od dużego zestawu potencjalnych sekwencji i wielokrotnie przeszukuje i udoskonala te sekwencje, aż do znalezienia dobrze zaprojektowanej sekwencji. Następnie wysyła tę sekwencję do serwera i powtarza proces.
Wniosek
Ze względów finansowych projekt został oficjalnie zakończony 8 marca 2004 r., chociaż dane zbierano jeszcze do 15 kwietnia. Po jego zakończeniu użytkownicy zostali poproszeni o przekazanie darowizn na rzecz Folding@home .
Wyniki
Zgromadził dużą bazę danych sekwencji białek, które przez lata będą wykorzystywane do ważnych celów naukowych przez Pande Lab i innych naukowców na całym świecie.
W ramach projektu Genome@home powstały cztery recenzowane publikacje naukowe .