H2AFY

MAKROH2A1
Dostępne konstrukcje
WPB	Wyszukiwanie ortologów:
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, H2A.y, H2A/y, H2AF12M, H2AFJ, MACROH2A1.1, mH2A1, macroH2A1.2, H2A członek rodziny histonów Y, H2AFY, macroH2A.1 histon Identyfikatory
zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek )
Chr.
Koniec
Lokalizacja genu ( mysz )
Chr.
Koniec
Wzór ekspresji RNA
	; ; ; ;
Ontologia genów
Funkcja molekularna
Komponent komórkowy
Proces biologiczny
	Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi
	Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka	Wyświetl/edytuj mysz

Makro-H2A.1 histonu rdzeniowego jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen H2AFY .

Funkcjonować

Histony to podstawowe białka jądrowe , które są odpowiedzialne za strukturę nukleosomu włókna chromosomalnego u eukariontów . Nukleosomy składają się z około 146 pz DNA owiniętego wokół oktameru histonowego złożonego z par każdego z czterech histonów rdzeniowych (H2A, H2B, H3 i H4). Włókno chromatyny jest dalej zagęszczane poprzez interakcję histonu łącznika, H1 , z DNA między nukleosomami, tworząc struktury chromatyny wyższego rzędu. Ten gen koduje członka rodziny histonów H2A. Zastępuje konwencjonalne histony H2A w podzbiorze nukleosomów, w których hamuje transkrypcję i uczestniczy w stabilnej inaktywacji chromosomu X. Splicing alternatywny skutkuje wieloma wariantami transkryptu kodującymi różne izoformy. Ekspresja tych izoform jest związana z kilkoma nowotworami, takimi jak rak wątrobowokomórkowy.

Dalsza lektura

El Kharroubi A, Piras G, Zensen R, Martin MA (maj 1998). „Aktywacja transkrypcji zintegrowanego promotora ludzkiego wirusa niedoboru odporności typu 1 związanego z chromatyną” . Biologia molekularna i komórkowa . 18 (5): 2535–44. doi : 10.1128/mcb.18.5.2535 . PMC 110633 . PMID 9566873 .
Costanzi C, Pehrson JR (czerwiec 1998). „Histon makroH2A1 koncentruje się w nieaktywnym chromosomie X samic ssaków”. Natura . 393 (6685): 599–601. Bibcode : 1998Natur.393..599C . doi : 10.1038/31275 . PMID 9634239 . S2CID 205001095 .
Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (październik 2000). „Klonowanie i analiza funkcjonalna cDNA z otwartymi ramkami odczytu dla 300 wcześniej niezdefiniowanych genów ulegających ekspresji w hematopoetycznych komórkach macierzystych/progenitorowych CD34+” . Badania genomu . 10 (10): 1546–60. doi : 10.1101/gr.140200 . PMC 310934 . PMID 11042152 .
Deng L, de la Fuente C, Fu P, Wang L, Donnelly R, Wade JD, Lambert P, Li H, Lee CG, Kashanchi F (listopad 2000). „Acetylacja HIV-1 Tat przez CBP / P300 zwiększa transkrypcję zintegrowanego genomu HIV-1 i zwiększa wiązanie z histonami rdzeniowymi” . Wirusologia . 277 (2): 278–95. doi : 10.1006/viro.2000.0593 . PMID 11080476 .
Chadwick BP, Willard HF (maj 2001). „Warianty histonu H2A i nieaktywny chromosom X: identyfikacja drugiego wariantu makroH2A” . Genetyka molekularna człowieka . 10 (10): 1101–13. doi : 10.1093/hmg/10.10.1101 . PMID 11331621 .
Deng L, Wang D, de la Fuente C, Wang L, Li H, Lee CG, Donnelly R, Wade JD, Lambert P, Kashanchi F (październik 2001). „Wzmocnienie aktywności p300 HAT przez HIV-1 Tat na chromatynie DNA” . Wirusologia . 289 (2): 312–26. doi : 10.1006/viro.2001.1129 . PMID 11689053 .
Chadwick BP, Willard HF (czerwiec 2002). „Zależna od cyklu komórkowego lokalizacja makroH2A w chromatynie nieaktywnego chromosomu X” . Journal of Cell Biology . 157 (7): 1113–23. doi : 10.1083/jcb.200112074 . PMC 2173542 . PMID 12082075 .
Takahashi I, Kameoka Y, Hashimoto K (sierpień 2002). „MacroH2A1.2 wiąże białko jądrowe Spop” . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Badania nad komórkami molekularnymi . 1591 (1–3): 63–8. doi : 10.1016/S0167-4889(02)00249-5 . PMID 12183056 .
Ganesan S, Silver DP, Greenberg RA, Avni D, Drapkin R, Miron A, Mok SC, Randrianarison V, Brodie S, Salstrom J, Rasmussen TP, Klimke A, Marrese C, Marahrens Y, Deng CX, Feunteun J, Livingston DM (listopad 2002). „BRCA1 obsługuje stężenie RNA XIST na nieaktywnym chromosomie X” . komórka . 111 (3): 393–405. doi : 10.1016/S0092-8674(02)01052-8 . PMID 12419249 . S2CID 372211 .
Angelov D, Molla A, Perche PY, Hans F, Côté J, Khochbin S, Bouvet P, Dimitrov S (kwiecień 2003). „Wariant histonu macroH2A zakłóca wiązanie czynnika transkrypcyjnego i przebudowę nukleosomu SWI / SNF” . Komórka molekularna . 11 (4): 1033–41. doi : 10.1016/S1097-2765(03)00100-X . PMID 12718888 .
Behrends U, Schneider I, Rössler S, Frauenknecht H, Golbeck A, Lechner B, Eigenstetter G, Zobywalski C, Müller-Weihrich S, Graubner U, Schmid I, Sackerer D, Späth M, Goetz C, Prantl F, Asmuss HP, Bise K, Mautner J (sierpień 2003). „Nowe antygeny nowotworowe zidentyfikowane przez przeszukiwanie autologicznych przeciwciał bibliotek cDNA rdzeniaka dziecięcego” . Międzynarodowy Dziennik Raka . 106 (2): 244–51. doi : 10.1002/ijc.11208 . PMID 12800201 . S2CID 36836051 .
Lusic M, Marcello A, Cereseto A, Giacca M (grudzień 2003). „Regulacja ekspresji genu HIV-1 przez acetylację histonów i rekrutację czynnika w promotorze LTR” . Dziennik EMBO . 22 (24): 6550–61. doi : 10.1093/emboj/cdg631 . PMC 291826 . PMID 14657027 .
Acín-Pérez R, Bayona-Bafaluy MP, Fernández-Silva P, Moreno-Loshuertos R, Pérez-Martos A, Bruno C, Moraes CT, Enríquez JA (marzec 2004). „Kompleks oddechowy III jest wymagany do utrzymania kompleksu I w mitochondriach ssaków” . Komórka Molekularna . 13 (6): 805–15. doi : 10.1016/S1097-2765(04)00124-8 . PMC 3164363 . PMID 15053874 .
Zhang R, Poustovoitov MV, Ye X, Santos HA, Chen W, Daganzo SM, Erzberger JP, Serebriiskii IG, Canutescu AA, Dunbrack RL, Pehrson JR, Berger JM, Kaufman PD, Adams PD (styczeń 2005). „Tworzenie ognisk heterochromatyny związanych ze starzeniem się zawierających makroH2A i starzenie się spowodowane przez ASF1a i HIRA” . Komórka rozwojowa . 8 (1): 19–30. doi : 10.1016/j.devcel.2004.10.019 . PMID 15621527 .
Hernández-Muñoz I, Lund AH, van der Stoop P, Boutsma E, Muijrers I, Verhoeven E, Nusinow DA, Panning B, Marahrens Y, van Lohuizen M (maj 2005). „Stabilna inaktywacja chromosomu X obejmuje kompleks PRC1 Polycomb i wymaga histonu MACROH2A1 i ligazy ubikwityny E3 CULLIN3 / SPOP” . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 102 (21): 7635–40. doi : 10.1073/pnas.0408918102 . PMC 1140410 . PMID 15897469 .
Ioudinkova ES, Barat A, Pichugin A, Markova E, Sklyar I, Pirozhkova I, Robin C, Lipinski M, Ogryzko V, Vassetzky YS, Razin SV (2012). „Wyraźny rozkład ektopowo wyrażanych wariantów histonów H2A.Bbd i MacroH2A w otwartych i zamkniętych domenach chromatyny” . PLOS JEDEN . 7 (10): e47157. Bibcode : 2012PLoSO...747157I . doi : 10.1371/journal.pone.0047157 . PMC 3484066 . PMID 23118866 .

Linki zewnętrzne

PDBe-KB zawiera przegląd wszystkich informacji o strukturze dostępnych w PDB dla makro-H2A.1 histonu ludzkiego rdzenia