Ludzki gen i białko
HIRA
Dostępne konstrukcje
WPB Wyszukiwanie ortologów:
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
, DGCR1, TUP1, TUPLE1, regulator cyklu komórkowego histonów
Identyfikatory zewnętrzne
Wikidane
Białko HIRA jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen HIRA . Ten gen jest mapowany na 22q11.21, centromerowo na COMT .
Funkcjonować
Specyficzna funkcja tego białka nie została jeszcze określona; spekulowano jednak, że odgrywa rolę w regulacji transkrypcji i / lub metabolizmie chromatyny i histonów .
Badania przeprowadzone przez Salomé Adam, Sophie E. Polo i Geneviève Almouzni wskazują, że białka HIRA biorą udział w ponownym uruchamianiu transkrypcji po uszkodzeniu UVC . Funkcja genu HIRA może być skutecznie zbadana przez knockdown siRNA w oparciu o niezależną walidację.
Znaczenie kliniczne
Jest uważany za główny gen kandydujący w niektórych zespołach haploinsufficiency , takich jak zespół DiGeorge'a , a niewystarczająca produkcja genu może zakłócać normalny rozwój embrionalny.
Organizmy modelowe
Do badania funkcji HIRA wykorzystano organizmy modelowe . Linia myszy z warunkowym nokautem , zwana Hira tm1a (EUCOMM) Wtsi, została wygenerowana w ramach programu International Knockout Mouse Consortium — wysokowydajnego projektu mutagenezy mającego na celu generowanie i dystrybucję zwierzęcych modeli chorób do zainteresowanych naukowców.
Samce i samice zwierząt poddano standaryzowanemu badaniu fenotypowemu w celu określenia skutków delecji. Przeprowadzono dwadzieścia dwa testy na zmutowanych myszach i zaobserwowano dwie znaczące nieprawidłowości. Żadna homozygotyczna zmutowana mysz nie przeżyła do odsadzenia . Pozostałe testy przeprowadzono na heterozygotycznych zmutowanych dorosłych myszach i odnotowano zmniejszoną liczbę komórek leukocytów u samców.
Interakcje
Wykazano, że HIRA oddziałuje z HIST1H2BK .
Dalsza lektura
Lorain S, Demczuk S, Lamour V, Toth S, Aurias A, Roe BA, Lipinski M (1996). „Strukturalna organizacja genu HIRA kodującego białko powtórzeń WD w krytycznym regionie zespołu DiGeorge ludzkiego chromosomu 22” . Genom Res . 6 (1): 43–50. doi : 10.1101/gr.6.1.43 PMID 8681138 .
Llevadot R, Scambler P, Estivill X, Pritchard M (1997). „Organizacja genomowa TUPLE1 / HIRA: gen związany z zespołem DiGeorge'a”. Mamo. Genom . 7 (12): 911–4. doi : 10.1007/s003359900268 . PMID 8995764 . S2CID 35176001 .
Lorain S, Quivy JP, Monier-Gavelle F, Scamps C, Lécluse Y, Almouzni G, Lipinski M (1998). „Histony rdzeniowe i HIRIP3, nowe białko wiążące histony, bezpośrednio oddziałują z białkiem powtórzeń WD HIRA” . Mol. Komórka. Biol . 18 (9): 5546–56. doi : 10.1128/MCB.18.9.5546 . PMC 109139 PMID 9710638 .
Hall C, Nelson DM, Ye X, Baker K, DeCaprio JA, Seeholzer S, Lipinski M, Adams PD (2001). „HIRA, ludzki homolog drożdży Hir1p i Hir2p, jest nowym substratem cyklina-cdk2, którego ekspresja blokuje progresję fazy S” . Mol. Komórka. Biol . 21 (5): 1854–65. doi : 10.1128/MCB.21.5.1854-1865.2001 . PMC86753 . _ PMID 11238922 .
Lorain S, Lécluse Y, Scamps C, Mattéi MG, Lipinski M (2001). „Identyfikacja ludzkiego i mysiego białka 5 oddziałującego z HIRA (HIRIP5), dwóch przedstawicieli ssaków z rodziny konserwowanych filogenetycznie białek odgrywających rolę w biogenezie białek Fe / S” . Biochim. Biofiza. Akta . 1517 (3): 376–83. doi : 10.1016/S0167-4781(00)00300-6 . PMID 11342215 .
Lehner B, Sanderson CM (2004). „Struktura interakcji białek do degradacji ludzkiego mRNA” . Genom Res . 14 (7): 1315–23. doi : 10.1101/gr.2122004 . PMC 442147 PMID 15231747 .
Collins JE, Wright CL, Edwards CA, Davis MP, Grinham JA, Cole CG, Goward ME, Aguado B, Mallya M, Mokrab Y, Huckle EJ, Beare DM, Dunham I (2005). „Oparte na adnotacjach genomu podejście do klonowania ludzkiego ORFeome” . Genom Biol . 5 (10): 84 zł. doi : 10.1186/gb-2004-5-10-r84 . PMC 545604 PMID 15461802 .
Gocke CB, Yu H, Kang J (2005). „Systematyczna identyfikacja i analiza substratów modyfikatorów podobnych do ubikwityny u ssaków” . J. Biol. chemia . 280 (6): 5004-12. doi : 10.1074/jbc.M411718200 PMID 15561718 .
Zhang R, Poustovoitov MV, Ye X, Santos HA, Chen W, Daganzo SM, Erzberger JP, Serebriiskii IG, Canutescu AA, Dunbrack RL, Pehrson JR, Berger JM, Kaufman PD, Adams PD (2005). „Tworzenie ognisk heterochromatyny związanych ze starzeniem się zawierających MacroH2A i starzenie napędzane przez ASF1a i HIRA” . Dev. komórka . 8 (1): 19–30. doi : 10.1016/j.devcel.2004.10.019 PMID 15621527 .
Ahmad A, Kikuchi H, Takami Y, Nakayama T (2005). „Różne role N-końcowych i C-końcowych połówek HIRA w regulacji transkrypcji genów związanych z cyklem komórkowym, które przyczyniają się do kontroli wzrostu komórek kręgowców” . J. Biol. chemia . 280 (37): 32090–100. doi : 10.1074/jbc.M501426200 PMID 16024922 .
Tang Y, Poustovoitov MV, Zhao K, Garfinkel M, Canutescu A, Dunbrack R, Adams PD, Marmorstein R (2006). „Struktura ludzkiego kompleksu ASF1a-HIRA i wgląd w specyfikę zespołu kompleksu opiekuńczego histonów” . Nat. Struktura. Mol. Biol . 13 (10): 921–9. doi : 10.1038/nsmb1147 . PMC 2933817 PMID 16980972 .
Zhang R, Chen W, Adams PD (2007). „Rozbiór molekularny powstawania ognisk heterochromatyny związanych ze starzeniem” . Mol. Komórka. Biol . 27 (6): 2343–58. doi : 10.1128/MCB.02019-06 . PMC 1820509 PMID 17242207 .
Galeria PDB
2i32 : Struktura ludzkiego kompleksu ASF1a-HIRA i wgląd w specyfikę zespołu kompleksu opiekuńczego histonów
