HSUR
| HSUR1 | |
|---|---|
 Konserwatywna struktura drugorzędowa HSUR1.
| |
| Identyfikatory | |
| Symbol | HSUR1 |
| Rfam | RF01802 |
| Inne dane | |
| typ RNA | snRNA |
| Domeny | Herpesvirus saimiri , Herpesvirus ateles |
| Struktury PDB | PDBe |
| HSUR2 | |
|---|---|
 Konserwatywna struktura drugorzędowa HSUR2.
| |
| Identyfikatory | |
| Symbol | HSUR2 |
| Rfam | RF01802 |
| Inne dane | |
| typ RNA | snRNA |
| Domeny | Herpesvirus saimiri , Herpesvirus ateles |
| Struktury PDB | PDBe |
HSUR ( herpesvirus saimiri U RNA) to wirusowe małe regulatorowe RNA . Występują w Herpesvirus saimiri , który jest odpowiedzialny za agresywne białaczki T-komórkowe u naczelnych . Są to jądrowe RNA, które wiążą białka gospodarza , tworząc małe jądrowe rybonukleoproteiny (snRNP). RNA to 114-143 nukleotydów pod względem długości, a rodzina HSUR została podzielona na HSUR ponumerowane od 1 do 7. Funkcja HSUR nie została jeszcze określona; nie wpływają na transkrypcję, więc uważa się, że działają potranskrypcyjnie, potencjalnie wpływając na stabilność mRNA gospodarza .
HSUR1 i 2 są najbardziej konserwatywnymi członkami rodziny w podgrupach HSV. Wykazano, że HSUR1 wiąże heterogenne białko cząstek rybonukleoproteiny gospodarza hnRNPD in vivo . Inne HSUR wiążą HuR/ELAVL1 . Są one transkrybowane przez polimerazę RNA II z promotorami podobnymi do promotorów U RNA
Funkcje wspólne dla wszystkich HSUR obejmują:
- Czapki 5′-trimetyloguanozyny
- 3' końcowe pętle łodygi
- kanoniczne miejsce wiązania białka Sm (AUUUUUG)
Proponowana rola HSUR polega na wykorzystaniu szlaku interferencji RNA (RNAi) do manipulowania ekspresją genów w komórkach gospodarza. Jednym zidentyfikowanym miRNA , który odpowiada na HSUR jest miR-27 .
Zobacz też
Dalsza lektura
- Albrecht JC, Fleckenstein B (kwiecień 1992). „Sekwencja nukleotydowa HSUR 6 i HSUR 7, dwa małe RNA herpeswirusa saimiri” . Kwasy nukleinowe Res . 20 (7): 1810. doi : 10.1093/nar/20.7.1810 . PMC 312282 . PMID 1315960 .
- Lee SI, Murthy SC, Trimble JJ, Desrosiers RC, Steitz JA (sierpień 1988). „Cztery nowe RNA U są kodowane przez wirusa opryszczki”. komórka . 54 (5): 599–607. doi : 10.1016/S0092-8674(88)80004-7 . PMID 2842058 . S2CID 32003539 .
- Cook HL, Mischo HE, Steitz JA (maj 2004). „Małe jądrowe RNA Herpesvirus saimiri rekrutują białka wiążące pierwiastki bogate w AU, ale nie zmieniają poziomów mRNA gospodarza bogatych w pierwiastki AU w transformowanych wirusowo komórkach T” . Mol. Komórka. Biol . 24 (10): 4522–4533. doi : 10.1128/mcb.24.10.4522-4533.2004 . PMC400482 . _ PMID 15121869 .
- Wassarman DA, Lee SI, Steitz JA (luty 1989). „Sekwencja nukleotydowa HSUR 5 RNA z herpeswirusa saimiri” . Kwasy nukleinowe Res . 17 (3): 1258. doi : 10.1093/nar/17.3.1258 . PMC 331759 . PMID 2537954 .
- Lee SI, Steitz JA (sierpień 1990). „RNA Herpesvirus saimiri U są wyrażane i składane w cząsteczki rybonukleoprotein pod nieobecność innych genów wirusowych” . J. Wirol . 64 (8): 3905–3915. doi : 10.1128/JVI.64.8.3905-3915.1990 . PMC 249686 . PMID 2164602 .
- Fan XC, Myer VE, Steitz JA (październik 1997). „Pierwiastki bogate w AU celują w małe jądrowe RNA, a także mRNA w celu szybkiej degradacji” . Geny Dev . 11 (19): 2557–2568. doi : 10.1101/gad.11.19.2557 . PMC 316563 . PMID 9334320 .
- Myer VE, Lee SI, Steitz JA (luty 1992). „Wirusowe małe jądrowe rybonukleoproteiny wiążą białko zaangażowane w destabilizację informacyjnego RNA” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 89 (4): 1296-1300. doi : 10.1073/pnas.89.4.1296 . PMC48436 . _ PMID 1311093 .
- Chou CS, Medveczky MM, Geck P, Vercelli D, Medveczky PG (kwiecień 1995). „Ekspresja IL-2 i IL-4 w limfocytach T transformowanych przez wirusa opryszczki saimiri” . Wirusologia . 208 (2): 418–426. doi : 10.1006/viro.1995.1172 . PMID 7747414 .
- Geck P, Whitaker SA, Medveczky MM, Last TJ, Medveczky PG (styczeń 1994). „Mała ekspresja RNA z regionu onkogennego wysoce onkogennego szczepu herpeswirusa saimiri”. Geny wirusów . 8 (1): 25–34. doi : 10.1007/bf01703599 . PMID 8209420 . S2CID 43914499 .