HTATSF1

HTATSF1
Dostępne konstrukcje
WPB	Wyszukiwanie ortologów:
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, TAT-SF1, TATSF1, dJ196E23.2, HIV-1 Czynnik specyficzny dla Tat 1
Identyfikatory zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek )
Chr.
Koniec
Lokalizacja genu ( mysz )
Chr.
Koniec
Wzór ekspresji RNA
	; ;
Ontologia genów
Funkcja molekularna
Komponent komórkowy
Proces biologiczny
	Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi
	Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka	Wyświetl/edytuj mysz

HIV Tat-specyficzny czynnik 1 jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen HTATSF1 .

Funkcjonować

Podczas gdy większość czynników transkrypcyjnych specyficznych dla sekwencji DNA zwiększa szybkość inicjacji i oddziałuje ze wzmacniaczem lub promotorem DNA, ludzki wirus niedoboru odporności-1 (HIV-1) Tat głównie stymuluje wydłużanie i oddziałuje z elementem RNA reagującym na trans (TAR). Tat jest niezbędny do replikacji wirusa HIV.

Wykazano również, że HTATSF1 bierze udział w zatrzymywaniu intronów i jest związany ze splicingiem mRNA, które kodują białka rybosomalne. Jest to również związane z naiwnym stanem pluripotentnym, chociaż związek jest złożony i silnie wpływają na niego inne czynniki pluripotencji, takie jak Nanog i KLF2 .

Interakcje

Wykazano, że HTATSF1 oddziałuje z SUPT5H i GTF2F2 .

Dalsza lektura

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: prosta metoda zastąpienia struktury czapeczki eukariotycznych mRNA oligorybonukleotydami”. gen . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K i in. (1997). „Konstrukcja i charakterystyka biblioteki cDNA wzbogaconej o pełnej długości i wzbogaconej o koniec 5'”. gen . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
Zhou Q, Chen D, Pierstorff E, Luo K (1998). „Czynnik wydłużenia transkrypcji P-TEFb pośredniczy w aktywacji Tat transkrypcji HIV-1 na wielu etapach” . EMBO J. 17 (13): 3681–91. doi : 10.1093/emboj/17.13.3681 . PMC 1170704 . PMID 9649438 .
Yan D, Perriman R, Igel H i in. (1998). „CUS2, drożdżowy homolog ludzkiego Tat-SF1, ratuje funkcję nieprawidłowo sfałdowanego U2 poprzez niezwykły motyw rozpoznawania RNA” . Mol. Komórka. Biol . 18 (9): 5000–9. doi : 10.1128/MCB.18.9.5000 . PMC 109085 . PMID 9710584 .
Li XY, zielony MR (1998). „Koaktywator komórkowy HIV-1 Tat Tat-SF1 jest ogólnym czynnikiem wydłużającym transkrypcję” . Geny Dev . 12 (19): 2992-6. doi : 10.1101/gad.12.19.2992 . PMC 317190 . PMID 9765201 .
Parada CA, Roeder RG (1999). „Nowy kompleks zawierający polimerazę RNA II wzmacnia wzmocnioną przez Tat transkrypcję HIV-1” . EMBO J. 18 (13): 3688–701. doi : 10.1093/emboj/18.13.3688 . PMC 1171446 . PMID 10393184 .
Kim JB, Yamaguchi Y, Wada T i in. (1999). „Białko Tat-SF1 wiąże się z białkami RAP30 i ludzkimi SPT5” . Mol. Komórka. Biol . 19 (9): 5960–8. doi : 10.1128/mcb.19.9.5960 . PMC84462 . _ PMID 10454543 .
Fong YW, Zhou Q (2000). „Zwolnienie dwóch wbudowanych mechanizmów autoinhibicji w P-TEFb jest wymagane do złożenia wieloskładnikowego kompleksu wydłużania transkrypcji w promotorze ludzkiego wirusa niedoboru odporności typu 1” . Mol. Komórka. Biol . 20 (16): 5897–907. doi : 10.1128/MCB.20.16.5897-5907.2000 . PMC86067 . _ PMID 10913173 .
Sune C, Goldstrohm AC, Peng J i in. (2000). „System transkrypcji in vitro, który podsumowuje hamowanie Tat za pośrednictwem wirusa niedokrwistości zakaźnej koni za pośrednictwem wirusa niedoboru odporności typu 1 Tat, wykazuje rolę dodatniego czynnika wydłużenia transkrypcji b i powiązanych białek w mechanizmie aktywacji Tat” . Wirusologia . 274 (2): 356–66. doi : 10.1006/viro.2000.0480 . PMID 10964778 .
Simmons A, Aluvihare V, McMichael A (2001). „Nef wyzwala program transkrypcji w komórkach T, naśladując aktywację komórek T z pojedynczym sygnałem i indukując mediatory wirulencji HIV” . Odporność . 14 (6): 763–77. doi : 10.1016/S1074-7613(01)00158-3 . PMID 11420046 .
Fong YW, Zhou Q (2002). „Pobudzający wpływ czynników splicingowych na wydłużenie transkrypcji”. Natura . 414 (6866): 929–33. doi : 10.1038/414929a . PMID 11780068 . S2CID 1518837 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH i in. (2003). „Generowanie i wstępna analiza ponad 15 000 pełnej długości sekwencji cDNA człowieka i myszy” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Zhou BY, On JJ (2004). „Hamowanie proliferacji astrocytów, neuronów i komórek innych niż glejowe przez ekspresję wewnątrzkomórkową ludzkiego wirusa niedoboru odporności typu 1 (HIV-1) Tat” . Neuronauka. Lett . 359 (3): 155-8. doi : 10.1016/j.neulet.2004.02.012 . PMID 15050687 . S2CID 3048557 .
Ballif BA, Villén J, Beausoleil SA i in. (2005). „Analiza fosfoproteomiczna rozwijającego się mózgu myszy” . Mol. Komórka. Proteomika . 3 (11): 1093–101. doi : 10.1074/mcp.M400085-MCP200 . PMID 15345747 .
Smith MJ, Kulkarni S, Pawson T (2004). „Domeny FF CA150 wiążą czynniki transkrypcyjne i splicingowe poprzez wiele słabych interakcji” . Mol. Komórka. Biol . 24 (21): 9274–85. doi : 10.1128/MCB.24.21.9274-9285.2004 . PMC 522232 . PMID 15485897 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA i in. (2004). „Stan, jakość i ekspansja projektu cDNA pełnej długości NIH: Kolekcja genów ssaków (MGC)” . Genom Res . 14 (10B): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Zhou M, Deng L, Lacoste V i in. (2004). „Koordynacja fosforylacji czynników transkrypcyjnych i metylacji histonów przez kinazę P-TEFb podczas transkrypcji ludzkiego wirusa niedoboru odporności typu 1” . J. Wirol . 78 (24): 13522–33. doi : 10.1128/JVI.78.24.13522-13533.2004 . PMC 533906 . PMID 15564463 .
Ross MT, Grafham DV, Coffey AJ i in. (2005). „Sekwencja DNA ludzkiego chromosomu X” . Natura . 434 (7031): 325–37. Bibcode : 2005Natur.434..325R . doi : 10.1038/natura03440 . PMC 2665286 . PMID 15772651 .
Missé D, Gajardo J, Oblet C i in. (2005). „Rozpuszczalny HIV-1 gp120 zwiększa replikację HIV-1 w niedzielących się komórkach T CD4 +, za pośrednictwem sygnalizacji komórkowej i nadekspresji kofaktora Tat” . AIDS . 19 (9): 897–905. doi : 10.1097/01.aids.0000171403.07995.92 . PMID 15905670 . S2CID 23688259 .