Interferencja pentanu

Interferencja pentanu lub interakcja syn -pentan jest przeszkodą steryczną , której doświadczają dwie końcowe grupy metylowe w jednej z konformacji chemicznych n -pentanu . Możliwymi konformacjami są kombinacje konformacji anty i konformacji typu gauche i są to anty-anty, anty-gauche ⁺ , gauche ⁺ - gauche ⁺ i gauche ⁺ - gauche ^- z których ten ostatni jest szczególnie niekorzystny energetycznie. W makrocząsteczkach takich jak pentan polietylenowy interferencja zachodzi pomiędzy co piątym atomem węgla. Oddziaływania 1,3-diosiowe pochodnych cykloheksanu są szczególnym przypadkiem tego typu oddziaływań, chociaż w tym przypadku występują dodatkowe oddziaływania gauche wspólne dla podstawników i pierścienia. Wyraźny przykład interakcji syn -pentan jest widoczny w dwuosiowym i dwukwatorialnym cieple tworzenia cis 1,3-dialkilocykloheksany. W stosunku do konformera diekwatorialnego, konformer dwuosiowy ma o 2-3 kcal/mol wyższą energię niż wartość, której można by oczekiwać na podstawie samych interakcji gauche . Interferencja pentanu pomaga wyjaśnić geometrię molekularną wielu związków chemicznych, stosunków produktów i rzekomych stanów przejściowych. Jeden specyficzny rodzaj syn -pentan jest znany jako szczep allilowy 1,3 lub ( szczep A ^{1,3 ).}

Na przykład w niektórych adduktach aldolowych z 2,6-dipodstawionymi grupami arylowymi geometria molekularna ma sąsiednie atomy wodoru w konfiguracji antyperiplanarnej zarówno w sieci krystalicznej ( dyfrakcja rentgenowska ), jak iw protonie w roztworze (stałe sprzężenia NMR) zwykle zarezerwowane dla grup o największej masie id obu arenów:

Innym czynnikiem przyczyniającym się do wyjaśnienia tej konformacji jest zmniejszenie naprężenia allilowego poprzez zminimalizowanie kąta dwuściennego między podwójnym wiązaniem arenu a protonem metinowym .

Interakcje syn-pentan są odpowiedzialne za zależność od konformacji szkieletu częstotliwości rotamerów łańcucha bocznego białka i ich średnich kątów dwuściennych, co wynika z analizy statystycznej rotamerów łańcucha bocznego białka w bibliotece rotamerów zależnych od szkieletu .