KDM1A
| KDM1A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Identyfikatory | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| , AOF2, BHC110, KDM1, LSD1, CPRF, demetylaza lizyny 1A | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Identyfikatory zewnętrzne | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikidane | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Specyficzna dla lizyny demetylaza histonowa 1A (LSD1), znana również jako demetylaza 1A specyficzna dla lizyny (K) (KDM1A), jest ludzkim białkiem kodowanym przez gen KDM1A . LSD1 jest zależną od flawiny oksydazą monoaminową , która może demetylować mono- i dimetylowane lizyny , w szczególności histon 3, lizyny 4 i 9 (H3K4 i H3K9). Enzym ten może odgrywać kluczową rolę w embriogenezie i różnicowaniu tkankowo-specyficznym , a także wzrost oocytów. KDM1A była pierwszą odkrytą demetylazą histonową, chociaż opisano ponad 30.
Struktura
Ten gen koduje białko jądrowe zawierające domenę SWIRM, motyw wiążący FAD i domenę oksydazy aminowej . Białko to jest składnikiem kilku deacetylazy histonowej , chociaż wycisza geny, działając jako demetylaza histonowa.
Funkcjonować
LSD1 (demetylaza specyficzna dla lizyny 1), znana również jako KDM1, jest pierwszą z kilku odkrytych demetylaz białkowych lizyny . Poprzez zależną od FAD reakcję oksydacyjną, LSD1 specyficznie usuwa histon H3K4me2 do H3K4me1 lub H3K4me0. Tworząc kompleks z receptorem androgenowym (i prawdopodobnie innymi jądrowymi receptorami hormonalnymi ), LSD1 zmienia swoje substraty na H3K9me2. Obecnie wiadomo, że kompleks LSD1 pośredniczy w skoordynowanej histonów poprzez aktywność enzymatyczną, jak również czytniki modyfikacji histonów w kompleksie.
Funkcja genu KDM1A może być skutecznie zbadana przez knockdown siRNA w oparciu o niezależną walidację.
Interakcje
KDM1A ma wielu różnych partnerów wiążących, co może być niezbędne do jego aktywności demetylacyjnej. W ostrej białaczce szpikowej (AML) ostatecznie wykazano, że GFI1B utrzymuje interakcję z KDM1A, która jest niezbędna do proliferacji choroby. Istnieją również dowody na rolę interakcji KDM1A z jądrowym GSK3β w promowaniu progresji niektórych nowotworów. Stwierdzono, że wysokie poziomy jądrowego GSK3β promują wiązanie KDM1A z deubikwitynazą USP22, co zapobiega rozkładowi KDM1A i powoduje jego gromadzenie się na wyższych poziomach. Akumulacja KDM1A została skorelowana z progresją nowotworu w niektórych nowotworach, w tym glioblastoma , białaczka i kostniakomięsak.
Znaczenie kliniczne
Wydaje się, że KDM1A odgrywa ważną rolę w epigenetycznym „ przeprogramowaniu”, które ma miejsce, gdy plemnik i komórka jajowa łączą się, tworząc zygotę. Delecja genu dla KDM1A może mieć wpływ na wzrost i różnicowanie embrionalnych komórek macierzystych . Delecja w embrionach myszy jest śmiertelna; zarodki nie rozwijają się poza dzień 7.5. Uważa się również, że KDM1A odgrywa rolę w raku, ponieważ gorsze wyniki mogą być skorelowane z wyższą ekspresją tego genu. Dlatego hamowanie KDM1A może być możliwym sposobem leczenia raka. KDM1A ma tendencję do nadekspresji w komórkach nowotworowych niektórych nowotworów, takich jak rak pęcherza moczowego, płuc i jelita grubego. Specyficzność nadekspresji KDM1A w tych nowotworach stwarza potencjał dla ukierunkowanych terapii molekularnych, poprzez zastosowanie siRNA specyficznych dla KDM1A.
Mutacje
Mutacje de novo w KDM1A odnotowano u trzech pacjentów, z których każdy miał opóźnienia rozwojowe, które uważa się za częściowo związane z mutacjami. Wszystkie udokumentowane mutacje są substytucjami zmiany sensu. Jedna z dotkniętych rodzin stworzyła publiczną stronę internetową w celu zidentyfikowania dalszych przypadków.
Zobacz też
Linki zewnętrzne
- lizyna + specyficzna + demetylaza + 1, + człowiek w US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
- Przegląd wszystkich informacji strukturalnych dostępnych w PDB dla UniProt : O60341 (specyficzna dla lizyny demetylaza histonowa 1A) w PDBe-KB .
Ten artykuł zawiera tekst z Narodowej Biblioteki Medycznej Stanów Zjednoczonych , która jest własnością publiczną .