Karen Miga

Karen H. Miga
Urodzić się	Karen Elżbieta Hayden
Znany z	Projekt Telomere to Telomere
Kariera naukowa
Instytucje	Uniwersytet Kalifornijski w Santa Cruz
Praca dyplomowa	Genomowa definicja centromerów w złożonych genomach (2011)
Doradca doktorski	Huntingtona Willarda
Strona internetowa	https://www.migalab.com/

Karen Elizabeth Hayden Miga jest amerykańską genetyczką, która współprzewodniczy konsorcjum Telomere -to-Telomore (T2T), które w marcu 2022 r. udostępniło w pełni kompletny zestaw ludzkiego genomu. Jest adiunktem inżynierii biomolekularnej na Uniwersytecie Kalifornijskim w Santa Cruz i zastępca dyrektora Human Pangenomics w UC Santa Cruz Genomics Institute . Została wymieniona jako „One to Watch” w 2020 Nature's 10 i jedna z najbardziej wpływowych osób Time 100 w 2022 roku.

Badania i kariera

W 2012 roku Miga dołączył do laboratorium Davida Hausslera na Uniwersytecie Kalifornijskim w Santa Cruz . Na UCSC łączyła podejście obliczeniowe i eksperymentalne. Tam przewodzi konsorcjum telomer-telomer (T2T), społecznościowemu wysiłkowi, którego celem jest pełne sekwencjonowanie i składanie ludzkiego genomu. Jej wysiłki badawcze wykorzystują długo czytane strategie sekwencjonowania. Wykorzystuje MinION firmy Oxford Nanopore Technologies , który analizuje DNA, wykrywając zmiany w przepływie prądu, gdy DNA przechodzi przez nanopory w błonie.

Miga jest dyrektorem Centrum Produkcji Ludzkiego Pangenomu, które stara się przyczynić do powstania kolejnej mapy referencyjnej ludzkiego pangenomu poprzez stworzenie 350 diploidalnych genomów T2T. Ta mapa będzie wspierać rozwój spersonalizowanych terapii.

Wybrane publikacje

•    Miga, Karen H.; Koren, Siergiej; Rhie, Arang; Vollger, Mitchell R.; Gershman, Ariel; Bzikadze, Andrzej; Brooks, Shelise; Howe, Edmund; Porubski, Dawid; Logsdon, Glennis A.; Schneider, Valerie A. (2020). „Zespół telomerów do telomerów kompletnego ludzkiego chromosomu X” . Natura . 585 (7823): 79–84. Bibcode : 2020Natur.585...79M . doi : 10.1038/s41586-020-2547-7 . PMC 7484160 . PMID 32663838 .
•    Konsorcjum analizy sekwencjonowania szympansów (2005). „Początkowa sekwencja genomu szympansa i porównanie z genomem człowieka” . Natura . 437 (7055): 69–87. Bibcode : 2005Natur.437...69. . doi : 10.1038/natura04072 . ISSN 0028-0836 . PMID 16136131 .
•     Rosenbloom, Kate R.; Armstrong, Joel; Fryzjer, Galt P.; Kacper, Jonathan; Clawson, Hiram; Diekhans, Marek; Dreszer, Timothy R.; Fujita, Pauline A.; Guruvadoo, Luvina; Haeussler, Maksymilian; Harte, Rachel A. (2015-01-28). „Baza danych przeglądarki genomu UCSC: aktualizacja 2015” . Badania kwasów nukleinowych . 43 (D1): D670-D681. doi : 10.1093/nar/gku1177 . ISSN 0305-1048 . PMC 4383971 . PMID 25428374 .
•     Jain, Miten; Koren, Siergiej; Miga, Karen H.; Szybko, Josh; Rand, Artur C.; Sasani, Thomas A.; Tyson, John R.; Beggs, Andrew D.; Dilthey, Aleksander T.; Fiddes, Ian T.; Malla, Sunir (2018). „Sekwencjonowanie nanoporów i składanie ludzkiego genomu z bardzo długimi odczytami” . Biotechnologia przyrody . 36 (4): 338–345. doi : 10.1038/nbt.4060 . ISSN 1546-1696 . PMC 5889714 . PMID 29431738 .

Linki zewnętrzne

• Karen Miga indeksowane przez Google Scholar