Nazwa |
Opis |
system operacyjny |
Licencja |
Strona |
BioTapestry
|
interaktywne narzędzie do budowania, wizualizacji i symulacji genetycznych sieci regulacyjnych |
wieloplatformowy (oparty na Javie) |
LGPL |
[8]
|
Cytoscape
|
integracja danych, wizualizacja i analiza sieci |
wieloplatformowy (oparty na Javie) |
LGPL |
[9]
|
GenMAPP
|
wizualizować i analizować dane genomowe w kontekście ścieżek |
Okna |
Licencja Apache |
[10]
|
MATLAB
|
narzędzie do modelowania, symulacji i analizy dynamicznych systemów biologicznych |
Windowsa, Linuksa, macOS |
Prawnie zastrzeżony |
[11]
|
MEGA
|
bezpłatne, online, open-source, analiza filogenetyczna, rysowanie dendrogramów itp. |
Windows/DOS-Win/Mac/Linux |
Oprogramowanie współdzielone |
[12]
|
PathVisio
|
narzędzie do wyświetlania i edycji ścieżek biologicznych |
wieloplatformowy (oparty na Javie) |
Licencja Apache |
[13]
|
InCroMAP |
narzędzie do integracji danych omicznych i wspólnej wizualizacji danych eksperymentalnych w ścieżkach |
wieloplatformowy (oparty na Javie) |
LGPL |
[14]
|
Widok ścieżki |
integracja i wizualizacja danych oparta na ścieżce, łatwa w użyciu i zintegrowana z analizą ścieżki |
wieloplatformowy (R/Bioconductor) |
GPL |
[15] [16]
|
SBMLDDiagramy |
Python API do wyświetlania i edytowania układu/rozszerzenia renderowania SBML |
wieloplatformowy |
MIT |
[17]
|
Systrip
|
analiza danych szeregów czasowych w kontekście sieci biologicznych |
Windowsa , Linuksa
|
LGPL , GPL
|
[18]
|