Gen kodujący białko u gatunku Homo sapiens
MAP1LC3A
Dostępne konstrukcje
WPB Wyszukiwanie ortologów:
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
, ATG8E, LC3, LC3A, MAP1ALC3, MAP1BLC3, białko związane z mikrotubulami 1 łańcuch lekki 3 alfa
Identyfikatory zewnętrzne
Wikidane
Białka związane z mikrotubulami Łańcuch lekki 1A/1B 3A jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen MAP1LC3A . Dla tego genu znaleziono dwa warianty transkryptu kodujące różne izoformy.
Funkcjonować
MAP1A i MAP1B to białka związane z mikrotubulami , które pośredniczą w fizycznych interakcjach między mikrotubulami a składnikami cytoszkieletu . Każda z MAP1A i MAP1B składa się z podjednostki łańcucha ciężkiego i wielu podjednostek łańcucha lekkiego. Białko kodowane przez ten gen jest jedną z podjednostek łańcucha lekkiego i może łączyć się z MAP1A lub MAP1B.
MAPLC3A jest jednym z ssaczych homologów drożdży ATG8 , ważnym markerem i efektorem autofagii .
Rozporządzenie
MAP1LC3A jest regulowany przez kilka modyfikacji potranslacyjnych . Obejmują one kowalencyjne wiązanie C-końca z fosfatydyloetanoloaminą w błonach autofagicznych oraz fosforylację przez kinazę białkową A , która obniża jej funkcje autofagii. Interakcje niekowalencyjne są ważne dla funkcji kierowania ładunku w selektywnej autofagii. Na przykład wykazano, że oddziałuje z sekwestosomem 1 .
Dalsza lektura
Snásel J, Pichová I (1997). „Rozszczepienie białek komórki gospodarza przez proteazę HIV-1”. Folia Biol. (Praga) . 42 (5): 227–30. doi : 10.1007/BF02818986 . PMID 8997639 . S2CID 7617882 .
Wallin M, Deinum J, Goobar L, Danielson UH (1990). „Proteolityczne rozszczepianie białek związanych z mikrotubulami przez retrowirusowe proteinazy” . J. Gen. Wirol . 71 (9): 1985–91. doi : 10.1099/0022-1317-71-9-1985 PMID 2212989 .
Schoenfeld TA, McKerracher L, Obar R, Vallee RB (1989). „MAP 1A i MAP 1B są strukturalnie pokrewnymi białkami związanymi z mikrotubulami o różnych wzorcach rozwojowych w OUN” . J. Neurosci . 9 (5): 1712–30. doi : 10.1523/JNEUROSCI.09-05-01712.1989 PMC 6569839 PMID 2470876 .
Mann SS, Hammarback JA (1994). „Charakterystyka molekularna łańcucha lekkiego 3. Podjednostka wiążąca mikrotubule MAP1A i MAP1B” . J. Biol. chemia . 269 (15): 11492-7. doi : 10.1016/S0021-9258(19)78150-2 PMID 7908909 .
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonowanie DNA przy użyciu rekombinacji specyficznej dla miejsca in vitro” . Genom Res . 10 (11): 1788–95. doi : 10.1101/gr.143000 . PMC 310948 PMID 11076863 .
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R i in. (2001). „W kierunku katalogu ludzkich genów i białek: sekwencjonowanie i analiza 500 nowych kompletnych ludzkich cDNA kodujących białka” . Genom Res . 11 (3): 422–35. doi : 10.1101/gr.GR1547R . PMC 311072 PMID 11230166 .
Bonnet C, Boucher D, Lazereg S i in. (2001). „Różnicowa regulacja wiązania białek związanych z mikrotubulami MAP1A, MAP1B i MAP2 przez poliglutamylację tubuliny” . J. Biol. chemia . 276 (16): 12839–48. doi : 10.1074/jbc.M011380200 PMID 11278895 .
Deloukas P, Matthews LH, Ashurst J i in. (2002). „Sekwencja DNA i analiza porównawcza ludzkiego chromosomu 20” . Natura . 414 (6866): 865–71. Bibcode : 2001Natur.414..865D . doi : 10.1038/414865a PMID 11780052 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH i in. (2003). „Generowanie i wstępna analiza ponad 15 000 pełnej długości sekwencji cDNA człowieka i myszy” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 PMC 139241 PMID 12477932 .
He H, Dang Y, Dai F i in. (2003). „Modyfikacje potranslacyjne trzech członków ludzkiej rodziny MAP1LC3 i wykrywanie nowego typu modyfikacji dla MAP1LC3B” . J. Biol. chemia . 278 (31): 29278–87. doi : 10.1074/jbc.M303800200 PMID 12740394 .
Tanida I, Sou YS, Ezaki J i in. (2004). „HsAtg4B / HsApg4B / autophagin-1 rozszczepia końce karboksylowe trzech ludzkich homologów Atg8 i usuwa lipidy związane z mikrotubulami białkowy łańcuch lekki 3- i związany z receptorem GABAA koniugaty białko-fosfolipid” . J. Biol. chemia . 279 (35): 36268–76. doi : 10.1074/jbc.M401461200 PMID 15187094 .
Kouno T, Mizuguchi M, Tanida I i in. (2005). „Przypisania rezonansowe 1H, 13C i 15N ludzkiego łańcucha lekkiego-3 białka związanego z mikrotubulami”. J. Biomol. NMR . 29 (3): 415–6. doi : 10.1023/B:JNMR.0000032505.99071.ea . PMID 15213446 . S2CID 23561733 .
Goehler H, Lalowski M, Stelzl U, et al. (2004). „Sieć interakcji białek łączy GIT1, wzmacniacz agregacji huntingtyny, z chorobą Huntingtona” . Mol. komórka . 15 (6): 853–65. doi : 10.1016/j.molcel.2004.09.016 PMID 15383276 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA i in. (2004). „Stan, jakość i ekspansja projektu cDNA pełnej długości NIH: kolekcja genów ssaków (MGC)” . Genom Res . 14 (10B): 2121-7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 PMID 15489334 .
Wiemann S, Arlt D, Huber W i in. (2004). „Od ORFeome do biologii: funkcjonalny rurociąg genomiczny” . Genom Res . 14 (10B): 2136–44. doi : 10.1101/gr.2576704 . PMC 528930 PMID 15489336 .
Kouno T, Mizuguchi M, Tanida I i in. (2005). „Struktura rozwiązania łańcucha lekkiego 3 białka związanego z mikrotubulami i identyfikacja jego funkcjonalnych subdomen” . J. Biol. chemia . 280 (26): 24610–7. doi : 10.1074/jbc.M413565200 PMID 15857831 .
Sou YS, Tanida I, Komatsu M i in. (2006). „Fosfatydyloseryna oprócz fosfatydyloetanoloaminy jest celem in vitro ssaków modyfikatorów Atg8, LC3, GABARAP i GATE-16” . J. Biol. chemia . 281 (6): 3017–24. doi : 10.1074/jbc.M505888200 PMID 16303767 .
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I i in. (2006). „Baza danych LIFEdb w 2006 roku” . Kwasy nukleinowe Res . 34 (problem z bazą danych): D415–8. doi : 10.1093/nar/gkj139 . PMC 1347501 PMID 16381901 .
