MiRTarBase
 | |
| Treść | |
|---|---|
| Opis | Eksperymentalnie potwierdzone interakcje mikroRNA -cel (MTI). |
| Przechwycone typy danych |
interakcje miRNA-cel |
| Kontakt | |
| Centrum Badań | Narodowy Uniwersytet Chiao Tung |
| Laboratorium | Instytut Bioinformatyki i Biologii Systemów |
| Autorski | Sheng-Da Hsu |
| Cytowanie podstawowe | Hsu & al. (2011) |
| Data wydania | 2013 |
| Dostęp | |
| Strona internetowa | http://mirtarbase.cuhk.edu.cn |
| Pobierz URL | http://mirtarbase.cuhk.edu.cn/php/download.php |
| Różnorodny | |
| Wersja | 4.5 |
miRTarBase to wyselekcjonowana baza danych interakcji mikroRNA-cel. Jako baza danych miRTarBase zgromadziła ponad pięćdziesiąt tysięcy interakcji miRNA-target (MTI), które są gromadzone poprzez ręczne przeglądanie odpowiedniej literatury po systematycznym eksplorowaniu danych w celu filtrowania artykułów naukowych związanych z badaniami funkcjonalnymi miRNA. Ogólnie, zebrane MTI są weryfikowane eksperymentalnie za pomocą testu reporterowego, western blot, mikromacierzy i eksperymentów sekwencjonowania nowej generacji. Zawierając największą liczbę zweryfikowanych MTI, miRTarBase zapewnia najbardziej aktualny zbiór w porównaniu z innymi podobnymi, wcześniej opracowanymi bazami danych.
Zobacz też
- ^ a b Hsu SD, Lin FM, Wu WY, Liang C, Huang WC, Chan WL, Tsai WT, Chen GZ, Lee CJ, Chiu CM, Chien CH, Wu MC, Huang CY, Tsou AP, Huang HD (2011) . „miRTarBase: baza danych zarządza eksperymentalnie potwierdzonymi interakcjami mikroRNA-cel” . Badania kwasów nukleinowych . 39 (problem z bazą danych): D163-9. doi : 10.1093/nar/gkq1107 . PMC 3013699 . PMID 21071411 .
Linki zewnętrzne