NBPF15
| Identyfikatory | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NBPF15 , AB14, AG3, NBPF16, członek rodziny punktów przerwania nerwiaka niedojrzałego 15, członek NBPF 15, | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| identyfikatory zewnętrzne | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MGC8902 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikidane | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Rodzina punktów przerwania nerwiaka niedojrzałego, członek 15 , znana również jako NBPF15 , jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen NBPF15 . Gen ma długość 18762 pz, a mRNA ma długość 3837 pz. Gen znajduje się na chromosomie 1q21.1. Przewiduje się, że jego lokalizacja subkomórkowa znajduje się w jądrze i cytoplazmie . Zawiera tak zwane powtórzenie NBPF , które jest dwuegzonem odcinek sekwencji, który jest charakterystyczny dla wszystkich 21 członków rodziny genów NBPF. Powtórzenie jest uważane za eksony przodków, a rodzina NBPF została powiązana z ewolucją naczelnych.
Funkcjonować
Funkcja NBPF16 nie jest w pełni poznana. Jest członkiem rodziny białek NBPF, które zostały powiązane z możliwymi rolami w onkogenezie i genach supresorowych nowotworów .
Białko
Białko składa się z 670 aminokwasów . Gen zawiera pięć domen o nieznanej funkcji, zwanych DUF1220 . Domeny DUF1220 znajdują się u wszystkich członków rodziny genów NBPF, chociaż liczba różni się między poszczególnymi członkami. Powtarzalna struktura z wysoką konserwacją sekwencji międzygenowych i wewnątrzgenowych, zarówno w regionach kodujących, jak i niekodujących. Umożliwia łatwe zajście rekombinacji homologicznej między różnymi allelami. Uważa się, że powtarzalność tego i innych członków rodziny genów NBPF wynika z segmentowych duplikacji na chromosomie 1.
Przewidywane właściwości
Właściwości NBPF16, które zostały przewidziane za pomocą narzędzi bioinformatycznych :
- Masa cząsteczkowa: 76 kD
- Punkt izoelektryczny : 4,43
- Modyfikacja potranslacyjna : nie przewidziano.
- Brak przewidywanego peptydu sygnałowego lub miejsca cięcia peptydu sygnałowego.
- Brak oddziałujących białek lub partnerów wiążących.
Wyrażenie
Dostępnych jest niewiele danych dotyczących ekspresji tego genu lub nie ma ich wcale, ale większość wskazań wskazuje na to, że jest on wszechobecny w całym ciele.
Homologia
ortologi
Poza naczelnymi nie ma wielkich ortologów . Te ortologi zostały zebrane z BLAT. i wyszukiwania BLAST
| Gatunek | Nazwa zwyczajowa organizmu | Tożsamość sekwencji | Podobieństwo sekwencji | Długość (AA) | |
| Homo sapiens | Człowiek | 100% | 100% | 670 | |
| Panowie troglodyci | Szympans | 90% | 92% | 509 | |
| Macaca Mulat | Makak rezus | 57% | 68% | 620 | |
| Gallus gallus | Kurczak | 36% | 54% | 1394 | |
| Rattus norvegicus | Norweski szczur | 34% | 67% | 2324 | |
| Bos byk | Bydło | 34% | 50% | 816 | |
| Xenopus laevis | Afrykańska żaba szponiasta | 33% | 52% | 728 | |
| Mus musculus | Mysz domowa | 32% | 55% | 2446 | |
Paralogi
Ponieważ istnieje 21 innych członków rodziny genów NBPF, istnieje 21 paralogów NBPF16. Wszystkie wykazują wysoką konserwację i powtarzalność struktur.
Dalsza lektura
- Sierpień 2006, Ker Than 31 (31 sierpnia 2006). „Gen mózgu może pomóc uczynić nas ludźmi” . lifescience.com . Źródło 23 kwietnia 2020 r .