Niallia
| Klasyfikacja naukowa | |
|---|---|
| Niallii | |
| Domena: | |
| Gromada: | |
| Klasa: | |
| Zamówienie: | |
| Rodzina: | |
| Rodzaj: |
Niallia Gupta i in. 2020
|
| Gatunek | |
Informacje na podstawie LPSN 2021 |
|
Niallia to rodzaj Gram-dodatnich bakterii w kształcie pałeczek z rodziny Bacillaceae z rzędu Bacillales . Gatunkiem typowym tego rodzaju jest Niallia circulans.
Członkowie Niallia byli wcześniej gatunkami należącymi do Bacillus , rodzaju, który od dawna jest uznawany przez społeczność naukową za wykazujący rozległą heterogeniczność polifiliczną i filogenetyczną ze względu na niejasne kryteria stosowane wcześniej do przypisywania gatunków do tego kladu. Opublikowano wiele badań z wykorzystaniem porównawczych analiz filogenetycznych w celu wyjaśnienia ewolucyjnych relacji między Bacillus , co doprowadziło do powstania wielu nowych rodzajów, takich jak Alkalihalobacillus , Brevibacillus , Solibacillus , Alicyclobacillus , Virgibacillus i Evansella . Ponadto rodzaj Bacillus został ograniczony do gatunków blisko spokrewnionych z Bacillus subtilis i Bacillus cereus .
Nazwa Niallia została nazwana na cześć brytyjskiego mikrobiologa, profesora Nialla A. Logana (Glasgow Caledonian University), za jego liczne wkłady w systematykę i zastosowania członków rodzaju Bacillus .
Charakterystyka biochemiczna i podpisy molekularne
Członkowie tego rodzaju są fakultatywnie beztlenowi i znajdują się w różnych miejscach, takich jak gleba, ścieki, żywność i ludzkie odchody. Wszyscy członkowie są ruchliwi i wytwarzają przetrwalniki. Optymalna temperatura wzrostu dla Nialli mieści się w przedziale 30-37°C. Niallia circulans jest ważną bakterią stosowaną w akwakulturze, bioremediacji, uzdatnianiu wody i produkcji enzymów. Jest również patogenem oportunistycznym, który może wywołać posocznicę u pacjentów z obniżoną odpornością. Dwa zachowane indele sygnaturowe (CSI) zostały zidentyfikowane jako unikalne dla tego rodzaju w białku zawierającym domenę GAF i ligazie DNA D , które w większości przypadków są wspólne wyłącznie dla wszystkich lub większości członków tego rodzaju. Te CSI zostały zidentyfikowane na podstawie analiz sekwencji genomu Niallia i zapewniają niezawodny sposób na odróżnienie Niallia od innych rodzajów i bakterii Bacillaceae na poziomie molekularnym.
Taksonomia
Niallia według stanu na maj 2021 zawiera łącznie 5 gatunków z ważnie opublikowanymi nazwami. Ten rodzaj został zidentyfikowany jako monofiletyczny klad i filogenetycznie niezwiązany z innymi gatunkami Bacillus w badaniach badających związki taksonomiczne w obrębie Bacillus . Ten wzór rozgałęzień obserwuje się również w bazie danych taksonomii genomu (GTDB).
Stwierdzono również, że nieprawidłowo opublikowany gatunek „Bacillus tuaregi” grupuje się z innymi członkami Niallia w drzewach filogenetycznych, a także ma te same markery molekularne w postaci konserwatywnych indeli sygnaturowych (CSI). Jednak jego przeniesienie nie zostało oficjalnie zaproponowane ze względu na brak informacji o szczepie kultury. Konieczna jest dalsza rewizja tego rodzaju, ponieważ odkryto i przypisano dodatkowe genomy i nowe gatunki.