pałeczki

Bacillus subtilis Gram.jpg
Bacilli
Bacillus subtilis , barwienie metodą Grama
Klasyfikacja naukowa
Domena: Bakteria
Gromada: Bacillota
Klasa:
Bacilli Ludwig i in. 2010
Zamówienia
Synonimy
  • „Bacillia” Oren, Parte i Garrity 2016
  • Desulfuribacillia Sorokin et al. 2021
  • Firmibacteria Murray 1988
  • Teichobacteria Cavalier-Smith 2002

Bacilli to taksonomiczna klasa bakterii , która obejmuje dwa rzędy, Bacillales i Lactobacillales , które zawierają kilka dobrze znanych patogenów, takich jak Bacillus anthracis (przyczyna wąglika ). Bacilli to prawie wyłącznie bakterie Gram-dodatnie .

Nazwa Bacillus pisana wielką literą i kursywą odnosi się do określonego rodzaju bakterii. Nazwa Bacilli, pisana wielką literą, ale bez kursywy, może również odnosić się do mniej specyficznej taksonomicznej grupy bakterii, która obejmuje dwa rzędy, z których jeden zawiera rodzaj Bacillus . Gdy słowo jest sformatowane małymi literami i nie jest pisane kursywą, „bacillus”, najprawdopodobniej będzie odnosić się do kształtu, a nie do rodzaju.

Niejasność

Kilka powiązanych pojęć używa podobnych słów, a niejednoznaczność może powodować znaczne zamieszanie. Określenie „ Bacillus ” (pisane wielką literą i kursywą) jest również nazwą rodzaju ( Bacillus anthracis ), który wśród wielu innych rodzajów należy do klasy Bacilli.

Słowo „ bacillus ” (lub jego liczba mnoga „bacilli” z małym b) jest również terminem ogólnym opisującym morfologię dowolnej bakterii w kształcie pałeczki. Ten ogólny termin nie oznacza, że ​​podmiot należy do klasy Bacilli lub rodzaju Bacillus . Zatem niekoniecznie oznacza to podobną grupę cech. Nie wszyscy przedstawiciele klasy Bacilli mają kształt pałeczki ( Staphylococcus ma kształt kulisty) i istnieje wiele innych bakterii o kształcie pałeczki, które nie należą do tej klasy (np. Clostridium ma kształt pałeczki, ale bardzo różni się taksonomicznie). Co więcej, ogólny termin „bacillus” niekoniecznie wskazuje na Gram-dodatnie wspólne dla klasy Bacilli. Na przykład E. coli jest bakterią w kształcie pałeczki, którą można opisać jako „bacillus”, ale barwi Gram-ujemnie i nie należy do rodzaju Bacillus ani do klasy Bacilli. Niektórzy mikrobiolodzy porzucili ogólny termin „bacillus” z powodu zamieszania, jakie może wywołać.

Filogeneza

Obecnie przyjęta taksonomia oparta na Liście nazw prokariotycznych z obowiązującą nomenklaturą (LPSN) i National Center for Biotechnology Information (NCBI).

120 białek markerowych opartych na GTDB 07-RS207

"Kyrpidiaceae" {"Kyrpidiales"}

„bakterie tubylcze”

„Effusibacillaceae”

„Tumebacillaceae”

„Alicyclobacillales”

„Acidibacillaceae”

Alicyclobacillaceae

Desulfuribacillaceae {Desulfuribacillales}

Bacillaceae_M {Bacillales_F}

Pasteuriaceae {RES148}

"Calditerricolaceae" {"Calditerricolales"}

"Thermicanaceae" {"Thermicanales"}

DSM-22653 {DSM-22653}

„Termoaktynomycetale”

„Novibacillaceae”

Thermoactinomycetaceae

DSM-45169

JIR-001

DSM-44946

„Tepidibakterie”

„Tepidibacillaceae”

„Paenibacille”

Reconcilibacillaceae

SCSIO-06110

Paenibacillaceae

YIM-B00363

NBRC-103111

„Brevibacille”

„Brevibacillaceae”

„Aneuribacillale”

RAOX-1

„Aneurinibacillaceae”

„Caldalkalibacillales”

JCM-10596

„Caldalkalibacillaceae”

"Rubeoparvulaceae" {"Rubeoparvulales"}

"Exiguobacteraceae" {"Exiguobacterales"}

CAJFEE01 {CAJFEE01}

„Bacillidae”

Planococcaceae {Caryophales}

„Caldibacillaceae” {DSM-16016}

JC228 {JC228}

Bacillales B

DSM-1321

DSM-18226

Bacillaceae_C

"Domibacillaceae"

DSM-25281

Bacillaceae_B

Bacillaceae_K

"Jeotgalibacillaceae"

Pałeczki

Bacillaceae_I

SA4

Bacillaceae_G

Bacillaceae_H

Bacillaceae

Bacillaceae_L

"Aeribacillaceae"

"Anoxybacillaceae"

Bacillaceae_J {Bacillales C}

Bacillales D

Bacillaceae_N

Bacillaceae_O

DSM-28697

"Amphibacillaceae"

"Alkalibacillaceae"

"Halobacillaceae"

Bacillales E

SA5d-4

„Massilibacteriaceae”

Bacillales G

UBA6769

HB172195

„Fictibacillaceae”

Sporolactobacillaceae

Bacillales H

„Salisediminibacteriaceae”

„Marinococcaceae”

Bacillaceae_D

Bacillaceae_F

KJ1-10-99

„Anaerobacillaceae”

„gronkowce”

„Gemellaceae”

Staphylococcaceae

DSM-29158

„Salinicoccaceae”

Erysipelotrichidae

pałeczki kwasu mlekowego

Zobacz też

  1. ^   Ludwig, Wolfgang; Schleifer, Karl-Heinz; Whitmana, Williama B. (2015). „Klasa Bacilli. Listopad” . Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria . P. 1. doi : 10.1002/9781118960608.cbm00033 . ISBN 9781118960608 .
  2. Bibliografia _ „bakterie” . Lista nazw prokariotycznych ze stałą nomenklaturą (LPSN) . Źródło 2018-07-20 .
  3. Bibliografia _ i in. „bakterie” . Baza danych taksonomii Narodowego Centrum Informacji Biotechnologicznej (NCBI) . Źródło 2018-07-20 .
  4. ^ „Wydanie GTDB 07-RS207” . Baza danych taksonomii genomu . Źródło 20 czerwca 2022 r .
  5. Bibliografia _ _ Baza danych taksonomii genomu . Źródło 20 czerwca 2022 r .
  6. ^ „Historia taksonów” . Baza danych taksonomii genomu . Źródło 20 czerwca 2022 r .