Campylobacterota

ARS Campylobacter jejuni.jpg
Campylobacterota
Campylobacter
Klasyfikacja naukowa
Domena: Bakteria
Gromada:
Campylobacterota Waite i in. 2021
Klasy
Synonimy
  • Campylobacterota Waite i in. 2018
  • Epsilonbacteraeota Waite i in. 2017

Campylobacterota to gromada bakterii . Wszystkie gatunki tego typu są Gram-ujemne .

Campylobacterota składa się z kilku znanych rodzajów, głównie zakrzywionych do spiryloidalnych Wolinella spp., Helicobacter spp. i Campylobacter spp. Większość znanych gatunków zasiedla przewód pokarmowy zwierząt i służy jako symbionty ( Wolinella spp. u bydła ) lub patogeny ( Helicobacter spp. w żołądku, Campylobacter spp. w dwunastnicy). Wiele Campylobacterota porusza się wraz z wiciami.

Liczne sekwencje środowiskowe i izolaty Campylobacterota zostały również odzyskane z kominów hydrotermalnych i siedlisk zimnego wycieku . Przykłady izolatów obejmują Sulfurimonas autotrophica , Sulfurimonas paralvinellae , Sulfurovum lithotrophicum i Nautilia profundicola . Członek typu Campylobacterota występuje jako endosymbiont w dużych skrzelach ślimaka morskiego głębinowego Alviniconcha hessleri .

Campylobacterota znalezione w głębinowych kominach hydrotermalnych charakterystycznie wykazują chemolitotrofię, zaspokajając swoje potrzeby energetyczne poprzez utlenianie zredukowanej siarki, mrówczanu lub wodoru w połączeniu z redukcją azotanów lub tlenu. Autotroficzne Campylobacterota wykorzystują odwrotny cykl Krebsa do wiązania dwutlenku węgla w biomasie, co pierwotnie uważano za mało istotne dla środowiska. Wrażliwość na tlen tego szlaku jest zgodna z ich niszą mikroaerofilną lub beztlenową w tych środowiskach i ich prawdopodobną ewolucją w oceanach mezoproterozoicznych , o których uważa się, że były siarczkowe z niskimi poziomami tlenu dostępnego z fotosyntezy cyjanobakterii.

Filogeneza

Obecnie akceptowana taksonomia jest oparta na Liście nazw prokariotycznych ze stałą nomenklaturą (LPSN) i National Center for Biotechnology Information (NCBI), a filogeneza jest oparta na LTP opartym na 16S rRNA, wydanie 106 wydane przez „The All-Species Living Tree” Projekt

Campylobacterota
  Nautilaceae

Tioreduktor micantisoli Nakagawa et al. 2005

Caminibacter Alain i in. 2002

Lebetimonas acidiphila Takai et al. 2005

Nautilia Miroshnichenko i in. 2002

Nitratiruptor tergarcus Nakagawa et al. 2

  Campylobacterale

Hydrogenimonas thermophila Takai et al. 2004

? Sulfuricurvum kujiense Kodama i Watanabe 2004

? Thiovulum majus Hinze 1913

Nitratifractor salsuginis Nakagawa et al. 2005

Sulfurovum lithotrophicum Inagaki et al. 2004

Sulfurimonas Inagaki i in. poprawka z 2003 r. Takai i in. 2006

  Helicobacteraceae

Wolinella Tanner i in. 1981

Helicobacter Goodwin i in. 1989 poprawka. Vandamme i in. 1991

  Campylobacteraceae

? Candidatus Thioturbo danicus Muyzer et al. 2005

Arcobacter Vandamme i in. 1991 poprawka. Vandamme i in. 1992

Sulfurospirillum Schumacher i in. 1993 poprawka. Luijten i in. 2003

Campylobacter Sebald i Véron 1963 poprawka. Vandamme i in. 2010

Uwagi:

  • Prokarionty, z których nie wyizolowano ani nie są dostępne żadne czyste ( akseniczne ) kultury, tj. nie są hodowane lub nie mogą być utrzymywane w hodowli przez więcej niż kilka kolejnych pasaży

Linki zewnętrzne