Ostreococcus tauri

Ostreococcus tauri
Transmisyjna mikrografia elektronowa komórki O. tauri
Klasyfikacja naukowa
(nierankingowe):	Viridiplantae
Dział:	Chlorofity
Klasa:	mamiellophyceae
Zamówienie:	Mamellales
Rodzina:	Bathycoccaceae
Rodzaj:	Ostreokoki
Gatunek:	O. Tauri
Nazwa dwumianowa
Ostreococcus tauri C. Courties & M.-J. Chrétiennot-Dinet (1995)

Ostreococcus tauri to jednokomórkowy gatunek zielonej algi morskiej o średnicy około 0,8 mikrometra (μm), najmniejszy dotychczas opisany wolno żyjący ( niesymbiotyczny ) eukariont . Ma bardzo prostą ultrastrukturę i zwarty genom .

Jako wspólny członek globalnych oceanicznych populacji pikoplanktonu , organizm ten odgrywa główną rolę w obiegu węgla w wielu obszarach i często wykorzystuje receptory światła zwane fototropinami do wykrywania światła zewnętrznego. Ostatnio O. tauri była przedmiotem badań z wykorzystaniem genomiki porównawczej i genomiki funkcjonalnej , ponieważ jest przedmiotem zainteresowania badaczy ze względu na zwarty genom i zieloną linię.

Historia

Ostreococcus tauri odkryto w 1994 r. w lagunie Thau we Francji podczas trwających rok badań populacji pikoplanktonu laguny przy użyciu cytometrii przepływowej . Stwierdzono, że O. tauri jest głównym składnikiem populacji pikoplanktonu w lagunie, a obrazy komórek wykonane za pomocą transmisyjnej mikroskopii elektronowej ujawniły najmniejsze, jak dotąd opisane, wolno żyjące komórki eukariotyczne. O. tauri została natychmiast umieszczona w klasie Prasinophyceae na podstawie obecności charakterystycznego chlorofilu pigmenty i karotenoidy pokrewne Chlorophyceae . Jednak w międzyczasie został sklasyfikowany wraz z rzędem Mamiellales do własnej klasy, Mamiellophyceae (Marin i Melkonian, 2010).

Anatomia

Komórki są z grubsza kuliste ( kokosowate ), mają średnio około 1 μm długości i 0,7 μm szerokości. Ultrastruktura komórki jest bardzo prosta, pozbawiona ściany komórkowej i składająca się z jądra , pojedynczego mitochondrium , pojedynczego chloroplastu i pojedynczego aparatu Golgiego . Komórkom brakuje również wici .

Początkowo opisywane jako zawierające 14 chromosomów, obecnie wiadomo, że jądro zawiera 20 chromosomów , w sumie około 33 fg DNA .

Ekologia

Ostreococcus tauri jest dominującym gatunkiem alg pod względem liczebności komórek w lagunie Thau na południu Francji. Uważa się, że warunki, które doprowadziły do ​​tej dominacji, to po pierwsze to, że laguna jest wykorzystywana do intensywnej hodowli mięczaków, a po drugie, że poziom miedzi w lagunie jest wysoki. Pierwsza uwaga dotyczy selekcji mniejszych komórek ( pikoplankton ); większe eukariotyczne gatunki glonów i wiele drapieżników mniejszych alg jest preferencyjnie zjadanych przez mięczaki, które są filtratorami . Druga uwaga dotyczy cyjanobakterii , jak O. tauri uważa się, że lepiej radzi sobie z „niesprzyjającymi warunkami”. Uważa się, że nadmiar miedzi w lagunie pochodzi z chemikaliów stosowanych w rolnictwie przez okoliczne winnice .

Użyj jako organizm modelowy

Już w 1998 roku O. tauri został zidentyfikowany jako „dobry kandydat do modeli biologicznych, takich jak badania podziału komórek i / lub sekwencjonowania genomu”.

Genomika

W 2006 roku Derelle i in. Zsekwencjonowali genom O. tauri . . Genom 12,56 Mb zorganizowany w 20 chromosomach wykazywał ekstremalną gęstość genów i kilka genów zawierających introny . Zidentyfikowano dwa chromosomy o cechach peryferyjnych (zawartość G+C, struktura intronu ), mianowicie chromosom 2 i chromosom 19. Sekwencjonowanie innych gatunków z rzędu Mamiellales wykazało występowanie podobnych chromosomów peryferyjnych u innych gatunków ( O. lucimarinus , Micromonas pusilla & B. prasinos ).