PDBWiki

PDBWiki to wiki , która funkcjonowała jako stworzona przez użytkowników baza danych adnotacji struktur białek , zawierająca listę wszystkich struktur białek dostępnych w Protein Data Bank (PDB). Działał w aplikacji wiki MediaWiki od 2007 do 2013 r. Witryna została wyłączona w 2014 r. i nie było możliwości późniejszego uzyskania dostępu do dostarczonych informacji. PDBWiki zawierało szczegółowe informacje o ponad 50 000 struktur białek i ponad 50 adnotacji „nadesłanych przez użytkowników”, co czyni go znaczącym zasobem dla społeczności biologii strukturalnej.

Motywacja

Protein Data Bank (PDB) to centralne archiwum eksperymentalnie rozwiązanych struktur biomolekularnych. Jednak PDB umożliwia tylko pobieranie danych i nie zapewnia funkcji współpracy ani informacji zwrotnych od użytkowników. Z kolei PDBWiki umożliwia dzielenie się wiedzą ekspercką na temat struktur zdeponowanych w PDB. Zapewnia narzędzia do omawiania i opisywania białek w sposób oparty na współpracy. Celem jest stworzenie centralnego i ogólnodostępnego repozytorium informacji przekazywanych przez użytkowników, które będą przydatne dla każdego, kto pracuje ze strukturami PDB. Jako takie, PDBWiki można uznać za część szerszego wysiłku w zakresie kuracji biologicznych baz danych opartych na społeczności.

O

PDBWiki zostało opracowane w ramach inicjatywy BioWiki i zostało zgłoszone do trzeciego Międzynarodowego Konkursu Openfree Bioinformation Content organizowanego przez BiO.CC, stronę internetową z informacjami biologicznymi prowadzoną przez KOBIC .

Witryna została wyłączona w styczniu 2014 r. i zastąpiona powiadomieniem przekierowującym do Proteopedia , podobnego projektu bazy danych biologii strukturalnej opartego na wiki.

Zobacz też

• Proteopedia
• molekularna i komórkowa „WikiProject” .

Linki zewnętrzne

• Strona główna PDBWiki
• O PDBWiki
• Światowy Bank Danych Białkowych