PRPF3

PRPF3
Dostępne konstrukcje
WPB	Wyszukiwanie ortologów:
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, czynnik przetwarzania pre-mRNA 3, HPRP3, HPRP3P, PRP3, Prp3p, RP18, SNRNP90
Identyfikatory zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek )
Chr.
Koniec
Lokalizacja genu ( mysz )
Chr.
Koniec
Wzór ekspresji RNA
Ontologia genów
Funkcja molekularna
Komponent komórkowy
Proces biologiczny
	Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi
	Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka	Wyświetl/edytuj mysz

U4/U6 mała jądrowa rybonukleoproteina Prp3 jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen PRPF3 .

Funkcjonować

Usuwanie intronów z jądrowych pre-mRNA odbywa się na kompleksach zwanych spliceosomami, które składają się z 4 małych cząstek jądrowej rybonukleoproteiny (snRNP) i nieokreślonej liczby przejściowo powiązanych czynników splicingowych. PRPF3 jest jednym z kilku białek, które łączą się z U4 i U6 snRNP. [dostarczone przez OMIM]

Interakcje

Wykazano, że PRPF3 oddziałuje z DVL3 .

Dalsza lektura

Maruyama K, Sugano S (styczeń 1994). „Oligo-capping: prosta metoda zastąpienia struktury czapeczki eukariotycznych mRNA oligorybonukleotydami”. gen . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
Xu SY, Schwartz M, Rosenberg T, Gal A (sierpień 1996). „Dziewiąty locus (RP18) dla map autosomalnego dominującego barwnikowego siatkówki w regionie pericentromerycznym chromosomu 1” . Genetyka molekularna człowieka . 5 (8): 1193–7. doi : 10.1093/hmg/5.8.1193 . PMID 8842740 .
Wang A, Forman-Kay J, Luo Y, Luo M, Chow YH, Plumb J, Friesen JD, Tsui LC, Heng HH, Woolford JL, Hu J (listopad 1997). „Identyfikacja i charakterystyka ludzkich genów kodujących Hprp3p i Hprp4p, oddziałujących składników spliceosomu” . Genetyka molekularna człowieka . 6 (12): 2117–26. doi : 10.1093/hmg/6.12.2117 . PMID 9328476 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (październik 1997). „Konstrukcja i charakterystyka biblioteki cDNA wzbogaconej o pełnej długości i wzbogaconej o koniec 5'”. gen . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
Horowitz DS, Kobayashi R, Krainer AR (grudzień 1997). „Nowa cyklofilina i ludzkie homologi drożdży Prp3 i Prp4 tworzą kompleks związany z snRNP U4 / U6” . RNA . 3 (12): 1374–87. PMC 1369579 . PMID 9404889 .
Heng HH, Wang A, Hu J (marzec 1998). „Mapowanie ludzkich genów HPRP3 i HPRP4 kodujących czynniki splicingowe związane z U4 / U6 na chromosomy 1q21.1 i 9q31-q33”. Genomika . 48 (2): 273–5. doi : 10.1006/geno.1997.5181 . PMID 9521884 .
Xu SY, Rosenberg T, Gal A (kwiecień 1998). „Ulepszone mapowanie genetyczne autosomalnego dominującego barwnikowego siatkówki locus RP18 zmniejsza region krytyczny do 2 cM między D1S442 i D1S2858 na chromosomie 1q”. Genetyka człowieka . 102 (4): 493–4. doi : 10.1007/s004390050728 . PMID 9600251 . S2CID 39815355 .
Reidt U, Reuter K, Achsel T, Ingelfinger D, Lührmann R, Ficner R (marzec 2000). „Struktura krystaliczna ludzkiej SnuCyp-20 o małej jądrowej rybonukleoproteinie U4 / U6, jądrowa cyklofilina” (PDF) . Journal of Biological Chemistry . 275 (11): 7439–42. doi : 10.1074/jbc.275.11.7439 . PMID 10713041 . S2CID 20261807 .
Chakarova CF, Hims MM, Bolz H, Abu-Safieh L, Patel RJ, Papaioannou MG, Inglehearn CF, Keen TJ, Willis C, Moore AT, Rosenberg T, Webster AR, Bird AC, Gal A, Hunt D, Vithana EN, Bhattacharya SS (styczeń 2002). „Mutacje w HPRP3, trzecim członku genów czynnika splicingowego pre-mRNA, związane z autosomalnym dominującym barwnikowym zwyrodnieniem siatkówki” . Genetyka molekularna człowieka . 11 (1): 87–92. doi : 10.1093/hmg/11.1.87 . PMID 11773002 .
Horowitz DS, Lee EJ, Mabon SA, Misteli T (luty 2002). „Funkcje cyklofiliny w splicingu pre-mRNA” . Dziennik EMBO . 21 (3): 470–80. doi : 10.1093/emboj/21.3.470 . PMC 125845 . PMID 11823439 .
Gonzalez-Santos JM, Wang A, Jones J, Ushida C, Liu J, Hu J (czerwiec 2002). „Centralny region ludzkiego czynnika splicingowego Hprp3p oddziałuje z Hprp4p” . Journal of Biological Chemistry . 277 (26): 23764–72. doi : 10.1074/jbc.M111461200 . PMID 11971898 .
Nottrott S, Urlaub H, Lührmann R (październik 2002). „Hierarchiczne, zgrupowane interakcje białek z snRNA U4 / U6: biochemiczna rola białek U4 / U6” . Dziennik EMBO . 21 (20): 5527–38. doi : 10.1093/emboj/cdf544 . PMC 129076 . PMID 12374753 .
Ajuh P, Chusainow J, Ryder U, Lamond AI (grudzień 2002). „Nowa funkcja ludzkiego czynnika C1 (HCF-1), białka gospodarza wymaganego do zakażenia wirusem opryszczki pospolitej, w splicingu pre-mRNA” . Dziennik EMBO . 21 (23): 6590–602. doi : 10.1093/emboj/cdf652 . PMC 136956 . PMID 12456665 .
Martínez-Gimeno M, Gamundi MJ, Hernan I, Maseras M, Millá E, Ayuso C, García-Sandoval B, Beneyto M, Vilela C, Baiget M, Antiñolo G, Carballo M (maj 2003). „Mutacje w genach czynnika splicingowego pre-mRNA PRPF3, PRPF8 i PRPF31 w rodzinach hiszpańskich z autosomalnym dominującym barwnikowym zwyrodnieniem siatkówki” . Okulistyka śledcza i nauki wizualne . 44 (5): 2171-7. doi : 10.1167/iovs.02-0871 . PMID 12714658 .
Reidt U, Wahl MC, Fasshauer D, Horowitz DS, Lührmann R, Ficner R (sierpień 2003). „Struktura krystaliczna kompleksu ludzkiej spliceosomalnej cyklofiliny H i peptydu U4 / U6 snRNP-60K”. Dziennik biologii molekularnej . 331 (1): 45–56. doi : 10.1016/S0022-2836(03)00684-3 . hdl : 11858/00-001M-0000-0012-F238-B . PMID 12875835 .
Wada Y, Itabashi T, Sato H, Tamai M (listopad 2004). „Cechy kliniczne japońskiej rodziny z autosomalnym dominującym barwnikowym zwyrodnieniem siatkówki związanym z mutacją Thr494Met w genie HPRP3”. Archiwum Graefe'a dla okulistyki klinicznej i eksperymentalnej = Albrecht von Graefes Archiv für Klinische und Experimentelle Ophthalmologie . 242 (11): 956–61. doi : 10.1007/s00417-004-0923-x . PMID 15085354 . S2CID 22773384 .
Stanĕk D, Neugebauer KM (wrzesień 2004). „Wykrywanie półproduktów montażowych snRNP w ciałach Cajala za pomocą transferu energii rezonansu fluorescencji” . Journal of Cell Biology . 166 (7): 1015–25. doi : 10.1083/jcb.200405160 . PMC 2172029 . PMID 15452143 .
Maita H, Kitaura H, Ariga H, Iguchi-Ariga SM (styczeń 2005). „Związek PAP-1 i Prp3p, produktów genów sprawczych dominującego barwnikowego siatkówki, w kompleksie tri-snRNP”. Eksperymentalne badania komórkowe . 302 (1): 61–8. doi : 10.1016/j.yexcr.2004.08.022 . PMID 15541726 .

Linki zewnętrzne

GeneReviews/NIH/NCBI/UW wpis dotyczący Retinitis Pigmentosa Przegląd