Palec cynkowy AN1
| zf-AN1 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Struktura roztworu domeny zf-an1 z białka Arabiopsis thaliana f5o11.17
| |||||||||
| Identyfikatory | |||||||||
| Symbol | zf-AN1 | ||||||||
| Pfam | PF01428 | ||||||||
| InterPro | IPR000058 | ||||||||
| MĄDRY | ZnF_AN1 | ||||||||
| |||||||||
W biologii molekularnej domena palca cynkowego typu AN1 , która ma fałdę alfa / beta związaną z dimetalem (cynkiem) . Domena ta została po raz pierwszy zidentyfikowana jako palec cynkowy na C-końcu AN1 SWISSPROT , białka podobnego do ubikwityny w Xenopus laevis . Palec cynkowy typu AN1 zawiera sześć konserwatywnych cystein i dwie histydyny , które potencjalnie mogą koordynować 2 atomy cynku .
białka związane ze stresem (SAP) zawierają domenę AN1, często w połączeniu z domenami palca cynkowego A20 (SAP8) lub domenami C2H2 (SAP16). Na przykład ludzkie białko Znf216 ma palec cynkowy A20 na końcu N i palec cynkowy AN1 na końcu C, działając w celu negatywnej regulacji szlaku aktywacji NFkappaB i interakcji ze składnikami odpowiedzi immunologicznej , takimi jak RIP, IKKgamma i TRAF6. W interakcji Znf216 z IKK-gamma i RIP pośredniczy domena palca cynkowego A20, podczas gdy w jej interakcji z TRAF6 pośredniczy domena palca cynkowego AN1; dlatego obie domeny palca cynkowego biorą udział w regulacji immunologicznej . Domena palca cynkowego AN1 znajduje się również w białkach zawierających domenę podobną do ubikwityny, które biorą udział w ubikwitynacji . Białka zawierające palec cynkowy typu AN1 obejmują:
- Ascidian tylne oznaczenie końcowe 6 (pem-6) białko.
- Ludzkie białko AWP1 (związane z PRK1), które ulega ekspresji podczas wczesnej embriogenezy .
- Ludzkie białko wiążące mu immunoglobulinę 2 (SMUBP-2), mutacje powodujące zanik mięśni z niewydolnością oddechową typu 1.
Domeny palca cynkowego typu AN1 są szeroko obecne w różnych „ Euryarchaeota ” i Nitrososphaerota , gdzie często są połączone z domenami peptydaz związanymi z błoną, takimi jak peptydaza serynowa z rodziny romboidalnej, peptydazy tiolowe podobne do transglutaminazy fałdu papainowego i zależne od Zn metalopeptydazy . Domeny Archaeal AN1 są również połączone z helisami transbłonowymi i domenami takimi jak DNAJ i SCP/PR1. Te fuzje sugerują związane z błoną role białek zawierających domenę AN1 w archeonach, takie jak przetwarzanie proteolityczne polipeptydów i regulacja fałdowania lub stabilności białek. Składnia architektury jest niezwykle podobna do składni prokariotycznego palca cynkowego B-box i domen LIM .