Pegiwirus
| Klasyfikacja wirusów | |
|---|---|
| Pegivirus | |
| (nierankingowe): | Wirus |
| królestwo : | Rybowiria |
| Królestwo: | Orthornawirusy |
| Gromada: | Kitrinoviricota |
| Klasa: | Flasuviricetes |
| Zamówienie: | amarillowirusy |
| Rodzina: | Flaviviridae |
| Rodzaj: | Pegiwirus |
| Gatunek | |
|
|
|
Pegivirus to zatwierdzona nazwa rodzaju wirusów z pojedynczą dodatnią nicią RNA z rodziny Flaviviridae . Nazwa jest pochodna: „Pe” oznacza „trwały”, a „g” odnosi się do zapalenia wątroby typu G , dawnej nazwy gatunku C.
Taksonomia
Jedenaście nazwanych gatunków należy do rodzaju Pegivirus . Izolaty należące do gatunku Pegivirus C są monofiletyczne i wykazują < 50% rozbieżności sekwencji nukleotydów (55% aminokwasów) między dopasowanymi sekwencjami poliproteiny względem siebie. Jednak wszystkie różnią się o ponad 50% rozbieżności nukleotydów (>55% aminokwasów) od innych członków tego rodzaju. Pegiwirusy przypisane do tego gatunku ( Pegivirus A ) pochodzą od gatunków żywicieli naczelnych (ludzi, szympansów i kilku gatunków małp z Nowego Świata). Sekwencja U22303 została przypisana jako członek typu gatunku, ponieważ był to pierwszy pegiwirus opisany dla tego gatunku. Terminologia opisująca wirusy z różnymi żywicielami nie została zatwierdzona przez Międzynarodowy Komitet Taksonomii Wirusów; jednak Pegivirus A zostały nazwane HPgV dla pegiwirusa ludzkiego, SPgV dla pegiwirusów małpich z nowego świata i SPgVcpz dla małpiego wirusa szympansa. [ potrzebne źródło ]
Drugi gatunek pegiwirusów jest określany jako Pegivirus B. W propozycji nazewnictwa uwzględniono tylko jednego wirusa, który był kompletnym genomem wirusa znalezionego w gatunku nietoperza Pteropus giganteus . Ta sekwencja różni się o > 50% rozbieżności nukleotydów (> 55% aminokwasów) od wszystkich proponowanych członków gatunku Pegivirus C pochodzącego od naczelnych, który pochodzi od gatunków gospodarzy naczelnych (ludzi, szympansów i kilku gatunków małp z Nowego Świata). Sekwencja GU566734 została przypisana jako członek typu gatunku, ponieważ był to pierwszy pegiwirus opisany dla tego gatunku. [ potrzebny cytat ]
Zastosowanie technologii głębokiego sekwencjonowania pozwoliło zidentyfikować dodatkowe wirusy, które różnią się od gatunków Pegivirus B o > 50% nukleotydów (> 55% aminokwasów) i Pegiwirus C u gryzoni, koni i różnych gatunków nietoperzy oraz małp Starego Świata, a liczba gatunków Pegivirus została rozszerzona do jedenastu.
Zmieniona taksonomia
Gatunki znane w 2016 roku zostały od tego czasu sklasyfikowane w 11 gatunkach - Pegivirus A-K.
- Pegiwirus A obejmuje wirusa GBV-A
- Pegiwirus B obejmuje wirusa GBV-D
- Pegiwirus C obejmuje wirusa GBV-C
- Pegiwirus D obejmuje wirusa związanego z chorobą Theilera
- Pegiwirus E obejmuje wirusa końskiego pegiwirusa
- Pegivirus F obejmuje wirusa Bat pegivirus
- Pegivirus G obejmuje wirusa Bat pegivirus
- Pegiwirus H obejmuje wirusa Ludzki pegiwirus 2
- Pegivirus I obejmuje wirusa Bat pegivirus
- Pegivirus J obejmuje wirusa Rodent pegivirus
- Pegiwirus K obejmuje wirusa pegiwirusa świń
Historia
- W 1967 roku doniesiono, że eksperymentalna inokulacja surowicy od trzydziestoczteroletniego chirurga (George Barker) z ostrym zapaleniem wątroby tamaryny spowodowała zapalenie wątroby .
- zidentyfikowano dwóch nowych członków rodziny Flaviviridae (GBV-A i GBV-B) u tamaryn, u których rozwinęło się zapalenie wątroby po zaszczepieniu 11. pasażem GB. Szereg wariantów GBV-A zidentyfikowano później u dzikich małp z Nowego Świata, które zostały schwytane.
- Następnie w 1995 roku zidentyfikowano ludzkiego wirusa [GBV-C lub wirus zapalenia wątroby typu G (HGV)].
- Bardziej odlegle spokrewniony wirus (GBV-D) został później odkryty u nietoperza ( Pteropus giganteus ).
- Rodzaj Pegivirus został zaproponowany w 2011 roku. GBV-B został przypisany do rodzaju Hepacivirus , podczas gdy GBV-A wraz z GBV-C zostały przypisane do nowego rodzaju Pegivirus .
- W 2016 roku rodzaj Pegivirus został podzielony na 11 gatunków – pegiwirusy A–K z GBV-C sklasyfikowane jako gatunek pegiwirusa C.
Notatki
- Choroba Theilera — forma końskiego zapalenia wątroby — również wydaje się być powodowana przez pegiwirus — wirus związany z chorobą Theilera .
- Ludzki hepegiwirus 1 lub ludzki pegiwirus 2 (HPgV2) to wirus wyizolowany z 2 wielokrotnie przetoczonych pacjentów z hemofilią i 2 przetoczonych pacjentów. Wirus ten wydaje się należeć do nowego kladu Pegiwirusów.
- Pokrewny wirus został wyizolowany z wdzięcznego kociaka ( Proscyllium habereri ).
- Wydaje się, że ludzkie pegiwirusy są spokrewnione z gatunkami naczelnych innych niż ludzie.
- Naukowcy w 2019 roku opisali ludzki pegiwirus-1 jako „przyczynę ludzkiego zapalenia mózgu ( leukoencephalitis )”; jak również przenoszone drogą płciową i z matki na dziecko .
- Inny wirus – pegawirus gryzoni – został wyizolowany ze szczura leśnego ( Neotoma albigula ).
- Pegiwirus (koński pegiwirus) został również wyizolowany z konia.