Przełącznik rybny PreQ1-III

Konsensusowa drugorzędowa struktura ryboprzełączników PreQ ₁ -III, oparta na wcześniejszych danych niż wcześniej opublikowany opis. Strukturalne znaczenie interakcji parowania oznaczonej jako „pseudoknot lub alternatywny rdzeń” jest obecnie nieznane. Rdzeń P1 jest niezwykle bogaty w nukleotydy A i U, ale potwierdzają to dane eksperymentalne.

Przełączniki rybne PreQ1-III są klasą przełączników rybnych , które wiążą pre-queuozynę ₁ (PreQ1 ₎ , prekursor zmodyfikowanej nukleozydowej queuozyny . Przełączniki rybne PreQ ₁ -III są trzecią odkrytą klasą przełączników rybnych, które wyczuwają ten ligand i różnią się strukturalnie od przełączników ryboprzełącznikowych preQ ₁ -I i preQ ₁ -II . Większość zsekwencjonowanych przykładów ryboprzełączników preQ ₁ -III uzyskuje się z niehodowanego metagenomu próbki, ale nieliczne przykłady w organizmach hodowlanych są obecne w szczepach, o których wiadomo lub podejrzewa się, że są Faecalibacterium prausnitzii , gatunkiem Gram-dodatnich Clostridia . Znane przykłady przełączników rybochłonnych preQ ₁ -III znajdują się przed genami queT , od których oczekuje się, że będą kodować transportery pochodnej kweuozyny. Inne dwie znane klasy przełączników rybnych preQ ₁ są również powszechnie spotykane przed genami queT .

Struktura rozdzielczości atomowej przełącznika rybnego preQ1-III została rozwiązana za pomocą krystalografii rentgenowskiej.