Pudełko GC

W biologii molekularnej pole GC , znane również jako pudełko GSG , jest odrębnym wzorem nukleotydów znalezionym w regionie promotora niektórych genów eukariotycznych. Blok GC znajduje się w górę od bloku TATA i około 110 zasad w górę od miejsca inicjacji transkrypcji. Ma sekwencję konsensusową GGGCGG, która jest zależna od pozycji i niezależna od orientacji. Elementy GC są wiązane przez czynniki transkrypcyjne i pełnią podobne funkcje jak wzmacniacze. Niektóre znane białka wiążące pole GC obejmują Sp1, Krox/Egr, guz Wilmsa, MIGI i CREA.

Pudełko GC jest zwykle miejscem wiązania białek palca cynkowego . Sekcja helisy alfa białka odpowiada głównemu rowkowi w DNA. Palce cynkowe wiążą się z trypletowymi sekwencjami par zasad, przy czym reszta 21 wiąże się z pierwszą parą zasad, reszta 18 wiąże się z drugą parą zasad, a reszta 15 wiąże się z trzecią parą zasad. Potrójne pary zasad mogą być GGG lub GCG. Jeśli reszta 18 jest histydyną, zwiąże się z G, a jeśli reszta 18 jest glutaminianem, zwiąże się z C. Palce cynkowe wiążące pole GC mają od 2 do 4 palców, co powoduje, że oddziałują z sekwencjami par zasad, które mają od 6 do 8 par zasad.