Element odpowiedzi
Elementy odpowiedzi to krótkie sekwencje DNA w obrębie promotora lub regionu wzmacniacza genu , które są zdolne do wiązania specyficznych czynników transkrypcyjnych i regulowania transkrypcji genów .
W warunkach stresu białko aktywator transkrypcji wiąże się z elementem odpowiedzi i stymuluje transkrypcję. Jeśli ta sama sekwencja elementów odpowiedzi znajduje się w obszarach kontrolnych różnych genów, wówczas geny te zostaną aktywowane przez te same bodźce, wytwarzając w ten sposób skoordynowaną odpowiedź.
Element odpowiedzi hormonalnej
Element odpowiedzi hormonalnej (HRE) to krótka sekwencja DNA w promotorze genu, która jest zdolna do wiązania się z określonym kompleksem receptora hormonalnego i w ten sposób reguluje transkrypcję . Sekwencja jest najczęściej parą odwróconych powtórzeń oddzielonych trzema nukleotydami, co również wskazuje, że receptor wiąże się jako dimer . W szczególności HRE reaguje na hormony steroidowe, ponieważ aktywowany receptor steroidowy jest czynnikiem transkrypcyjnym wiążącym HRE. Reguluje to transkrypcję genów sygnalizowaną przez hormon steroidowy.
Gen może mieć wiele różnych elementów odpowiedzi, umożliwiając sprawowanie złożonej kontroli nad poziomem i szybkością transkrypcji.
HRE stosuje się w komórkach zwierząt transgenicznych jako induktory ekspresji genów.
Przykłady HRE obejmują elementy odpowiedzi na estrogen i elementy odpowiedzi na androgeny.
Przykłady
Przykładowe elementy odpowiedzi obejmują:
-
receptora jądrowego – dwa 6-meryczne powtórzenia dla wiązania dimerycznego
- Elementy odpowiedzi NR typu 2: bezpośrednie powtórzenia motywów RGKTCA, kanonicznie AGGTCA
- Element odpowiedzi na witaminę D (VDRE)
- Elementy odpowiedzi na kwas retinowy (RARE)
- Element odpowiedzi ROR
- Element odpowiedzi hormonu tarczycy
- Element odpowiedzi hormonu wzrostu (GHRE)
- Elementy odpowiedzi hormonalnej proliferatorów peroksysomów (PPRE)
- Elementy odpowiedzi NR typu 1 (typowe dla elementów odpowiedzi hormonalnej ) – powtórzenie odwrócone
- Elementy odpowiedzi NR typu 2: bezpośrednie powtórzenia motywów RGKTCA, kanonicznie AGGTCA
- Element odpowiedzi cAMP (CRE)
- Element rozpoznawczy B
- Pierwiastek reagujący na AhR, dioksyny lub ksenobiotyki
- Elementy reagujące na niedotlenienie
- Element odpowiedzi surowicy (SRE)
- Element reagujący na metal (MRE)
- Element odpowiedzi na uszkodzenie DNA (DRE)
- Elementy odpowiedzi stymulowane IFN (ISRE)
- Pierwiastek reagujący na wapń CaRE1
- Element odpowiedzi przeciwutleniającej (ARE)
- element odpowiedzi p53
- Element regulujący sterol
- Elementy odpowiedzi Polycomb (PRE)
- Element reakcji na obroty (RRE)
- Element odpowiedzi Wnt (WRE), rdzeń CTTTG
Linki zewnętrzne
- odpowiedź + element w Narodowej Bibliotece Medycyny Stanów Zjednoczonych Nagłówki tematów medycznych (MeSH)