Gen kodujący białko u gatunku Homo sapiens
RANBP1
Dostępne konstrukcje
WPB
Wyszukiwanie ortologów:
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
, HTF9A, białko wiążące RAN 1
Identyfikatory zewnętrzne
Wikidane
Białko wiążące specyficzne dla Ran 1 jest enzymem , który u ludzi jest kodowany przez gen RANBP1 .
Ran / TC4, RanBP1, oddziałuje specyficznie z RAN naładowanym GTP . RANBP1 koduje białko o masie 23 kD, które wiąże się z RAN w kompleksie z GTP, ale nie z GDP . RANBP1 nie aktywuje GTPazy RAN, ale znacznie zwiększa hydrolizę GTP przez białko aktywujące RanGTPazę ( RANGAP1 ). cDNA RANBP1 koduje białko składające się z 201 aminokwasów, które jest w 92% podobne do jego mysiego homologu. Zarówno w komórkach ssaków, jak iw drożdżach RANBP1 działa jako negatywny regulator RCC1 poprzez hamowanie stymulowanego przez RCC1 uwalniania nukleotydów guaniny z RAN.
Interakcje
Wykazano, że RANBP1 oddziałuje z XPO1 , KPNB1 i Ran .
Dalsza lektura
Bischoff FR, Krebber H, Smirnova E i in. (1995). „Koaktywacja RanGTPazy i hamowanie dysocjacji GTP przez białko wiążące Ran-GTP RanBP1” . EMBO J. 14 (4): 705–15. doi : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb07049.x . PMC 398135 . PMID 7882974 .
Ren M, Villamarin A, Shih A i in. (1995). „Oddzielne domeny GTPazy Ran oddziałują z różnymi czynnikami regulującymi import białek jądrowych i przetwarzanie RNA” . Mol. Komórka. Biol . 15 (4): 2117–24. doi : 10.1128/MCB.15.4.2117 . PMC 230439 . PMID 7891706 .
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: prosta metoda zastąpienia struktury czapeczki eukariotycznych mRNA oligorybonukleotydami”. gen . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
Coutavas E, Ren M, Oppenheim JD i in. (1994). „Charakterystyka białek, które oddziałują z białkiem regulacyjnym cyklu komórkowego Ran / TC4”. Natura . 366 (6455): 585–7. Bibcode : 1993Natur.366..585C . doi : 10.1038/366585a0 . PMID 8255297 . S2CID 4302198 .
Zolotukhin AS, Felber BK (1997). „Mutacje w jądrowym sygnale eksportowym ludzkiego białka RanBP1 wiążącego ran blokują regulację potranskrypcyjną za pośrednictwem Rev ludzkiego wirusa niedoboru odporności typu 1” . J. Biol. chemia . 272 (17): 11356–60. doi : 10.1074/jbc.272.17.11356 . PMID 9111043 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K i in. (1997). „Konstrukcja i charakterystyka biblioteki cDNA wzbogaconej o pełnej długości i wzbogaconej o koniec 5'”. gen . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
Plafker K, Macara IG (2000). „Ułatwione przenoszenie nukleocytoplazmatyczne białka wiążącego Ran RanBP1” . Mol. Komórka. Biol . 20 (10): 3510–21. doi : 10.1128/MCB.20.10.3510-3521.2000 . PMC85643 . _ PMID 10779340 .
Steggerda SM, Paschalny BM (2000). „Białko Mog1 ssaków jest czynnikiem uwalniającym nukleotyd guaninowy dla Ran” . J. Biol. chemia . 275 (30): 23175–80. doi : 10.1074/jbc.C000252200 . PMID 10811801 .
Maynard TM, Haskell GT, Bhasin N i in. (2002). „RanBP1, gen kandydujący na zespół velocardiofacial / DiGeorge, ulega ekspresji w miejscach indukcji mezenchymalnej / nabłonkowej” . Mech. Dev . 111 (1–2): 177–80. doi : 10.1016/S0925-4773(01)00616-5 . PMID 11804793 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH i in. (2003). „Generowanie i wstępna analiza ponad 15 000 pełnej długości sekwencji cDNA człowieka i myszy” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Di Fiore B, Ciciarello M, Mangiacasale R i in. (2004). „Ssak RanBP1 reguluje spójność centrosomu podczas mitozy” . J. Cell Sci . 116 (Pt 16): 3399–411. doi : 10.1242/jcs.00624 . PMID 12840069 .
Seewald MJ, Kraemer A, Farkasovsky M, et al. (2003). „Charakterystyka biochemiczna systemu Ran-RanBP1-RanGAP: czy białka RanBP i kwaśny ogon RanGAP są wymagane do reakcji GTPazy Ran-RanGAP?” . Mol. Komórka. Biol . 23 (22): 8124–36. doi : 10.1128/MCB.23.22.8124-8136.2003 . PMC 262373 . PMID 14585972 .
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T i in. (2004). „Kompletne sekwencjonowanie i charakterystyka 21 243 pełnej długości ludzkich cDNA” . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
Bohlson SS, Zhang M, Ortiz CE, Tenner AJ (2005). „CD93 oddziałuje z białkiem adaptera zawierającym domenę PDZ GIPC: implikacje w modulacji fagocytozy”. J. Leukoc. Biol . 77 (1): 80–9. doi : 10.1189/jlb.0504305 . PMID 15459234 . S2CID 3219168 .
Collins JE, Wright CL, Edwards CA i in. (2005). „Oparte na adnotacjach genomu podejście do klonowania ludzkiego ORFeome” . Genom Biol . 5 (10): 84 zł. doi : 10.1186/gb-2004-5-10-r84 . PMC 545604 . PMID 15461802 .
Bruneel A, Labas V, Mailloux A i in. (2006). „Proteomika ludzkich komórek śródbłonka żyły pępowinowej zastosowana do apoptozy indukowanej etopozydem”. Proteomika . 5 (15): 3876–84. doi : 10.1002/pmic.200401239 . PMID 16130169 . S2CID 26007149 .
Takeda E, Hieda M, Katahira J, Yoneda Y (2006). „Fosforylacja RanGAP1 stabilizuje jego interakcję z Ran i RanBP1” . Struktura komórkowa. Funkcja . 30 (2): 69–80. doi : 10.1247/csf.30.69 . PMID 16428860 .
Ewing RM, Chu P, Elisma F i in. (2007). „Mapowanie na dużą skalę ludzkich interakcji białko-białko za pomocą spektrometrii mas” . Mol. Syst. Biol . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .
Galeria WP
1k5d : Struktura krystaliczna kompleksu Ran-GPPNHP-RanBP1-RanGAP
1k5g : Struktura krystaliczna kompleksu Ran-GDP-AlFx-RanBP1-RanGAP