RNA rybosomalny 5,8S
| Rybosomalny RNA 5,8S | |
|---|---|
 Przewidywana struktura drugorzędowa i konserwacja sekwencji rybosomalnego RNA 5,8S
| |
| identyfikatorów | |
| Symbol | 5_8S_rRNA |
| Rfam | RF00002 |
| Inne dane | |
| typ RNA | gen ; rRNA |
| Domeny | eukariota ; Archaea [ potrzebne źródło ] |
| IŚĆ | GO:0003735 GO:0005840 |
| WIĘC | SO: 0000375 |
| Struktury PDB | PDBe |
W biologii molekularnej rybosomalny RNA 5,8S ( 5,8S rRNA ) jest niekodującym składnikiem RNA dużej podjednostki rybosomu eukariotycznego , a zatem odgrywa ważną rolę w translacji białek . Jest transkrybowany przez polimerazę RNA I jako część prekursora 45S , który zawiera również rRNA 18S i 28S . Uważa się, że jego funkcją jest translokacja rybosomów. Wiadomo również, że tworzy kowalencyjne z białkiem supresorowym guza p53 . 5.8S rRNA może być użyty jako gen referencyjny do miRNA . Rybosomalny RNA 5,8S służy do lepszego zrozumienia innych procesów i szlaków rRNA w komórce.
rRNA 5,8S jest homologiczne do końca 5' nieeukariotycznego rRNA LSU . U eukariontów wstawienie ITS2 rozbija rRNA LSU na rRNA 5,8S i 28S. Niektóre muchy mają 5,8 rRNA dalej podzielone na dwie części.
Struktura
rozmiar około 150 nukleotydów i składa się z wielu pofałdowanych nici, z których niektóre uważa się za jednoniciowe. Ten rybosomalny RNA wraz z 28S i 5S rRNA oraz 46 rybosomalnymi białkami tworzy dużą podjednostkę rybosomu (LSU) . 5,8S rRNA jest początkowo transkrybowany wraz z 18S i 28S rRNA w prerybosomalnym RNA 45S, wraz z ITS 1 i ITS 2 (przerywnik z wewnętrzną transkrypcją ) oraz 5' i 3' ETS ( przerywnik z transkrypcją zewnętrzną ). 5.8S rRNA znajduje się pomiędzy dwoma regionami ITS, przy czym ITS1 oddziela go od 18S rRNA w kierunku 5', a ITS2 oddziela go od 28S rRNA w kierunku 3'. ITS i ETS są odcinane podczas dojrzewania rRNA. Osiąga się to poprzez ciągły szlak rozszczepiania wykonywany zarówno przez endonukleazy , jak i egzonukleazy , przecinając odstępniki w określonych miejscach.