Gen kodujący białko u gatunku Homo sapiens
RNF111
Dostępne konstrukcje
WPB Wyszukiwanie ortologiczne:
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
, ARK, białko palca serdecznego 111, hRNF111
Identyfikatory zewnętrzne
Wikidane
Ligaza białkowa ubikwitynowa E3 Arkadia jest enzymem kodowanym u ludzi przez gen RNF111 .
Funkcjonować
Białko kodowane przez ten gen zawiera domenę palca PIERŚCIENIEGO, motyw, o którym wiadomo, że bierze udział w interakcjach białko-białko i białko-DNA. Wykazano, że mysi odpowiednik tego genu (Rnf111/arkadia) oddziałuje genetycznie z czynnikiem beta podobnym do transformującego czynnika wzrostu (TGF) Nodal i działa jako modulator węzłowej kaskady sygnalizacyjnej, która jest niezbędna do indukcji mezodermy podczas rozwoju embrionalnego.
Interakcje
Wykazano, że RNF111 oddziałuje z matkami przeciwko homologowi 7 z dekapentaplegią i matkami przeciwko homologowi 3 z dekapentaplegią .
Dalsza lektura
Patten I, Placzek M (sierpień 2001). „Rozwój kręgowców: Et w Arkadii” . Aktualna biologia . 11 (15): R616-9. doi : 10.1016/S0960-9822(01)00367-0 PMID 11516970 .
Niederländer C, Walsh JJ, Episkopou V, Jones CM (kwiecień 2001). „Arkadia wzmacnia sygnalizację związaną z węzłami, aby wywołać mesendodermę”. Natura . 410 (6830): 830–4. Kod Bib : 2001Natur.410..830N . doi : 10.1038/35071103 . PMID 11298453 . S2CID 4322926 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS, Wagner L, Shenmen CM, Schuler GD, Altschul SF, Zeeberg B, Buetow KH, Schaefer CF, Bhat NK, Hopkins RF, Jordan H, Moore T , Max SI, Wang J, Hsieh F, Diatchenko L, Marusina K, Farmer AA, Rubin GM, Hong L, Stapleton M, Soares MB, Bonaldo MF, Casavant TL, Scheetz TE, Brownstein MJ, Usdin TB, Toshiyuki S, Carninci P, Prange C, Raha SS, Loquellano NA, Peters GJ, Abramson RD, Mullahy SJ, Bosak SA, McEwan PJ, McKernan KJ, Malek JA, Gunaratne PH, Richards S, Worley KC, Hale S, Garcia AM, Gay LJ, Hulyk SW, Villalon DK, Muzny DM, Sodergren EJ, Lu X, Gibbs RA, Fahey J, Helton E, Ketteman M, Madan A, Rodrigues S, Sanchez A, Whiting M, Madan A, Young AC, Szewczenko Y, Bouffard GG , Blakesley RW, Touchman JW, Green ED, Dickson MC, Rodriguez AC, Grimwood J, Schmutz J, Myers RM, Butterfield YS, Krzywinski MI, Skalska U, Smailus DE, Schnerch A, Schein JE, Jones SJ, Marra MA (grudzień 2002). „Generowanie i wstępna analiza ponad 15 000 pełnej długości sekwencji cDNA ludzkich i mysich” . Proceedings of National Academy of Sciences Stanów Zjednoczonych Ameryki . 99 (26): 16899–903. Kod Bib : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 PMC 139241 PMID 12477932 .
Koinuma D, Shinozaki M, Komuro A, Goto K, Saitoh M, Hanyu A, Ebina M, Nukiwa T, Miyazawa K, Imamura T, Miyazono K (grudzień 2003). „Arkadia wzmacnia sygnalizację nadrodziny TGF-beta poprzez degradację Smad7” . Dziennik EMBO . 22 (24): 6458–70. doi : 10.1093/emboj/cdg632 . PMC 291827 PMID 14657019 .
Colland F, Jacq X, Trouplin V, Mougin C, Groizeleau C, Hamburger A, Meil A, Wójcik J, Legrain P, Gauthier JM (lipiec 2004). „Funkcjonalne mapowanie proteomiki ludzkiego szlaku sygnałowego” . Badania genomu . 14 (7): 1324–32. doi : 10.1101/gr.2334104 . PMC 442148 PMID 15231748 .
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (październik 2005). „W stronę mapy sieci interakcji białko-białko w skali proteomu”. Natura . 437 (7062): 1173–8. Kod Bib : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/natura04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
Liu W, Rui H, Wang J, Lin S, He Y, Chen M, Li Q, Ye Z, Zhang S, Chan SC, Chen YG, Han J, Lin SC (kwiecień 2006). „Aksyna jest białkiem rusztowania w sygnalizacji TGF-beta, która sprzyja degradacji Smad7 przez Arkadia” . Dziennik EMBO . 25 (8): 1646–58. doi : 10.1038/sj.emboj.7601057 . PMC 1440825 PMID 16601693 .
Nagano Y, Mavrakis KJ, Lee KL, Fujii T, Koinuma D, Sase H, Yuki K, Isogaya K, Saitoh M, Imamura T, Episkopou V, Miyazono K, Miyazawa K (lipiec 2007). „Arkadia indukuje degradację SnoN i c-Ski w celu wzmocnienia sygnalizacji transformującego czynnika wzrostu-beta” . Journal of Biological Chemistry . 282 (28): 20492–501. doi : 10.1074/jbc.M701294200 PMID 17510063 .
Levy L, Howell M, Das D, Harkin S, Episkopou V, Hill CS (wrzesień 2007). „Arkadia aktywuje transkrypcję zależną od Smad3/Smad4, wyzwalając indukowaną sygnałem degradację SnoN” . Biologia molekularna i komórkowa . 27 (17): 6068–83. doi : 10.1128/MCB.00664-07 . PMC 1952153 PMID 17591695 .
