RC-o319

Klasyfikacja wirusa
Rc-o319
(nierankingowe):	Wirus
Królestwo :	Rybowiria
Królestwo:	Orthornavirae
Gromada:	Pisuviricota
Klasa:	Pisoniviricetes
Zamówienie:	Nidowirusy
Rodzina:	Koronawirusy
Rodzaj:	Betakoronawirus
Podrodzaj:	Sarbekowirus
Gatunek:	Koronawirus związany z ciężkim ostrym zespołem oddechowym
Napięcie:	RC-o319

Rc-o319 to wywodzący się z nietoperza szczep wirusa wywołującego ciężki ostry zespół oddechowy, pobrany od podkowców japońskich ( Rinolophus cornutus ) z miejsc w Iwate w Japonii . Ma 81% podobieństwa do SARS-CoV-2 i jest najwcześniejszą gałęzią szczepu koronaawirusa powiązanego z SARS-CoV-2.

Drzewo filogenetyczne oparte na sekwencjach całego genomu SARS-CoV-2 i pokrewnych koronawirusów to:

Koronawirus związany z SARS‑CoV‑2	( Bat ) Rc-o319 , 81% na SARS-CoV-2, Rhinolophus cornutus , Iwate , Japonia Bat SL-ZXC21 , 88% na SARS-CoV-2, Rhinolophus pusillus , Zhoushan , Zhejiang Bat SL-ZC45 , 88% na SARS-CoV-2, Rhinolophus pusillus , Zhoushan, Zhejiang Łuskowiec SARSr-CoV-GX, 85,3% do SARS-CoV-2, Manis javanica , przemycony z Azji Południowo-Wschodniej Łuskowiec SARSr-CoV-GD, 90,1% do SARS-CoV-2 , Manis javanica , przemycony z Azji Południowo-Wschodniej Bat RshSTT182, 92,6% na SARS-CoV-2, Rhinolophus wstydli , Steung Treng , Steung Kambodża Bat RshSTT200, 92,6% na SARS-CoV-2, Rhinolophus shamli , Treng, Kambodża (Bat) RacCS203 , 91,5% na SARS-CoV-2, Rhinolophus acuminatus , Chachoengsao , Tajlandia (Bat) RmYN02 , 93,3% na SARS-CoV-2, Rhinolophus malayanus , Mengla , Yunnan (Bat) RpYN06 , 94,4% na SARS-CoV-2, Rhinolophus pusillus , Xishuangbanna , Yunnan (Bat) RaTG13 , 96,1% na SARS-CoV-2, Rhinolophus affinis , Mojiang , Yunnan (Bat) BANAL-52, 96,8% na SARS-CoV-2, Rhinolophus malayanus , Wientian , Laos SARS-CoV-2
	SARS-CoV-1 , 79% na SARS-CoV-2