Rodzina fagów Actinobacterial holin

Rodzina Actinobacterial Phage Holin (APH) ( TC# 1.E.57 ) to dość duża rodzina białek o długości od 105 do 180 reszt aminoacylowych, typowo wykazująca pojedynczy segment transbłonowy (TMS) w pobliżu N-końca. Reprezentatywną listę białek należących do rodziny APH można znaleźć w Transporter Classification Database .

Jednym z archetypów białek z tej rodziny jest holina Gp5 mykobakteriofaga Ms6. Mykobakteriofag Ms6 to bakteriofag z dwuniciowym DNA (dsDNA) , który oprócz przewidywanego układu lizy endolizyna (LysA)-holina (Gp4), koduje trzy dodatkowe białka w swoim module lizy: Gp1, LysB i Gp5.

Ms6 Gp4 ( TC# 1.E.18.1.2 ) zostało wcześniej opisane jako białko podobne do holiny klasy II. Drugi przypuszczalny gen holinowy ( gp5 ) kodujący białko (Gp5) z przewidywanym pojedynczym N-końcowym TMS zidentyfikowano na końcu operonu litycznego Ms6. Ani przypuszczalna holina klasy II, ani pojedynczy polipeptyd TMS nie mogły wywołać lizy w kombinacjach parami z endolizyną LysA w Escherichia coli . Jednak dalsze badania wykazały, że Gp4 i Gp5 Ms6 oddziałują na siebie. Sugeruje to, że w infekcji Ms6 prawidłowy i zaprogramowany czas lizy jest osiągany przez połączone działanie Gp4 i Gp5.

Zobacz też

• promieniowce
• Holin
• Lizyna
• Baza danych klasyfikacji transporterów

Dalsza lektura

•    Pietrowski, Steve; Seviour, Robert J.; Tillett, Daniel (2011). „Charakterystyka genomu wielowartościowego bakteriofaga litycznego GTE2, który ma potencjał do biokontroli pianek stabilizowanych przez Gordonię, Rhodococcus i Nocardia w osadach czynnych” . Mikrobiologia stosowana i środowiskowa . 77 (12): 3923–3929. doi : 10.1128/AEM.00025-11 . PMC 3131622 . PMID 21498753 .
•    Reddy, Bhaskara L.; Saier Jr, Milton H. (2013). „Analizy topologiczne i filogenetyczne rodzin i nadrodzin bakteryjnych holinów” . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembrany . 1828 (11): 2654–2671. doi : 10.1016/j.bbamem.2013.07.004 . PMC 3788059 . PMID 23856191 .
•    Saier, Milton H.; Reddy, Bhaskara L. (2015). „Holiny u bakterii, eukariontów i archeonów: wielofunkcyjne ksenologie o potencjalnych zastosowaniach biotechnologicznych i biomedycznych” . Journal of Bacteriology . 197 (1): 7–17. doi : 10.1128/JB.02046-14 . PMC 4288690 . PMID 25157079 .
•   Wang, IN; Smith, DL; Młody, R. (2000). „Holins: zegary białkowe infekcji bakteriofagowych”. Roczny przegląd mikrobiologii . 54 : 799-825. doi : 10.1146/annurev.micro.54.1.799 . PMID 11018145 .

Od tej edycji w tym artykule wykorzystano treść z „1.E.57. The Actinobacterial Phage Holin (APH) Family” , która jest objęta licencją umożliwiającą ponowne wykorzystanie na licencji Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License , ale nie na licencji Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License GFDL . _ Należy przestrzegać wszystkich odpowiednich warunków.