Rodzina holinów A2

Domniemana rodzina Archaeal 2 TMS Holin (A2-Hol) ( TC# 9.B.109 ) składa się z kilku przypuszczalnych holin z Nitrososphaerota o wielkości od około 130 do 165 reszt aminoacylowych (aas) i wykazujących 2 segmenty transbłonowe (TMS) ). Reprezentatywną listę białek należących do rodziny A2-Hol można znaleźć w Transporter Classification Database . Archaeon , Candidatus Nitrosoarchaeum limnia , koduje sąsiednie geny oznaczone jako Wydzielanie toksyn/Lysis Holin . Gen „toksyny” koduje rozpuszczalne białko o długości 325 aminokwasów, jak określono jako należące do „nadrodziny glikozylotransferazy typu GBT”. Białko to przywołuje inne glikozylotransferazy w wyszukiwaniu NCBI BLAST. Sąsiadujący gen koduje małe białko o 132 aminokwasach i 2 TMS ( TC# 9.B.109.1.1 ), które może być holinem, w oparciu o jego rozmiar i topologię. To białko ma numer dostępu UniProt S2E3C4 . Paralogi występują w tym samym organizmie (Candidatus Nitrosoarchaeum koreensis ) i innych blisko spokrewnionych gatunkach.

Zobacz też

• Holin
• Lizyna
• Baza danych klasyfikacji transporterów

Dalsza lektura

•      Saier, Milton H.; Reddy, Bhaskara L. (2015-01-01). „Holiny u bakterii, eukariontów i archeonów: wielofunkcyjne ksenologie o potencjalnych zastosowaniach biotechnologicznych i biomedycznych” . Journal of Bacteriology 197 (1): 7–17. doi : 10.1128/JB.02046-14 . ISSN 0021-9193 . PMC 4288690 . PMID 25157079 .
•     Wang, IN; Smith, DL; Młody, R. (2000-01-01). „Holins: zegary białkowe infekcji bakteriofagowych” . Roczny przegląd mikrobiologii 54 : 799–825. doi : 10.1146/annurev.micro.54.1.799 . ISSN 0066-4227 . PMID 11018145 .

Od tej edycji w tym artykule wykorzystano treść z „9.B.109. The Putative Archaeal 2 TMS Holin (A2-Hol) Family” , która jest licencjonowana w sposób umożliwiający ponowne wykorzystanie w ramach licencji Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License , ale nie w ramach GFDL . Należy przestrzegać wszystkich odpowiednich warunków.