RybB RNA
| RybB RNA | |
|---|---|
 Przewidywana struktura drugorzędowa i konserwacja sekwencji RybB
| |
| identyfikatorów | |
| Symbol | RybB |
| Rfam | RF00110 |
| Inne dane | |
| typ RNA | gen ; sRNA |
| Domeny | Bakteria |
| WIĘC | SO: 0000655 |
| Struktury PDB | PDBe |
RybB to mały niekodujący RNA zidentyfikowany na dużym ekranie przesiewowym Escherichia coli . Funkcję tego krótkiego RNA badano stosując podejście transkryptomiczne i analizy kinetyczne rozpadu docelowego mRNA in vivo . RybB zidentyfikowano jako czynnik, który selektywnie przyspiesza rozpad wielu głównych mRNA omp po indukcji odpowiedzi na stres otoczki. Wykazano, że ten RNA wiąże się z białkiem Hfq .
U Salmonelli bezpośrednie interakcje RybB z następującymi celami zostały zweryfikowane eksperymentalnie: STM2391 ( fadL ), STM1070 ( ompA ), STM2267 ( ompC ), STM1572 ( ompD ), STM0999 ( ompF ), STM1473 ( ompN ), STM1995 ( ompS ) , STM1732 ( ompW ), STM0413 ( tsx ), STM0687 ( ybfM , chip ) i STM1530.
W Escherichia coli potwierdzono eksperymentalnie bezpośrednie interakcje RybB z następującymi celami: b0805 ( fiu ), b0721 ( sdhC ), b2215 ( ompC ), b1256 ( ompW ), b2594 ( rluD ) i b0081 ( mraZ ).