15 września

Identyfikatory
SELENOF
	, selenoproteina F,
identyfikatory zewnętrzne SEP15
Lokalizacja genu ( człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Błagam Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS nie dotyczy
Ontologia genów Funkcja molekularna Komponent komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Selenoproteina 15 kDa jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen SEP15 . Dla tego genu znaleziono dwa alternatywne splicingowe warianty transkryptu kodujące różne izoformy .

Funkcjonować

Ten gen koduje selenoproteinę , która zawiera resztę selenocysteiny (Sec) w swoim miejscu aktywnym. Selenocysteina jest kodowana przez kodon UGA , który normalnie sygnalizuje terminację translacji. 3'UTR genów selenoprotein ma wspólną pnia-pętli , sekwencję insercji sec ( SECIS ), która jest niezbędna do rozpoznania UGA jako kodonu Sec, a nie jako sygnału stop. Badania na myszach sugerują, że ta selenoproteina może pełnić redoks i być zaangażowana w kontrolę jakości fałdowanie białek .

Znaczenie kliniczne

Ten gen jest zlokalizowany na chromosomie 1p31, locus genetycznym często mutowanym lub usuwanym w ludzkich nowotworach.

Domena białkowa

Sep15
Struktura rozwiązania SelM z Mus musculus
Identifiers
Symbol	15 września_SelM
Pfam	PF08806
InterPro	IPR014912
Dostępne struktury białek: Pfam   konstrukcje / ECOD   WPB RCSB WPB ; PDBe ; WPBj Suma WPB podsumowanie struktury

Białko kodowane przez ten gen jest często nazywane Sep15 , jednak w przypadku myszy nosi ono nazwę SelM . Białko to jest selenoproteiną występującą tylko u eukariontów . Ta domena ma domenę podobną do tioredoksyny i dostępny na powierzchni motyw redoks miejsca aktywnego . Sugeruje to, że działają one jako izomerazy tiolowo -disiarczkowe zaangażowane w tworzenie wiązań disiarczkowych w retikulum endoplazmatycznym .

Funkcjonować

wyciszono gen SEP15, myszy miały następnie niedobór SEP15 i były w stanie zahamować rozwój raka jelita grubego.

Struktura

Konkretna struktura ma centralną domenę alfa/beta, która w rzeczywistości składa się z trzech helis alfa i mieszanej równoległej/antyrównoległej czteroniciowej beta-kartki .

Dalsza lektura

•   Maruyama K, Sugano S (styczeń 1994). „Oligo-capping: prosta metoda zastąpienia struktury czapeczki eukariotycznych mRNA oligorybonukleotydami”. gen . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
•   Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (październik 1997). „Konstrukcja i charakterystyka biblioteki cDNA wzbogaconej o pełnej długości i wzbogaconej o koniec 5'”. gen . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
•   Gladyshev VN, Jeang KT, Wootton JC, Hatfield DL (kwiecień 1998). „Nowe ludzkie białko zawierające selen. Oczyszczanie, charakteryzacja i sekwencja cDNA” . Journal of Biological Chemistry . 273 (15): 8910–5. doi : 10.1074/jbc.273.15.8910 . PMID 9535873 .
•   Kumaraswamy E, Malykh A, Korotkov KV, Kozyavkin S, Hu Y, Kwon SY, Moustafa ME, Carlson BA, Berry MJ, Lee BJ, Hatfield DL, Diamond AM, Gladyshev VN (listopad 2000). „Zależności struktura-ekspresja genu selenoproteiny 15 kDa. Możliwa rola białka w etiologii raka” . Journal of Biological Chemistry . 275 (45): 35540–7. doi : 10.1074/jbc.M004014200 . PMID 10945981 .
•    Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (marzec 2001). „W kierunku katalogu ludzkich genów i białek: sekwencjonowanie i analiza 500 nowych kompletnych białek kodujących ludzkie cDNA” . Badania genomu . 11 (3): 422–35. doi : 10.1101/gr.GR1547R . PMC 311072 . PMID 11230166 .
•   Korotkov KV, Kumaraswamy E, Zhou Y, Hatfield DL, Gladyshev VN (maj 2001). „Związek między selenoproteiną 15 kDa i UDP-glukozą: glikozylotransferazą glikoproteinową w retikulum endoplazmatycznym komórek ssaków” . Journal of Biological Chemistry . 276 (18): 15330-6. doi : 10.1074/jbc.M009861200 . PMID 11278576 .
•    Kumaraswamy E, Korotkov KV, Diamond AM, Gladyshev VN, Hatfield DL (2002). „Analiza genetyczna i funkcjonalna selenoproteiny Sep15 ssaków”. Czujniki białek i reaktywne formy tlenu - Część A: Selenoproteiny i tioredoksyna . Metody w enzymologii. Tom. 347. s. 187–97. doi : 10.1016/S0076-6879(02)47017-6 . ISBN 978-0-12-182248-4 . PMID 11898406 .
•   Wu HJ, Lin C, Zha YY, Yang JG, Zhang MC, Zhang XY, Liang X, Fu M, Wu M (luty 2003). „[Reakcje redoks z 15 września i jego związek z rozwojem guza]”. AI Zheng = Aizheng = Chiński Dziennik Raka . 22 (2): 119–22. PMID 12600282 .
•    Gevaert K, Goethals M, Martens L, Van Damme J, Staes A, Thomas GR, Vandekerckhove J (maj 2003). „Eksploracja proteomów i analiza przetwarzania białek za pomocą identyfikacji spektrometrii mas posortowanych peptydów N-końcowych”. Biotechnologia przyrody . 21 (5): 566-9. doi : 10.1038/nbt810 . PMID 12665801 . S2CID 23783563 .
•   Apostolou S, Klein JO, Mitsuuchi Y, Shetler JN, Poulikakos PI, Jhanwar SC, Kruger WD, Testa JR (czerwiec 2004). „Hamowanie wzrostu i indukcja apoptozy w komórkach międzybłoniaka przez selen i zależność od genotypu selenoproteiny SEP15” . Onkogen . 23 (29): 5032–40. doi : 10.1038/sj.onc.1207683 . PMID 15107826 .
•    Wellenreuther R, Schupp I, Poustka A, Wiemann S (czerwiec 2004). „Amplifikacja SMART połączona z frakcjonowaniem wielkości cDNA w celu uzyskania dużych klonów pełnej długości” . Genomika BMC . 5 (1): 36. doi : 10.1186/1471-2164-5-36 . PMC436056 . _ PMID 15198809 .