SF3B14

SF3B6
Dostępne konstrukcje WPB Wyszukiwanie ortologów: Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, HSPC175, Ht006, P14, SAP14, SAP14a, SF3B14, SF3B14a, CGI-110, splicing factor 3b podjednostka 6
identyfikatorów zewnętrznych
Lokalizacja genu ( człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Błagam Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS nie dotyczy
Ontologia genów Funkcje molekularne Składnik komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Czynnik splicingowy 3B, podjednostka 14 kDa , znana również jako SF3B14 , jest ludzkim genem .

Funkcjonować

Gen ten koduje podjednostkę białkową 14 kDa kompleksu czynnika splicingowego 3b. Czynnik splicingowy 3b wiąże się zarówno z małymi jądrowymi kompleksami rybonukleoproteinowymi U2, jak i U11 / U12 (U2 snRNP) spliceosomów. To białko o masie 14 kDa oddziałuje bezpośrednio z podjednostką 1 kompleksu czynnika splicingowego 3b. To białko 14 kDa oddziałuje również bezpośrednio z adenozyną, która przeprowadza pierwszy etap transestryfikacji splicingu w miejscu rozgałęzienia pre-mRNA.

Interakcje

Wykazano, że SF3B14 oddziałuje z SF3B1 .

Dalsza lektura

•    Lai CH, Chou CY, Ch'ang LY, Liu CS, Lin W (2000). „Identyfikacja nowych ludzkich genów konserwowanych ewolucyjnie w Caenorhabditis elegans za pomocą proteomiki porównawczej” . Genom Res . 10 (5): 703–13. doi : 10.1101/gr.10.5.703 . PMC 310876 . PMID 10810093 .
•   Hu RM, Han ZG, Song HD, Peng YD, Huang QH, Ren SX, Gu YJ, Huang CH, Li YB, Jiang CL, Fu G, Zhang QH, Gu BW, Dai M, Mao YF, Gao GF, Rong R , Ye M, Zhou J, Xu SH, Gu J, Shi JX, Jin WR, Zhang CK, Wu TM, Huang GY, Chen Z, Chen MD, Chen JL (2000). „Profilowanie ekspresji genów w ludzkiej osi podwzgórze-przysadka-nadnercza i klonowanie pełnej długości cDNA” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 97 (17): 9543–8. Bibcode : 2000PNAS...97.9543H . doi : 10.1073/pnas.160270997 . PMC 16901 .   PMID 10931946 .
•    Zhang QH, Ye M, Wu XY, Ren SX, Zhao M, Zhao CJ, Fu G, Shen Y, Fan HY, Lu G, Zhong M, Xu XR, Han ZG, Zhang JW, Tao J, Huang QH, Zhou J , Hu GX, Gu J, Chen SJ, Chen Z (2000). „Klonowanie i analiza funkcjonalna cDNA z otwartymi ramkami odczytu dla 300 wcześniej niezdefiniowanych genów ulegających ekspresji w hematopoetycznych komórkach macierzystych/progenitorowych CD34+” . Genom Res . 10 (10): 1546–60. doi : 10.1101/gr.140200 . PMC 310934 . PMID 11042152 .
•    Harrington JJ, Sherf B, Rundlett S, Jackson PD, Perry R, ​​Cain S, Leventhal C, Thornton M, Ramachandran R, Whittington J, Lerner L, Costanzo D, McElligott K, Boozer S, Mays R, Smith E, Veloso N , Klika A, Hess J, Cothren K, Lo K, Offenbacher J, Danzig J, Ducar M (2001). „Tworzenie bibliotek ekspresji białek obejmujących cały genom przy użyciu losowej aktywacji ekspresji genów”. Nat. Biotechnologia . 19 (5): 440–5. doi : 10.1038/88107 . PMID 11329013 . S2CID 25064683 .
•    Will CL, Schneider C, MacMillan AM, Katopodis NF, Neubauer G, Wilm M, Lührmann R, Query CC (2001). „Nowe białko snRNP U2 i U11 / U12, które wiąże się z miejscem rozgałęzienia pre-mRNA” . EMBO J. 20 (16): 4536–46. doi : 10.1093/emboj/20.16.4536 . PMC 125580 . PMID 11500380 .
•    Will CL, Urlaub H, Achsel T, Gentzel M, Wilm M, Lührmann R (2002). „Charakterystyka nowych białek SF3b i 17S U2 snRNP, w tym ludzkiego homologu Prp5p i białka SF3b DEAD-box” . EMBO J. 21 (18): 4978–88. doi : 10.1093/emboj/cdf480 . PMC 126279 . PMID 12234937 .
•    Golas MM, Sander B, Will CL, Lührmann R, Stark H (2003). „Architektura molekularna wielobiałkowego czynnika splicingowego SF3b”. nauka . 300 (5621): 980–4. Bibcode : 2003Sci...300..980G . doi : 10.1126/science.1084155 . PMID 12738865 . S2CID 31046270 .
•    Will CL, Schneider C, Hossbach M, Urlaub H, Rauhut R, Elbashir S, Tuschl T, Lührmann R (2004). „Ludzki snRNP 18S U11 / U12 zawiera zestaw nowych białek, których nie ma w spliceosomie zależnym od U2” . RNA . 10 (6): 929–41. doi : 10.1261/rna.7320604 . PMC 1370585 . PMID 15146077 .
•    Rush J, Moritz A, Lee KA, Guo A, Goss VL, Spek EJ, Zhang H, Zha XM, Polakiewicz RD, Comb MJ (2005). „Profilowanie powinowactwa immunologicznego fosforylacji tyrozyny w komórkach nowotworowych”. Nat. Biotechnologia . 23 (1): 94–101. doi : 10.1038/nbt1046 . PMID 15592455 . S2CID 7200157 .
•    Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (2005). „Dynamika proteomu jądrowego”. Natura . 433 (7021): 77–83. Bibcode : 2005Natur.433...77A . doi : 10.1038/natura03207 . PMID 15635413 . S2CID 4344740 .
• Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapowanie na dużą skalę ludzkich interakcji białko-białko za pomocą spektrometrii mas” . Mol. Syst. Biol . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PKW    1847948 . PMID 17353931 .