SMARCE1

Identyfikatory
SMARCE1
	, BAF57, CSS5, związane z SWI/SNF, związane z macierzą, zależny od aktyny regulator chromatyny, podrodzina e, członek 1
Identyfikatory zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Błagam Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS nie dotyczy
Ontologia genów Funkcja molekularna Komponent komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Zależny od aktyny regulator SWI / SNF związany z macierzą podrodziny chromatyny E, członek 1, jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen SMARCE1 .

Funkcjonować

Białko kodowane przez ten gen jest częścią dużego, zależnego od ATP kompleksu przebudowy chromatyny SWI/SNF , który jest wymagany do aktywacji transkrypcji genów normalnie represjonowanych przez chromatynę. Kodowane białko, samo lub w kompleksie SWI/SNF, może wiązać się z 4-kierunkowym złączem DNA, które, jak się uważa, naśladuje topologię DNA, gdy wchodzi lub wychodzi z nukleosomu . Białko zawiera domenę HMG wiążącą DNA, ale przerwanie tej domeny nie znosi aktywności wiązania DNA lub przemieszczania nukleosomów kompleksu SWI/SNF. W przeciwieństwie do większości białek złożonych SWI/SNF, białko to nie ma drożdżowego odpowiednika.

Interakcje

Wykazano, że SMARCE1 oddziałuje z receptorem estrogenowym alfa , SMARCB1 i SMARCA4 .

Dalsza lektura

•   Martens JA, Winston F (kwiecień 2003). „Ostatnie postępy w zrozumieniu przebudowy chromatyny przez kompleksy Swi / Snf”. Aktualna opinia w genetyce i rozwoju . 13 (2): 136–42. doi : 10.1016/S0959-437X(03)00022-4 . PMID 12672490 .
•    Wang W, Côté J, Xue Y, Zhou S, Khavari PA, Biggar SR, Muchardt C, Kalpana GV, Goff SP, Yaniv M, Workman JL, Crabtree GR (październik 1996). „Oczyszczanie i heterogeniczność biochemiczna kompleksu SWI-SNF ssaków” . Dziennik EMBO . 15 (19): 5370–82. doi : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb00921.x . PMC452280 . _ PMID 8895581 .
•    Cho H, Orphanides G, Sun X, Yang XJ, Ogryzko V, Lees E, Nakatani Y, Reinberg D (wrzesień 1998). „Kompleks ludzkiej polimerazy RNA II zawierający czynniki modyfikujące strukturę chromatyny” . Biologia molekularna i komórkowa . 18 (9): 5355–63. doi : 10.1128/MCB.18.9.5355 . PMC 109120 . PMID 9710619 .
•   Phelan ML, Sif S, Narlikar GJ, Kingston RE (luty 1999). „Rekonstytucja kompleksu przebudowy chromatyny rdzenia z podjednostek SWI / SNF” . Komórka molekularna . 3 (2): 247–53. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80315-9 . PMID 10078207 .
•    Xue Y, Canman JC, Lee CS, Nie Z, Yang D, Moreno GT, Young MK, Salmon ED, Wang W (listopad 2000). „Ludzki kompleks przebudowy chromatyny SWI / SNF-B jest spokrewniony z drożdżami rsc i lokalizuje się w kinetochorach mitotycznych chromosomów” . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 97 (24): 13015–20. Bibcode : 2000PNAS...9713015X . doi : 10.1073/pnas.240208597 . PMC27170 . _ PMID 11078522 .
•    Decristofaro MF, Betz BL, Rorie CJ, Reisman DN, Wang W, Weissman BE (styczeń 2001). „Charakterystyka ekspresji białka SWI / SNF w ludzkich liniach komórkowych raka piersi i innych nowotworach”. Journal of Cellular Physiology . 186 (1): 136–45. doi : 10.1002/1097-4652(200101)186:1<136::AID-JCP1010>3.0.CO;2-4 . PMID 11147808 . S2CID 25016283 .
•    Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (wrzesień 2000). „Systematyczna lokalizacja subkomórkowa nowych białek zidentyfikowanych przez sekwencjonowanie cDNA na dużą skalę” . Raporty EMBO . 1 (3): 287–92. doi : 10.1093/embo-reports/kvd058 . PMC 1083732 . PMID 11256614 .
•   Kato H, Tjernberg A, Zhang W, Krutchinsky AN, An W, Takeuchi T, Ohtsuki Y, Sugano S, de Bruijn DR, Chait BT, Roeder RG (luty 2002). „SYT łączy się z ludzkimi kompleksami SNF / SWI i C-końcowym regionem jego partnera fuzyjnego SSX1, celując w histony” . Journal of Biological Chemistry . 277 (7): 5498–505. doi : 10.1074/jbc.M108702200 . PMID 11734557 .
•    Chi TH, Wan M, Zhao K, Taniuchi I, Chen L, Littman DR, Crabtree GR (lipiec 2002). „Wzajemna regulacja ekspresji CD4 / CD8 przez kompleksy BAF podobne do SWI / SNF”. Natura . 418 (6894): 195-9. doi : 10.1038/natura00876 . PMID 12110891 . S2CID 4406140 .
•    Belandia B, Orford RL, Hurst HC, Parker MG (sierpień 2002). „Kierowanie kompleksów przebudowy chromatyny SWI / SNF na geny reagujące na estrogen” . Dziennik EMBO . 21 (15): 4094–103. doi : 10.1093/emboj/cdf412 . PMC 126156 . PMID 12145209 .
•   Battaglioli E, Andrés ME, Rose DW, Chenoweth JG, Rosenfeld MG, Anderson ME, Mandel G (październik 2002). „Represja REST genów neuronalnych wymaga składników kompleksu hSWI.SNF” . Journal of Biological Chemistry . 277 (43): 41038–45. doi : 10.1074/jbc.M205691200 . PMID 12192000 .
•   Baker KM, Wei G, Schaffner AE, Ostrowski MC (maj 2003). „Ets-2 i składniki ssaków SWI / SNF tworzą kompleks represora, który negatywnie reguluje promotor BRCA1” . Journal of Biological Chemistry . 278 (20): 17876–84. doi : 10.1074/jbc.M209480200 . PMID 12637547 .
•   Kitagawa H, Fujiki R, Yoshimura K, Mezaki Y, Uematsu Y, Matsui D, Ogawa S, Unno K, Okubo M, Tokita A, Nakagawa T, Ito T, Ishimi Y, Nagasawa H, Matsumoto T, Yanagisawa J, Kato S (czerwiec 2003). „Kompleks przebudowy chromatyny WINAC kieruje receptor jądrowy do promotorów i jest upośledzony w zespole Williamsa” . komórka . 113 (7): 905–17. doi : 10.1016/S0092-8674(03)00436-7 . PMID 12837248 .
•    Hsiao PW, Frytkownica CJ, Trotter KW, Wang W, Archer TK (wrzesień 2003). „BAF60a pośredniczy w krytycznych interakcjach między receptorami jądrowymi a kompleksem przebudowy chromatyny BRG1 w celu transaktywacji” . Biologia molekularna i komórkowa . 23 (17): 6210–20. doi : 10.1128/MCB.23.17.6210-6220.2003 . PMC 180928 . PMID 12917342 .
•   Wu K, Bottazzi ME, de la Fuente C, Deng L, Gitlin SD, Maddukuri A, Dadgar S, Li H, Vertes A, Pumfery A, Kashanchi F (styczeń 2004). „Profil białkowy kompleksów związanych z podatkami” . Journal of Biological Chemistry . 279 (1): 495–508. doi : 10.1074/jbc.M310069200 . PMID 14530271 .
•   Millar JK, Christie S, Porteous DJ (listopad 2003). „Ekrany z dwiema hybrydami drożdży implikują DISC1 w rozwoju i funkcjonowaniu mózgu” . Komunikaty dotyczące badań biochemicznych i biofizycznych . 311 (4): 1019–25. doi : 10.1016/j.bbrc.2003.10.101 . PMID 14623284 .