Gen kodujący białko u gatunku Homo sapiens
SRRM1
Dostępne konstrukcje
WPB Wyszukiwanie Human UniProt:
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
, 160-KD, POP101, SRM160, powtarzalna macierz seryny i argininy 1
Identyfikatory zewnętrzne
Wikidane
Seryna/arginina powtarzalne białko macierzy 1 jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen SRRM1 .
Interakcje
Wykazano, że SRRM1 oddziałuje z CDC5L .
Dalsza lektura
Wang HY, Lin W, Dyck JA, Yeakley JM, Songyang Z, Cantley LC, Fu XD (1998). „SRPK2: różnie eksprymowana kinaza specyficzna dla białka SR zaangażowana w pośredniczenie w interakcji i lokalizacji czynników splicingowych pre-mRNA w komórkach ssaków” . J. Cell Biol . 140 (4): 737–50. doi : 10.1083/jcb.140.4.737 . PMC 2141757 PMID 9472028 .
Wilson KF, Fortes P, Singh US, Ohno M, Mattaj IW, Cerione RA (1999). „Kompleks wiążący czapeczkę jądrową jest nowym celem transdukcji sygnału sprzężonej z receptorem czynnika wzrostu” . J. Biol. chemia . 274 (7): 4166–73. doi : 10.1074/jbc.274.7.4166 PMID 9933612 .
Eldridge AG, Li Y, Sharp PA, Blencowe BJ (1999). „Koaktywator splicingu SRm160 / 300 jest wymagany do funkcji wzmacniacza eksonu” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 96 (11): 6125–30. Bibcode : 1999PNAS...96.6125E . doi : 10.1073/pnas.96.11.6125 PMC26846 . _ PMID 10339552 .
Blencowe BJ, Baurén G, Eldridge AG, Issner R, Nickerson JA, Rosonina E, Sharp PA (2000). „Podjednostki koaktywatora splicingu SRm160 / 300” . RNA . 6 (1): 111–20. doi : 10.1017/S1355838200991982 . PMC 1369899 PMID 10668804 .
Le Hir H, Moore MJ, Maquat LE (2000). „Składanie pre-mRNA zmienia skład mRNP: dowód na stabilne połączenie białek na połączeniach ekson-ekson” . Geny Dev . 14 (9): 1098–108. doi : 10.1101/gad.14.9.1098 . PMC 316578 PMID 10809668 .
McGarvey T, Rosonina E, McCracken S, Li Q, Arnaout R, Mientjes E, Nickerson JA, Awrey D, Greenblatt J, Grosveld G, Blencowe BJ (2000). „Białko związane z ostrą białaczką szpikową, DEK, tworzy zależną od splicingu interakcję z kompleksami ekson-produkt” . J. Cell Biol . 150 (2): 309–20. doi : 10.1083/jcb.150.2.309 . PMC 2180225 PMID 10908574 .
Le Hir H, Izaurralde E, Maquat LE, Moore MJ (2000). „Spliceosom osadza wiele białek 20-24 nukleotydów w górę od połączeń ekson-ekson mRNA” . EMBO J. 19 (24): 6860–9. doi : 10.1093/emboj/19.24.6860 . PMC 305905 PMID 11118221 .
Lykke-Andersen J, Shu MD, Steitz JA (2001). „Komunikacja pozycji połączeń ekson-ekson do maszynerii nadzoru mRNA przez białko RNPS1”. nauka . 293 (5536): 1836–9. Bibcode : 2001Sci...293.1836L . doi : 10.1126/science.1062786 . PMID 11546874 . S2CID 389385 .
McCracken S, Lambermon M, Blencowe BJ (2002). „Koaktywator splicingu SRm160 promuje rozszczepianie transkryptu na 3'-końcu” . Mol. Komórka. Biol . 22 (1): 148–60. doi : 10.1128/MCB.22.1.148-160.2002 . PMC 134228 PMID 11739730 .
Szymczyna BR, Pineda-Lucena A, Mills JL, Szyperski T, Arrowsmith CH (2002). „Przypisania rezonansowe 1H, 13C i 15N oraz drugorzędowa struktura domeny PWI z SRm160 przy użyciu NMR o zmniejszonej wymiarowości”. J. Biomol. NMR . 22 (3): 299–300. doi : 10.1023/A:1014904502424 . PMID 11991360 . S2CID 13594831 .
Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR, Grigorieff N, Moore MJ (2002). „Oczyszczanie i charakteryzacja natywnych spliceosomów nadających się do trójwymiarowej analizy strukturalnej” . RNA . 8 (4): 426–39. doi : 10.1017/S1355838202021088 . PMC 1370266 PMID 11991638 .
Lejeune F, Ishigaki Y, Li X, Maquat LE (2002). „Kompleks połączenia eksonu jest wykrywany na mRNA związanym z CBP80, ale nie z eIF4E w komórkach ssaków: dynamika przebudowy mRNP” . EMBO J. 21 (13): 3536–45. doi : 10.1093/emboj/cdf345 . PMC 126094 PMID 12093754 .
Meissner M, Lopato S, Gotzmann J, Sauermann G, Barta A (2003). „Protoonkoproteina TLS / FUS jest związana z macierzą jądrową i skompleksowana z czynnikami splicingowymi PTB, SRm160 i białkami SR”. Do potęgi. Rozdz . komórki 283 (2): 184–95. doi : 10.1016/S0014-4827(02)00046-0 . PMID 12581738 .
Szymczyna BR, Bowman J, McCracken S, Pineda-Lucena A, Lu Y, Cox B, Lambermon M, Graveley BR, Arrowsmith CH, Blencowe BJ (2003). „Struktura i funkcja motywu PWI: nowa domena wiążąca kwas nukleinowy, która ułatwia przetwarzanie pre-mRNA” . Geny Dev . 17 (4): 461–75. doi : 10.1101/gad.1060403 . PMC 196000 PMID 12600940 .
Wagner S, Chiosea S, Nickerson JA (2003). „Domeny kierowania przestrzennego i wiążące macierz jądrową SRm160” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 100 (6): 3269–74. Bibcode : 2003PNAS..100.3269W . doi : 10.1073/pnas.0438055100 PMC 152281 PMID 12624182 .
McCracken S, Longman D, Johnstone IL, Cáceres JF, Blencowe BJ (2003). „Ewolucyjnie zachowana rola SRm160 w przetwarzaniu 3'-końca, która działa niezależnie od tworzenia kompleksu złącza egzonowego” . J. Biol. chemia . 278 (45): 44153–60. doi : 10.1074/jbc.M306856200 PMID 12944400 .
Wagner S, Chiosea S, Ivshina M, Nickerson JA (2004). „In vitro FRAP ujawnia zależną od ATP mobilizację jądrową białka kompleksu połączeń egzonowych SRm160” . J. Cell Biol . 164 (6): 843–50. doi : 10.1083/jcb.200307002 . PMC 2172284 PMID 15024032 .
Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB, Mukherji M, Stettler-Gill M, Peters EC (2004). „Solidne profilowanie fosfoproteomiczne miejsc fosforylacji tyrozyny z ludzkich limfocytów T przy użyciu chromatografii powinowactwa z unieruchomionym metalem i tandemowej spektrometrii mas”. Analny. chemia . 76 (10): 2763–72. doi : 10.1021/ac035352d . PMID 15144186 .
Linki zewnętrzne
Galeria PDB
1mp1 : Struktura rozwiązania motywu PWI z SRm160
